31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0169 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2728  transposase IS5 family protein  100 
 
 		 825 bp  1495    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.264364  normal  0.61764 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0169    100 
 
 		 2186 bp  4333    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.645722  decreased coverage  0.00366507 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0933    100 
 
 		 3322 bp  1495    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.128492 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0935  transposase IS5 family protein  100 
 
 		 825 bp  1495    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.799188  normal  0.508265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1749  transposase IS5 family protein  99.73 
 
 		 825 bp  1479    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1755  transposase IS5 family protein  100 
 
 		 825 bp  1495    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0831197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1766  transposase IS5 family protein  99.87 
 
 		 825 bp  1487    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0743046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1783  transposase IS5 family protein  99.87 
 
 		 825 bp  1487    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1794  transposase IS5 family protein  99.87 
 
 		 825 bp  1487    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0951166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2695  transposase IS5 family protein  100 
 
 		 825 bp  1495    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2712  transposase IS5 family protein  100 
 
 		 825 bp  1495    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.678901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3788  transposase, IS4  79.9 
 
 		 798 bp  228  4.9999999999999996e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0999364  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3010    78.03 
 
 		 825 bp  163  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1759  Resolvase domain  100 
 
 		 756 bp  161  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.621745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2998  transposase, IS4  78.33 
 
 		 798 bp  161  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.60831  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4119  transposase (IS12528)  81.18 
 
 		 477 bp  151  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3075  transposase, IS4  77.63 
 
 		 813 bp  147  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8284    81.08 
 
 		 564 bp  109  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1332  ISRSO1-transposase protein  90.36 
 
 		 825 bp  101  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1302  ISRSO1-transposase protein  90.36 
 
 		 825 bp  101  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0127  ISRSO1 transposase protein  90.36 
 
 		 825 bp  101  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00111919  normal  0.542312 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3351  transposase  90.36 
 
 		 825 bp  101  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0208  ISRSO1-transposase protein  90.36 
 
 		 825 bp  101  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1009  ISRSO1-transposase protein  91.89 
 
 		 825 bp  99.6  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11795  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3221  transposase  88.17 
 
 		 843 bp  97.6  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000851994 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4117  transposase, IS4  78.44 
 
 		 438 bp  91.7  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2845    85.58 
 
 		 932 bp  87.7  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294957  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3199  transposase  87.95 
 
 		 825 bp  85.7  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0486502 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0908    80.24 
 
 		 432 bp  69.9  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.828135  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1210    84.93 
 
 		 486 bp  58  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4331    85.48 
 
 		 243 bp  52  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>