More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0093 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0093  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 		 377 aa  764    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0904257  normal  0.209158 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2012  Ppx/GppA phosphatase  54.74 
 
 		 364 aa  333  4e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3811  Ppx/GppA phosphatase  44.41 
 
 		 504 aa  280  3e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000504204  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0641  Ppx/GppA family phosphatase  46.73 
 
 		 498 aa  280  3e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0251449  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0685  Ppx/GppA family phosphatase  46.32 
 
 		 498 aa  279  7e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2210  Ppx/GppA phosphatase  43.27 
 
 		 375 aa  278  1e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0781544  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1166  Ppx/GppA phosphatase  46.35 
 
 		 446 aa  273  4.0000000000000004e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0888  exopolyphosphatase  47.38 
 
 		 603 aa  267  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00574973  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0427  Ppx/GppA phosphatase  45.91 
 
 		 520 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0472  Ppx/GppA phosphatase  46.91 
 
 		 433 aa  262  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0471  Ppx/GppA phosphatase  46.73 
 
 		 413 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1170  Ppx/GppA phosphatase  44.48 
 
 		 373 aa  255  8e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.854732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0246  Ppx/GppA phosphatase  42.27 
 
 		 399 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.944048  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0372  Ppx/GppA phosphatase  46.65 
 
 		 509 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1516  Ppx/GppA phosphatase  45.2 
 
 		 376 aa  252  9.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219937  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3629  Ppx/GppA phosphatase  43.15 
 
 		 380 aa  250  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal  0.0833507 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0836  Ppx/GppA phosphatase  45.17 
 
 		 441 aa  251  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3596  Ppx/GppA phosphatase  44 
 
 		 357 aa  249  5e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137051  normal  0.0418911 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1927  Ppx/GppA phosphatase  44.91 
 
 		 378 aa  248  9e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3742  Ppx/GppA phosphatase  43.48 
 
 		 375 aa  248  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2550  Ppx/GppA phosphatase  44.17 
 
 		 331 aa  248  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2151  Ppx/GppA phosphatase  44.31 
 
 		 355 aa  247  3e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3433  Ppx/GppA phosphatase  43.48 
 
 		 375 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.513976 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1183  Ppx/GppA phosphatase  40.88 
 
 		 370 aa  245  6.999999999999999e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0142  Ppx/GppA phosphatase  44.51 
 
 		 360 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279399  normal  0.170586 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2753  Ppx/GppA phosphatase  46.11 
 
 		 363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363903  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0659  Ppx/GppA phosphatase  44.27 
 
 		 367 aa  243  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1331  Ppx/GppA phosphatase  44.38 
 
 		 389 aa  243  5e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3082  Ppx/GppA phosphatase  41.18 
 
 		 366 aa  242  6e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417724  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0473  Ppx/GppA phosphatase  43.2 
 
 		 435 aa  242  7e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2489  Ppx/GppA phosphatase  40.39 
 
 		 355 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.552862  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1413  Ppx/GppA phosphatase  41 
 
 		 378 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.899781  normal  0.999952 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1031  Ppx/GppA phosphatase  40.41 
 
 		 378 aa  236  6e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2771  putative exopolyphosphatase  41 
 
 		 378 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.571811  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4719  Ppx/GppA phosphatase  43.47 
 
 		 355 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0584151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3197  Ppx/GppA phosphatase  41.99 
 
 		 358 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.366219  normal  0.365881 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1980  Ppx/GppA phosphatase  37.64 
 
 		 393 aa  228  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.307298 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1673  phosphatase  37.64 
 
 		 393 aa  226  4e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.131499  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2258  Ppx/GppA phosphatase  42.59 
 
 		 325 aa  225  8e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.613366 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3989  Ppx/GppA phosphatase  39.71 
 
 		 374 aa  223  6e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0810  Ppx/GppA phosphatase  27.78 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.11092  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  28.7 
 
 		 513 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1573  Ppx/GppA phosphatase  33.75 
 
 		 505 aa  113  5e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0238  Ppx/GppA phosphatase  24.92 
 
 		 300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.218725  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  27.38 
 
 		 513 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1566  polyPpx/GppA family phosphatase  26.96 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000258002  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1994  Ppx/GppA phosphatase  28.89 
 
 		 510 aa  109  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431495 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0972  Ppx/GppA phosphatase  29.81 
 
 		 520 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2233  Ppx/GppA phosphatase  28.89 
 
 		 511 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1955  Ppx/GppA phosphatase  31.29 
 
 		 523 aa  107  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0123  Ppx/GppA phosphatase  27.36 
 
 		 296 aa  106  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0880  Ppx/GppA phosphatase  29.91 
 
 		 513 aa  106  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000414352 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0592  Ppx/GppA phosphatase  29.25 
 
 		 519 aa  104  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00540  Exopolyphosphatase  26.1 
 
 		 305 aa  103  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000336687  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2990  Ppx/GppA phosphatase  30.81 
 
 		 519 aa  103  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1779  Ppx/GppA phosphatase  30.89 
 
 		 311 aa  103  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.863936  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0226  Ppx/GppA phosphatase  29.02 
 
 		 326 aa  102  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000460775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0423  exopolyphosphatase, putative  27.5 
 
 		 519 aa  102  8e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0329  Ppx/GppA phosphatase  31.45 
 
 		 303 aa  102  9e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0090  Ppx/GppA phosphatase  30.06 
 
 		 288 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1243  Ppx/GppA phosphatase  28.53 
 
 		 501 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.085362 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2137  Ppx/GppA phosphatase  31.87 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00893545  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2154  Ppx/GppA phosphatase  33.01 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2105  Ppx/GppA phosphatase  28.7 
 
 		 497 aa  101  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000081594  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  30.19 
 
 		 500 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0278  Ppx/GppA phosphatase  29.39 
 
 		 501 aa  100  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00854606  normal  0.782575 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1739  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  27.36 
 
 		 532 aa  99.8  7e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22047  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0132  Ppx/GppA phosphatase  29.35 
 
 		 311 aa  99.8  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2062  Ppx/GppA phosphatase  32.17 
 
 		 300 aa  99.4  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  29.25 
 
 		 500 aa  99.4  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1033  Ppx/GppA phosphatase  29.22 
 
 		 505 aa  99  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35316  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8578  Ppx/GppA phosphatase  30.09 
 
 		 319 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.297052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5209  Ppx/GppA phosphatase  31.55 
 
 		 310 aa  99  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2062  Ppx/GppA phosphatase  30 
 
 		 303 aa  98.6  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3616  Ppx/GppA phosphatase  29.87 
 
 		 526 aa  97.1  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000501756 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1993  Ppx/GppA phosphatase  27.91 
 
 		 519 aa  97.1  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0623  exopolyphosphatase  28.44 
 
 		 545 aa  97.1  5e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.797716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32210  Ppx/GppA phosphatase  30.46 
 
 		 318 aa  97.1  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0912  Ppx/GppA phosphatase  31.49 
 
 		 330 aa  96.7  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.694762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0404  Ppx/GppA phosphatase  29.54 
 
 		 505 aa  96.7  6e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1789  putative exopolyphosphatase  26.23 
 
 		 544 aa  96.3  7e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.810374  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4014  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  30.42 
 
 		 498 aa  96.7  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1022  Ppx/GppA phosphatase  29.66 
 
 		 319 aa  95.9  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45924  normal  0.0505831 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0474  Ppx/GppA phosphatase  29.09 
 
 		 508 aa  95.9  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05121  putative exopolyphosphatase  26.23 
 
 		 544 aa  96.3  9e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.434231 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0162  exopolyphosphatase  28.17 
 
 		 508 aa  95.9  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000221963 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0667  Ppx/GppA phosphatase family protein  28.85 
 
 		 568 aa  95.9  1e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04581  putative exopolyphosphatase  27.81 
 
 		 539 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0501  Ppx/GppA phosphatase  25.94 
 
 		 519 aa  95.5  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0154  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  29.01 
 
 		 500 aa  95.1  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0177  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  27.02 
 
 		 498 aa  94.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0508  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  27.02 
 
 		 498 aa  94.7  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.577686  normal  0.0821648 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4037  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  27.02 
 
 		 498 aa  94.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.868911  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0201  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  27.95 
 
 		 498 aa  94.4  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0697  Ppx/GppA phosphatase  25 
 
 		 301 aa  94  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153349  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2673  exopolyphosphatase  27.16 
 
 		 509 aa  94  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4617  Ppx/GppA phosphatase  28.62 
 
 		 502 aa  93.6  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2740  exopolyphosphatase  25.93 
 
 		 526 aa  93.6  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.778881 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2698  exopolyphosphatase  25.93 
 
 		 526 aa  93.6  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2762  exopolyphosphatase  25.93 
 
 		 513 aa  93.6  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.708148  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>