211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0086 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0086  hemolysin A  100 
 
 
246 aa  489  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.162277  normal  0.205136 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2620  hemolysin A  68.03 
 
 
264 aa  325  3e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4468  hemolysin A  65.84 
 
 
252 aa  317  9e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660096  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0042  hemolysin A  64.46 
 
 
246 aa  304  7e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0545179  normal  0.765072 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2669  hemolysin A  62.96 
 
 
251 aa  292  4e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.116474  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2652  hemolysin A  59.59 
 
 
247 aa  271  9e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0532762  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1419  hemolysin A  55.13 
 
 
240 aa  255  5e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1058  rRNA methylase  57.08 
 
 
252 aa  250  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00176712  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1289  hemolysin A  48.97 
 
 
269 aa  248  8e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.403831  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2072  hemolysin A  47.95 
 
 
271 aa  241  7.999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.759279  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1786  hemolysin A  47.95 
 
 
271 aa  241  7.999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.465576  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2037  hemolysin A  53.25 
 
 
250 aa  241  9e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00330226  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1541  hemolysin A  47.52 
 
 
266 aa  240  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1580  hemolysin A  52.44 
 
 
257 aa  240  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2654  hemolysin A  52.44 
 
 
257 aa  239  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2704  hemolysin A  53.88 
 
 
249 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0252  hemolysin A  52.03 
 
 
282 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0782  hemolysin A  51.44 
 
 
247 aa  236  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.705494  normal  0.486416 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1222  hemolysin A  57.14 
 
 
260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000687315 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1510  hemolysin A  52.92 
 
 
271 aa  234  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  53.14 
 
 
367 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1825  hemolysin A  50.63 
 
 
242 aa  231  7.000000000000001e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0615885  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1047  hemolysin A  52.5 
 
 
251 aa  231  1e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.940085  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2477  putative rRNA methylase  50.41 
 
 
245 aa  230  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.382282  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2318  hemolysin A  48.37 
 
 
277 aa  229  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3487  hemolysin A  47.33 
 
 
269 aa  228  5e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000887252  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2510  hemolysin A  45.87 
 
 
266 aa  228  6e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000179539  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0556  hemolysin A  54.03 
 
 
272 aa  226  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6777  hemolysin A  51.04 
 
 
282 aa  226  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0893  hemolysin A  46.94 
 
 
268 aa  226  2e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00179005  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0901  hemolysin A  48.75 
 
 
269 aa  226  4e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000212028  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2869  hemolysin A  46.89 
 
 
279 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0361209  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0318  hemolysin A  54.51 
 
 
264 aa  224  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.996063 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4306  hemolysin A  46.86 
 
 
279 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000462381  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4080  hemolysin A  46.86 
 
 
279 aa  222  6e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000457386  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3929  hemolysin A  46.86 
 
 
279 aa  222  6e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000268336  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4399  hemolysin A  46.86 
 
 
279 aa  222  6e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000782309  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4196  hemolysin A  46.86 
 
 
279 aa  222  6e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.6643e-39 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1216  hemolysin A  47.95 
 
 
267 aa  221  8e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000350473  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1239  hemolysin A  47.95 
 
 
267 aa  221  8e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0904508  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3918  hemolysin A  46.86 
 
 
279 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4028  hemolysin A  45.64 
 
 
279 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000205737  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4248  hemolysin A  46.44 
 
 
279 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000872961  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0948  hemolysin A  45.64 
 
 
279 aa  218  6e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000087786  decreased coverage  0.0000013909 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4286  hemolysin A  45.64 
 
 
279 aa  218  6e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000449467  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0827  hemolysin A  44.13 
 
 
270 aa  218  6e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1899  hemolysin A  47.08 
 
 
270 aa  217  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000632481  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0561  hemolysin A  47.93 
 
 
248 aa  217  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.613541 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3862  hemolysin A  54.47 
 
 
267 aa  217  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.199718 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06540  hemolysin A  44.86 
 
 
272 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000376214  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1028  hemolysin A  48.76 
 
 
274 aa  215  5.9999999999999996e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1397  hemolysin A  50.83 
 
 
276 aa  215  7e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1813  hemolysin A  49.79 
 
 
256 aa  214  7e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.841717 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4311  hemolysin A  53.72 
 
 
250 aa  214  8e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0672112  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4680  hemolysin A  53.31 
 
 
250 aa  214  9e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.640566  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0736  hemolysin A  46.53 
 
 
252 aa  214  9e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1693  hemolysin A  46.84 
 
 
276 aa  214  9e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256356  hitchhiker  0.00423085 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1079  hemolysin A  46.25 
 
 
268 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241342  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0718  hemolysin A  52.07 
 
 
255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1661  hemolysin A  50.63 
 
 
252 aa  211  5.999999999999999e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0132682  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2834  hemolysin A  53.88 
 
 
250 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1147  hemolysin A  48.36 
 
 
246 aa  211  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1420  hemolysin A  53.67 
 
 
227 aa  209  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581192  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0444  hemolysin A  46.69 
 
 
253 aa  209  3e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4307  hemolysin A  49.59 
 
 
246 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.388226 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0755  rRNA methylase  44.94 
 
 
270 aa  209  4e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000457361  hitchhiker  0.0000277654 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2583  hemolysin A  47.06 
 
 
269 aa  209  4e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.175728 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0491  hemolysin A  48.13 
 
 
251 aa  208  5e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191939  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1456  hemolysin A  47.15 
 
 
248 aa  208  7e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1772  hemolysin A  48.54 
 
 
279 aa  206  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16680  hemolysin A  47.08 
 
 
267 aa  207  2e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.252362 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0956  hemolysin A  47.88 
 
 
277 aa  206  4e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1098  hemolysin A  52.24 
 
 
246 aa  205  5e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1926  hemolysin A  48.79 
 
 
267 aa  204  7e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.645328  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0548  hemolysin A  45.45 
 
 
253 aa  204  8e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1137  hemolysin A  53.91 
 
 
252 aa  204  9e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00595243 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0604  hemolysin A  49.58 
 
 
248 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.30581  normal  0.619961 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2371  hemolysin A  48.57 
 
 
258 aa  204  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.114514 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2875  hemolysin A  47.2 
 
 
248 aa  203  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0777  hemolysin A  50.82 
 
 
251 aa  202  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.850156  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1045  hemolysin A  45.2 
 
 
252 aa  202  5e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.285224  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0935  hemolysin A  42.56 
 
 
264 aa  201  7e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0437  hemolysin A  47.11 
 
 
253 aa  201  9e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1601  rRNA methylase  42.11 
 
 
278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4828  hemolysin A  52.07 
 
 
249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.596006 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1180  hemolysin A  43.5 
 
 
273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000850767  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1455  hemolysin A  48.32 
 
 
265 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0732885  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0928  hypothetical protein  43.55 
 
 
268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1020  hemolysin A  46.69 
 
 
246 aa  198  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0583  hypothetical protein  42.86 
 
 
270 aa  199  5e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1181  hemolysin, putative  44.21 
 
 
288 aa  198  6e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0421011  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0499  hemolysin A  41.7 
 
 
275 aa  198  7e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.298305  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0992  hemolysin A  44.49 
 
 
263 aa  197  9e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0632  hemolysin A  51.03 
 
 
251 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0985618  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1247  hemolysin A  46.09 
 
 
267 aa  196  3e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.68471 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3290  hemolysin A  48.37 
 
 
269 aa  195  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3509  hemolysin A  47.74 
 
 
268 aa  194  7e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0906767 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3820  hemolysin A  53.33 
 
 
263 aa  194  9e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581987  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4461  hemolysin A  49.17 
 
 
246 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4511  hemolysin A  46.77 
 
 
272 aa  193  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>