213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0075 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0075  fatty acid hydroxylase  100 
 
 		 324 aa  657    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145627 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2845  sterol desaturase-like protein  60.14 
 
 		 308 aa  387  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0001  hypothetical protein  50.7 
 
 		 297 aa  299  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840453 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5924  sterol desaturase-like  40.51 
 
 		 324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2153  sterol desaturase-like protein  40.51 
 
 		 324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135202  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2171  fatty acid hydroxylase  39.87 
 
 		 324 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.689731 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5462  sterol desaturase-like  39.55 
 
 		 324 aa  229  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2066  hypothetical protein  38.71 
 
 		 331 aa  229  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2257  hypothetical protein  39.31 
 
 		 329 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3063  hypothetical protein  39.31 
 
 		 329 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00223094  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1528  hypothetical protein  39.31 
 
 		 329 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0526335  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2774  hypothetical protein  39.31 
 
 		 329 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2619  fatty acid hydroxylase  38.83 
 
 		 332 aa  227  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.010312  normal  0.695137 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2639  hypothetical protein  39.31 
 
 		 329 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2695  hypothetical protein  39.31 
 
 		 329 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231759  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1118  fatty acid hydroxylase  38.46 
 
 		 325 aa  226  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.325858  normal  0.912027 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1840  hypothetical protein  40.26 
 
 		 329 aa  226  4e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194533  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2190  sterol desaturase-like protein  38.77 
 
 		 324 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2063  fatty acid hydroxylase  38.46 
 
 		 324 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1517  hypothetical protein  39.67 
 
 		 332 aa  225  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.012017  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1629  fatty acid hydroxylase  40.68 
 
 		 324 aa  225  9e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0812703  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1485  fatty acid hydroxylase  38.59 
 
 		 327 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1174  fatty acid hydroxylase  39.3 
 
 		 324 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1082  fatty acid hydroxylase  38.22 
 
 		 324 aa  205  7e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853948  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1254  hypothetical protein  38.46 
 
 		 324 aa  205  9e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.757696  normal  0.605 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1439  hypothetical protein  37.62 
 
 		 328 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2062  transmembrane protein  37.81 
 
 		 324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1804  hypothetical protein  36.77 
 
 		 320 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000255396 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3157  hypothetical protein  36.92 
 
 		 331 aa  192  6e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5005  fatty acid hydroxylase  36.25 
 
 		 326 aa  188  9e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2783  hypothetical protein  36.04 
 
 		 321 aa  187  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292274 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1258  putative transmembrane protein  36.58 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.205212  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1186  hypothetical protein  38.14 
 
 		 332 aa  181  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.502028 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2079  hypothetical protein  37.14 
 
 		 324 aa  181  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.768511  normal  0.410732 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1106  fatty acid hydroxylase  37.82 
 
 		 332 aa  180  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2296  fatty acid hydroxylase  38.87 
 
 		 374 aa  155  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152596 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  32.67 
 
 		 267 aa  79.7  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  25.25 
 
 		 321 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  29.75 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  29.94 
 
 		 272 aa  71.6  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  30.5 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  30.26 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7771  fatty acid hydroxylase  28.81 
 
 		 284 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  31.29 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  31.34 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  32.84 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  31.11 
 
 		 272 aa  67  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  27.73 
 
 		 413 aa  67  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  25.9 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  31.94 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  27.88 
 
 		 282 aa  67  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  27.56 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  30.56 
 
 		 259 aa  65.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  27.38 
 
 		 281 aa  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  29.87 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  26.64 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  28.57 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  30.69 
 
 		 597 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4418  fatty acid hydroxylase  30.77 
 
 		 374 aa  64.3  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  31.75 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  30.66 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1644  fatty acid hydroxylase  29 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5310  fatty acid hydroxylase  23.39 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000145361  normal  0.160912 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4137  fatty acid hydroxylase  30.77 
 
 		 374 aa  64.3  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  27.24 
 
 		 597 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4620  fatty acid hydroxylase  26.75 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  31.65 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  31.65 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  26.8 
 
 		 376 aa  62.8  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  26.52 
 
 		 373 aa  62.8  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  26.52 
 
 		 374 aa  62.4  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  26.52 
 
 		 373 aa  62.4  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3509  sterol desaturase-like protein  25.34 
 
 		 426 aa  62.4  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5219  hypothetical protein  33.33 
 
 		 431 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  24.21 
 
 		 267 aa  62  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  26.52 
 
 		 301 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5280  fatty acid hydroxylase  32.58 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5128  sterol desaturase-like protein  33.33 
 
 		 431 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0827  fatty acid hydroxylase  31.41 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  30.41 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  27.11 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  25.89 
 
 		 626 aa  60.8  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2864  fatty acid hydroxylase  28.9 
 
 		 377 aa  60.1  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  30.26 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0212  hypothetical protein  26.72 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2318  hypothetical protein  29.82 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  28.12 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  27.27 
 
 		 386 aa  58.9  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  30.37 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4648  sterol desaturase-like protein  25.32 
 
 		 356 aa  58.9  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  28.06 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  30.67 
 
 		 402 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1331  fatty acid hydroxylase  27.07 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  30 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  31.16 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2023  sterol desaturase-like protein  34.29 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  30.63 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  30.63 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3108  fatty acid hydroxylase  30.52 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0297  sterol desaturase-like protein  31.82 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>