17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0073 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0073    100 
 
 		 1669 bp  3309    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363097 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0511  TPR domain-containing protein  92.31 
 
 		 1530 bp  54  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.893562  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0645  TPR repeat-containing protein  92.31 
 
 		 1530 bp  54  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1592  TPR repeat-containing protein  92.31 
 
 		 1530 bp  54  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0865529  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1567  TPR repeat-containing protein  92.31 
 
 		 1530 bp  54  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.085115  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0842  TPR domain-containing protein  92.31 
 
 		 1530 bp  54  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1363  TPR domain-containing protein  92.31 
 
 		 1530 bp  54  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.134471  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1752  TPR domain-containing protein  92.31 
 
 		 1530 bp  54  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  84.85 
 
 		 1734 bp  52  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  93.94 
 
 		 1491 bp  50.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  93.94 
 
 		 1803 bp  50.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  88.89 
 
 		 1623 bp  50.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2727  TPR repeat-containing protein  93.94 
 
 		 1722 bp  50.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1836 bp  50.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 2304 bp  48.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 4290 bp  48.1  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  87.5 
 
 		 1848 bp  48.1  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>