246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0037 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0037  cytochrome c class I  100 
 
 		 153 aa  301  2.0000000000000002e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.113855  normal  0.0169208 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1563  cytochrome c class I  42.28 
 
 		 147 aa  100  9e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0810  cytochrome c, class I  45.74 
 
 		 158 aa  98.6  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2783  cytochrome c class I  39.6 
 
 		 151 aa  98.2  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.796513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1926  cytochrome c class I  42.48 
 
 		 150 aa  92  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015189 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1565  cytochrome c class I  37.66 
 
 		 152 aa  90.1  9e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1925  cytochrome c class I  38.28 
 
 		 146 aa  90.1  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.379147  hitchhiker  0.000000158454 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4993  cytochrome c class I  39.71 
 
 		 166 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0594408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4468  cytochrome c, class I  39.71 
 
 		 166 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3813  cytochrome c class I  38.1 
 
 		 165 aa  88.6  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.683358 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2872  cytochrome c class I  39.73 
 
 		 159 aa  88.6  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4349  cytochrome c class I  36.03 
 
 		 166 aa  87.8  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1265  cytochrome c, class I  42.02 
 
 		 205 aa  87.8  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0605  cytochrome c, class I  37.68 
 
 		 166 aa  87.4  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5226  cytochrome c class I  38.52 
 
 		 166 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.895227  normal  0.936592 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3309  cytochrome c, class I  39.68 
 
 		 166 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5058  cytochrome c, class I  39.68 
 
 		 166 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.81836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3584  cytochrome c class I  38.1 
 
 		 166 aa  84  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.498131 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4015  nitrite reductase, copper-containing  39.66 
 
 		 499 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4128  nitrite reductase, copper-containing  39.66 
 
 		 499 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4076  cytochrome c, class I  37.1 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03038  major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  36.84 
 
 		 510 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.490138  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0561  cytochrome c class I  34.93 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4125  cytochrome c, class I  36.97 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4366  cytochrome c, class I  36.22 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.726354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0431  cytochrome c class I  37.31 
 
 		 232 aa  71.2  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.472304 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0473  cytochrome c class I  35.71 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02321  hypothetical protein  36.84 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0244328  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0881  mulitcopper oxidase domain-containing protein  35.51 
 
 		 516 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208672  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1432  cytochrome c, class I  37.62 
 
 		 217 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.632156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0520  putative anaerobically induced outer membrane protein  34.91 
 
 		 520 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2107  nitrite reductase, copper-containing  34.91 
 
 		 520 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2012  nitrite reductase, copper-containing  34.91 
 
 		 516 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0755  putative outer membrane nitrite reductase  38.82 
 
 		 520 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0721126  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1658  putative outer membrane nitrite reductase  38.82 
 
 		 520 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0593  putative outer membrane nitrite reductase  38.82 
 
 		 520 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0703  putative outer membrane nitrite reductase  38.82 
 
 		 520 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4625  cytochrome c class I  37.19 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.887243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4324  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  36.7 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1620  outer membrane nitrite reductase, putative  39.39 
 
 		 189 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.704464  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2127  cytochrome c class I  37.76 
 
 		 202 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0450  cytochrome c class I  30.7 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2418  nitrite reductase, copper-containing  38.71 
 
 		 479 aa  61.2  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2442  NHL repeat containing protein  33.94 
 
 		 577 aa  60.5  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0106112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4806  cytochrome c class I  36.96 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167135  normal  0.0495406 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5782  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  36.36 
 
 		 338 aa  59.7  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00253495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1519  nitrite reductase, copper-containing  35.63 
 
 		 481 aa  59.7  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1132  cytochrome c, class I  35 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.300286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2358  cytochrome c, class I  36.73 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3348  cytochrome c class I  34.34 
 
 		 587 aa  58.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3966  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.78 
 
 		 601 aa  58.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1689  cytochrome c, class I  33.04 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105183  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4896  cytochrome c class I  37.38 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1153  cytochrome c family protein  36.84 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1779  cytochrome c, class I  35.09 
 
 		 214 aa  57.4  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0282319 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0251  cytochrome c class I  38.2 
 
 		 274 aa  57  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1369  cytochrome c class I  30.56 
 
 		 161 aa  57  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3926  cytochrome c family protein  34.51 
 
 		 222 aa  57  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3648  cytochrome c class I  32.41 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00073069  normal  0.303937 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1680  cytochrome c oxidase, subunit II  33.59 
 
 		 402 aa  55.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450721  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6548  cytochrome c, class I  37.4 
 
 		 425 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0314  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  32.71 
 
 		 421 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1400  cytochrome c, class I  33.9 
 
 		 421 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0183  cytochrome c oxidase, subunit II  35.87 
 
 		 377 aa  54.7  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000324421  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1777  cytochrome c oxidase, subunit II  35.87 
 
 		 377 aa  54.7  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.302976  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0246  cytochrome c class I  34.78 
 
 		 251 aa  54.3  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 405 aa  53.9  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3778  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  35.24 
 
 		 331 aa  53.9  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000025315  hitchhiker  0.00577808 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1414  cytochrome c family protein  37.1 
 
 		 492 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.186397  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4441  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.21 
 
 		 425 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0878  cytochrome c oxidase, subunit II  34.86 
 
 		 401 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3818  cytochrome c oxidase, subunit II  34.55 
 
 		 388 aa  52.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198752 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1294  cytochrome c, class I  36.59 
 
 		 425 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618448  normal  0.723346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0261  cytochrome c oxidase subunit II  32.08 
 
 		 422 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.814908 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3181  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor  36.45 
 
 		 398 aa  52.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5752  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.59 
 
 		 425 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.95358  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12333  probable major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  33.33 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.378293  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1245  cytochrome c oxidase, subunit II  33.96 
 
 		 400 aa  51.6  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.731852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4095  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.59 
 
 		 425 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3816  cytochrome c, class I  36.59 
 
 		 425 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60490  putative cytochrome c  31.08 
 
 		 675 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00637068  normal  0.0584653 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4552  cytochrome c, class I  36.59 
 
 		 425 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.859169 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001445  cytochrome c oxidase polypeptide II  32.41 
 
 		 356 aa  51.6  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.633895  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3977  cytochrome c, class I  37.4 
 
 		 425 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386742  normal  0.0120271 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0790  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.53 
 
 		 427 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310202  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4392  cytochrome c oxidase, subunit II  34.15 
 
 		 392 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1826  cytochrome c, class I  37.89 
 
 		 251 aa  51.2  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.384457 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1350  glucose dehydrogenase, beta subunit  36.29 
 
 		 452 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0106089  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0772  putative oxidoreductase dehydrogenase (cytochrome C subunit) signal peptide protein  31.19 
 
 		 429 aa  50.4  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.456552  hitchhiker  0.00960965 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0325  cytochrome c oxidase subunit II  31.5 
 
 		 382 aa  50.4  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0125401 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3309  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.29 
 
 		 432 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1435  glucose dehydrogenase, beta subunit  36.29 
 
 		 452 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1491  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0650  putative periplasmic cytochrome c  35.29 
 
 		 432 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524273  normal  0.460926 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0720  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.63 
 
 		 427 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.690125 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1244  cytochrome c family protein  36.29 
 
 		 452 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.148627  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2590  cytochrome c family protein  36.29 
 
 		 497 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0488  cytochrome c family protein  36.29 
 
 		 452 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.155198  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0215  cytochrome c family protein  36.29 
 
 		 452 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1084  cytochrome c family protein  36.29 
 
 		 452 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>