16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0022 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0022  hypothetical protein  100 
 
 
369 aa  752    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.205908  normal  0.027287 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3079  hypothetical protein  51.53 
 
 
369 aa  351  1e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000715673  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0594  hypothetical protein  44.38 
 
 
378 aa  317  2e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000709427  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0416  hypothetical protein  42.3 
 
 
376 aa  316  4e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1499  hypothetical protein  42.82 
 
 
377 aa  311  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000788188 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4922  hypothetical protein  38.58 
 
 
367 aa  224  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.987878  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2496  hypothetical protein  33.24 
 
 
371 aa  183  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0619786  normal  0.163334 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5052  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzymes-like  24.39 
 
 
790 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46089  normal  0.605241 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1416  cyanophycin synthetase  26.73 
 
 
743 aa  50.1  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1006  cyanophycin synthetase  36.08 
 
 
744 aa  48.9  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.264367 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1059  cyanophycin synthetase  36.96 
 
 
748 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115061  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7496  hypothetical protein  27.36 
 
 
317 aa  46.2  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1058  cyanophycin synthetase  34.04 
 
 
855 aa  46.2  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4152  cyanophycin synthetase  27.05 
 
 
895 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.38257  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5710  cyanophycin synthetase  25.37 
 
 
875 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.011022 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0141  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  30.48 
 
 
569 aa  43.5  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.789273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>