More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0013 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0013  cyclic nucleotide-regulated Na/H exchanger  100 
 
 
874 aa  1729    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.969543  normal  0.36884 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0426  Na+/H+ antiporter  38.75 
 
 
832 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2082  cyclic nucleotide-binding protein  38.75 
 
 
832 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.584605  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2350  cyclic nucleotide-binding protein  38 
 
 
832 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2108  hypothetical protein  40.08 
 
 
835 aa  505  1e-141  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3674  cyclic nucleotide-binding protein  37.65 
 
 
788 aa  466  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.301148 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4268  sodium/hydrogen exchanger  40.39 
 
 
703 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.199403  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4378  sodium/hydrogen exchanger  40.39 
 
 
703 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.746015  normal  0.209778 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3954  Sodium/hydrogen exchanger  40 
 
 
725 aa  412  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2906  Sodium/hydrogen exchanger  36.32 
 
 
431 aa  209  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3825  sodium/hydrogen exchanger  28.86 
 
 
680 aa  198  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4985  sodium/hydrogen exchanger  35.05 
 
 
435 aa  183  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0820317  normal  0.370325 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3919  cyclic nucleotide-binding protein  28.49 
 
 
682 aa  181  8e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0636  cyclic nucleotide-binding protein  23.72 
 
 
812 aa  157  7e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4011  Na+/H+ antiporter  32.24 
 
 
521 aa  145  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276255 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29184  CPA1 family transporter: sodium ion/proton  28.21 
 
 
1247 aa  145  4e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2454  Na+/H+ antiporter  30.32 
 
 
533 aa  144  7e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2078  Na+/H+ antiporter  30.32 
 
 
533 aa  144  7e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.886185  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3633  sodium/hydrogen exchanger  32.42 
 
 
531 aa  142  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544202  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0680  sodium/hydrogen exchanger  31.03 
 
 
705 aa  137  8e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2041  Sodium/hydrogen exchanger  31.71 
 
 
520 aa  136  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.27132 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3408  Na+/H+ antiporter NhaP  31.69 
 
 
399 aa  126  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.435217  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0652  Na+/H+ antiporter  28.57 
 
 
436 aa  124  7e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0811  Na+/H+ antiporter  33.15 
 
 
527 aa  123  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  25.64 
 
 
534 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  25.38 
 
 
531 aa  115  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  29.61 
 
 
538 aa  114  7.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  26.91 
 
 
524 aa  114  9e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10409  predicted protein  30.19 
 
 
368 aa  111  7.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  31.18 
 
 
527 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  26.19 
 
 
524 aa  110  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1895  sodium/hydrogen exchanger  31.5 
 
 
397 aa  108  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.554149 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2245  Na+/H+ antiporter, putative  31.5 
 
 
397 aa  108  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207208  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  28.14 
 
 
525 aa  108  4e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  28.35 
 
 
524 aa  107  8e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7625  putative sodium/hydrogen antiporter (exchanger)  28.46 
 
 
535 aa  105  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  30.14 
 
 
535 aa  105  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  27.7 
 
 
537 aa  104  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  28.07 
 
 
526 aa  103  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  28.07 
 
 
526 aa  103  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  28.07 
 
 
526 aa  103  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  25.76 
 
 
425 aa  103  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  28.07 
 
 
526 aa  103  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2807  putative Na+/H+ antiporter  28.04 
 
 
444 aa  103  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.70387  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  28.07 
 
 
526 aa  103  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  28.07 
 
 
526 aa  103  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  28.64 
 
 
536 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  27.79 
 
 
526 aa  103  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0889  Na+/H+ antiporter  25 
 
 
548 aa  103  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0407392  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  29.45 
 
 
526 aa  102  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002354  hypothetical protein  28.25 
 
 
417 aa  102  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1715  Na+/H+ antiporter  28.69 
 
 
524 aa  100  9e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0661  Na+/H+ antiporter  24.8 
 
 
548 aa  100  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0122747  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  31.79 
 
 
526 aa  99.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  28.95 
 
 
528 aa  99.4  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  29.2 
 
 
533 aa  99  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03713  hypothetical protein  27.51 
 
 
427 aa  98.6  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0398  Na+/H+ antiporter  27.68 
 
 
417 aa  98.6  5e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0744665  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6647  sodium/hydrogen exchanger  27.22 
 
 
521 aa  97.4  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1943  sodium/hydrogen exchanger  27.29 
 
 
666 aa  97.1  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.575078  normal  0.181083 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0492  Na+/H+ antiporter  32.4 
 
 
533 aa  96.3  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0315  Na+/H+ antiporter  28.5 
 
 
550 aa  96.3  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1398  sodium/hydrogen exchanger  27.62 
 
 
517 aa  96.3  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  32.8 
 
 
526 aa  95.9  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1777  Na(+)/H(+) antiporter NhaP  27.12 
 
 
417 aa  95.9  3e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0496  Na+/H+ antiporter  28.45 
 
 
526 aa  94.4  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0871  sodium/hydrogen exchanger  30.31 
 
 
511 aa  94.4  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0530872  hitchhiker  0.00104579 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7391  sodium/hydrogen exchanger  29.11 
 
 
521 aa  94  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.90592  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2310  Na+/H+ antiporter  30.51 
 
 
527 aa  94  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0519  Na+/H+ antiporter  30.22 
 
 
539 aa  94  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  25.97 
 
 
537 aa  93.6  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2741  sodium/hydrogen exchanger  28.53 
 
 
426 aa  94  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0441  sodium/proton antiporter  27.05 
 
 
425 aa  93.6  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3451  sodium/hydrogen exchanger  28.54 
 
 
538 aa  93.2  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  24.53 
 
 
533 aa  92.8  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2665  sodium/hydrogen exchanger  28.54 
 
 
538 aa  93.2  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2984  Na+/H+ antiporter  29.52 
 
 
531 aa  92.4  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200896 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1366  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.39 
 
 
434 aa  92.4  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1351  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  30.61 
 
 
435 aa  92.4  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1369  sodium/hydrogen exchanger  29.31 
 
 
526 aa  92.8  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0185276 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  29.44 
 
 
534 aa  92.8  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48886  predicted protein  26.36 
 
 
813 aa  92.4  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.515683  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  29.52 
 
 
532 aa  92  4e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  29.52 
 
 
532 aa  92  4e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0909  sodium/hydrogen exchanger  29.31 
 
 
526 aa  92  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1608  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  25.5 
 
 
688 aa  92  4e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1391  sodium/hydrogen exchanger  29.31 
 
 
526 aa  92  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469942  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2829  sodium/hydrogen exchanger  28.37 
 
 
434 aa  91.7  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06580  Na+ antiporter  29.25 
 
 
666 aa  91.7  6e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.855563 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1296  sodium/hydrogen exchanger  31.53 
 
 
434 aa  91.3  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4613  Na+/H+ antiporter  25.83 
 
 
563 aa  90.9  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.280911 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4615  Na+/H+ antiporter  25.88 
 
 
563 aa  90.9  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.501158 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4529  Na+/H+ antiporter  25.83 
 
 
563 aa  90.9  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4664  Na+/H+ antiporter  25.83 
 
 
563 aa  90.9  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.099275  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1887  Na+/H+ exchanger family protein  25.83 
 
 
689 aa  90.1  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  27.05 
 
 
526 aa  90.9  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5804  sodium/hydrogen exchanger  27.35 
 
 
418 aa  89.7  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0577051  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0840  Na+/H+ antiporter  26.08 
 
 
566 aa  89.7  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1220  Na+/H+ antiporter NhaP  30.34 
 
 
424 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181275  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3263  Na+/H+ antiporter  27.1 
 
 
548 aa  89.4  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>