243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0009 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0009  glycine oxidase ThiO  100 
 
 		 338 aa  669    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0284  glycine oxidase ThiO  53.31 
 
 		 334 aa  341  1e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2562  glycine oxidase ThiO  54.15 
 
 		 331 aa  334  1e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.185136  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2166  glycine oxidase ThiO  52.8 
 
 		 337 aa  331  1e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.232699  normal  0.765835 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0208  glycine oxidase ThiO  52.73 
 
 		 334 aa  330  1e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0217  D-amino acid oxidase family protein  52.73 
 
 		 334 aa  330  2e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6396  glycine oxidase ThiO  53.25 
 
 		 316 aa  325  6e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1414  glycine oxidase ThiO  51.98 
 
 		 339 aa  322  4e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0914  glycine oxidase ThiO  53.87 
 
 		 325 aa  322  5e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4173  glycine oxidase ThiO  54.77 
 
 		 334 aa  322  5e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0445  thiamine biosynthesis oxidoreductase  46.88 
 
 		 316 aa  322  6e-87  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3650  glycine oxidase ThiO  51.08 
 
 		 324 aa  306  3e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5918  glycine oxidase ThiO  49.07 
 
 		 330 aa  306  3e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2166  glycine oxidase ThiO  50.64 
 
 		 346 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.402403 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0041  FAD dependent oxidoreductase  49.84 
 
 		 325 aa  298  1e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.161257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4092  FAD dependent oxidoreductase  49.53 
 
 		 368 aa  295  9e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0346042  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3428  glycine oxidase ThiO  48.9 
 
 		 369 aa  292  6e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2891  glycine oxidase ThiO  48.4 
 
 		 338 aa  289  4e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.894969  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6222  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  48.76 
 
 		 338 aa  289  6e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1958  glycine oxidase ThiO  49.04 
 
 		 338 aa  288  7e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0655991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2464  FAD dependent oxidoreductase  47.12 
 
 		 338 aa  281  9e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.750874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1786  FAD dependent oxidoreductase  39.88 
 
 		 374 aa  204  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0563944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1936  FAD dependent oxidoreductase  39.88 
 
 		 374 aa  203  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.969419  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1932  FAD dependent oxidoreductase  32.58 
 
 		 410 aa  203  4e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0438  glycine oxidase ThiO  35.26 
 
 		 340 aa  201  9.999999999999999e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017801  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0163  FAD dependent oxidoreductase  41.03 
 
 		 410 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1748  glycine oxidase  35.26 
 
 		 340 aa  201  9.999999999999999e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0206  FAD dependent oxidoreductase  39.49 
 
 		 402 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573991  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0147  FAD dependent oxidoreductase  34.13 
 
 		 350 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0112  putative D-amino acid oxidase flavoprotein oxidoreductase  39.39 
 
 		 379 aa  194  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333695  normal  0.56231 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0570  FAD dependent oxidoreductase  34.46 
 
 		 353 aa  192  5e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0452  FAD-dependent oxidoreductase  32.54 
 
 		 354 aa  191  1e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0251  oxidoreductase, FAD-dependent  31.42 
 
 		 393 aa  191  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3643  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 381 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4314  FAD dependent oxidoreductase  37.39 
 
 		 378 aa  189  8e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.274376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3319  FAD dependent oxidoreductase  39.7 
 
 		 381 aa  188  9e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1460  hypothetical protein  33.04 
 
 		 356 aa  188  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2398  FAD dependent oxidoreductase  38.72 
 
 		 363 aa  186  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0895  FAD dependent oxidoreductase  35.08 
 
 		 365 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00321446  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0020  glycine oxidase ThiO  35.92 
 
 		 355 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.504997 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3575  FAD dependent oxidoreductase  38.74 
 
 		 376 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.747856  hitchhiker  0.00000218413 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3068  FAD dependent oxidoreductase  37.76 
 
 		 372 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0186757  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1523  hypothetical protein  31.76 
 
 		 356 aa  184  3e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0038  FAD dependent oxidoreductase  37.95 
 
 		 353 aa  184  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1456  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.04 
 
 		 394 aa  182  5.0000000000000004e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.712312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2774  FAD dependent oxidoreductase  38.74 
 
 		 386 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3293  FAD dependent oxidoreductase  41.7 
 
 		 398 aa  180  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204133 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3508  FAD dependent oxidoreductase  40.68 
 
 		 378 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.544782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2697  FAD dependent oxidoreductase  39.88 
 
 		 378 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0410  FAD dependent oxidoreductase  39.88 
 
 		 378 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.533271  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2464  FAD dependent oxidoreductase  35.54 
 
 		 358 aa  176  6e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.112989  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3008  oxidoreductase, FAD-binding  39.27 
 
 		 377 aa  175  8e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0383  putative D-amino acid oxidase flavoprotein  39.7 
 
 		 376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2730  oxidoreductase, FAD-binding  40.31 
 
 		 377 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0389  FAD dependent oxidoreductase  40.12 
 
 		 378 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3710  oxidoreductase, FAD-binding  40.31 
 
 		 377 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2780  glycine oxidase ThiO  40.31 
 
 		 377 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1773  glycine oxidase ThiO  40.31 
 
 		 377 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3224  glycine oxidase ThiO  40.31 
 
 		 377 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3739  glycine oxidase ThiO  40.31 
 
 		 377 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3681  glycine oxidase ThiO  40.31 
 
 		 377 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0337  FAD dependent oxidoreductase  39.69 
 
 		 378 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.832252  normal  0.324335 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0313  FAD dependent oxidoreductase  39.69 
 
 		 378 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0947  FAD dependent oxidoreductase  33.63 
 
 		 374 aa  166  6.9999999999999995e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0328  FAD dependent oxidoreductase  39.38 
 
 		 378 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2431  FAD dependent oxidoreductase  36.96 
 
 		 367 aa  164  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.779457 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1609  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO, putative  34.85 
 
 		 360 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.575711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  34.2 
 
 		 342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  30.81 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  31.09 
 
 		 375 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1152  glycine oxidase ThiO  32.86 
 
 		 360 aa  101  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0708  glycine oxidase ThiO  34.74 
 
 		 338 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10420  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  34.04 
 
 		 340 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.219353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  30.41 
 
 		 376 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  33.33 
 
 		 392 aa  92.8  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0408  glycine oxidase ThiO  30.81 
 
 		 335 aa  92  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0882665  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  33.14 
 
 		 371 aa  90.1  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0535  glycine oxidase ThiO  32.54 
 
 		 338 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0545  glycine oxidase ThiO  32.54 
 
 		 338 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0557  glycine oxidase ThiO  32.54 
 
 		 338 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.959703  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  32.94 
 
 		 385 aa  87  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0750  glycine oxidase ThiO  25.14 
 
 		 365 aa  86.3  7e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  31.02 
 
 		 368 aa  85.9  8e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  29.64 
 
 		 373 aa  85.9  9e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  30.88 
 
 		 382 aa  85.1  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1286  glycine oxidase ThiO  29.88 
 
 		 356 aa  84.7  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  30.32 
 
 		 652 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  30.47 
 
 		 405 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  26.25 
 
 		 367 aa  83.6  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  30.4 
 
 		 404 aa  82.8  0.000000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  28.65 
 
 		 363 aa  82.8  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  30.91 
 
 		 349 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  28.9 
 
 		 388 aa  80.1  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  30.37 
 
 		 379 aa  79.7  0.00000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  35.65 
 
 		 398 aa  79.7  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  34.53 
 
 		 391 aa  79.3  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  30.66 
 
 		 376 aa  79.3  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  30.66 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  29.34 
 
 		 375 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  32.32 
 
 		 372 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>