42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4838 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4838  regulatory protein TetR  100 
 
 		 211 aa  415  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220923  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2773  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.704113  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3760  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 192 aa  123  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.348424  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0303  transcriptional regulator, TetR family  38.31 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00708396  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3373  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.946701  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3384  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3435  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0970833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6683  putative transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal  0.237194 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12279  transcriptional regulator  39.69 
 
 		 189 aa  106  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000321459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2581  regulatory protein, TetR  38.22 
 
 		 197 aa  105  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0942  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 208 aa  105  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0072348  normal  0.323203 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1797  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 197 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2776  TetR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 197 aa  99.8  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.832438  hitchhiker  0.000578318 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4591  regulatory protein, TetR  40 
 
 		 200 aa  92.4  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0937227  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5600  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 279 aa  91.7  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0144285  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0242  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 208 aa  90.9  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33280  transcriptional regulator  32.24 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.815894  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1957  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 205 aa  71.2  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5414  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 192 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2700  TetR family transcriptional regulator  64.86 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2715  TetR family transcriptional regulator  64.86 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.0320009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2670  TetR family transcriptional regulator  64.86 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545748  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4086  putative transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 237 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  34.51 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 		 229 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5768  putative transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51365  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 196 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 205 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 223 aa  42  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  28.4 
 
 		 224 aa  42  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 188 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 213 aa  42  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9268  putative transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 193 aa  42  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 221 aa  41.6  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>