180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4832 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4832  peptidase S15  100 
 
 
679 aa  1372    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.392694  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0347  peptidase S15  49.06 
 
 
686 aa  642    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1123  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  42.07 
 
 
678 aa  501  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.361162  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4056  peptidase S15  40.06 
 
 
655 aa  458  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1770  peptidase S15  32.92 
 
 
668 aa  254  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2093  peptidase S15  32.47 
 
 
668 aa  249  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.418145 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0241  peptidase S15  29.82 
 
 
673 aa  226  1e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1732  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  27.79 
 
 
585 aa  152  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.116958  hitchhiker  0.00967983 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2454  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.99 
 
 
595 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0525399  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5310  peptidase S15  28.54 
 
 
542 aa  135  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1796  peptidase S15  26.7 
 
 
569 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2359  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like protein  25.68 
 
 
595 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.10843  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5294  peptidase S15  27.9 
 
 
599 aa  131  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3814  peptidase S15  28.11 
 
 
650 aa  126  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2383  peptidase S15  24.39 
 
 
571 aa  125  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2615  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  26.99 
 
 
599 aa  124  7e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.465007  normal  0.945434 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1029  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.17 
 
 
594 aa  122  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.928665 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1772  putative esterase  26.41 
 
 
598 aa  121  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0442239  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2869  peptidase S15  27.11 
 
 
644 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2785  peptidase S15  25.54 
 
 
668 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3114  peptidase S15  26.06 
 
 
560 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.976266  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0930  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like  26.56 
 
 
547 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280789  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11864  hypothetical protein  24.28 
 
 
628 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.488629  normal  0.930954 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0930  peptidase S15  25.96 
 
 
714 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.674729  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4266  peptidase S15  26.98 
 
 
553 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220247  normal  0.302164 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3347  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.09 
 
 
570 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6346  peptidase S15  23.61 
 
 
612 aa  114  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1900  peptidase S15  24.03 
 
 
705 aa  114  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138312  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1499  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  25.77 
 
 
604 aa  113  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000124334  normal  0.885769 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0437  peptidase S15  24.39 
 
 
540 aa  112  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0815  hydrolase CocE/NonD family protein  26.71 
 
 
557 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.560842  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0819  peptidase S15  25.53 
 
 
674 aa  110  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156634  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3036  hypothetical protein  24.03 
 
 
667 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2221  peptidase S15  22.87 
 
 
677 aa  109  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4534  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  26.04 
 
 
609 aa  110  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19075  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4945  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.6 
 
 
605 aa  109  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0518837  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3763  peptidase S15  23.84 
 
 
667 aa  108  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3229  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  26.27 
 
 
588 aa  108  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2049  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.91 
 
 
577 aa  107  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.641906  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1680  dipeptidyl-peptidase  27.11 
 
 
670 aa  107  6e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0461  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.69 
 
 
550 aa  107  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1723  peptidase S15  24.44 
 
 
677 aa  105  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463427  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2493  peptidase S15  25.27 
 
 
576 aa  105  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194166  normal  0.10324 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18520  putative hydrolase, CocE/NonD family  25.2 
 
 
534 aa  104  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.327698  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0413  peptidase S15  24.29 
 
 
690 aa  104  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.928819 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1361  hydrolase CocE/NonD family protein  25.81 
 
 
674 aa  104  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.307565  normal  0.298567 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2060  dipeptidyl-peptidase  26.58 
 
 
670 aa  103  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3839  peptidase S15  23.42 
 
 
670 aa  102  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2349  peptidase S15  22.41 
 
 
690 aa  101  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1253  X-Pro dipeptidyl-peptidase  23.58 
 
 
663 aa  101  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1297  acylase and diesterase protein  24.07 
 
 
608 aa  101  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.36424  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08460  putative hydrolase, CocE/NonD family  24.35 
 
 
673 aa  100  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.8708  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4675  peptidase S15  24.95 
 
 
615 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0378329  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2913  hydrolase CocE/NonD family protein  24.28 
 
 
677 aa  99.8  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3241  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  25.57 
 
 
587 aa  98.6  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972915  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1596  peptidase S15  22.45 
 
 
679 aa  98.2  5e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5053  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  24.1 
 
 
561 aa  97.8  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.842061  normal  0.996249 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1482  peptidase S15  25.61 
 
 
537 aa  97.1  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2381  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.13 
 
 
580 aa  97.1  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.241656  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4503  peptidase S15  24.65 
 
 
667 aa  97.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628764  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08476  conserved hypothetical protein  23.64 
 
 
591 aa  95.9  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.706032  normal  0.916636 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4135  peptidase S15  24.02 
 
 
541 aa  96.3  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.427793 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0774  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  23.61 
 
 
576 aa  95.5  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000168063 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1942  peptidase S15  24.28 
 
 
670 aa  95.5  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4096  peptidase S15  23.81 
 
 
541 aa  95.1  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11239  hypothetical protein  34.42 
 
 
561 aa  94.7  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000144699  normal  0.0575196 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3305  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  26.23 
 
 
611 aa  94.7  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.0581087 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5818  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  24.57 
 
 
625 aa  94.7  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.412169 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1500  peptidase S15  22.6 
 
 
678 aa  94  9e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0908  peptidase S15  23.39 
 
 
680 aa  91.3  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6298  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.42 
 
 
647 aa  91.3  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2616  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  33.65 
 
 
560 aa  90.5  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2670  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  33.65 
 
 
560 aa  90.5  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0391  peptidase S15  23.62 
 
 
668 aa  89  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07789  conserved hypothetical protein  32.04 
 
 
588 aa  89  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183202  normal  0.814624 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6422  peptidase S15  24.18 
 
 
667 aa  89  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0843885  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0938  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  23.69 
 
 
611 aa  87.8  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.274521  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3343  putative acylase  23.24 
 
 
636 aa  87.8  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.843899  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04480  putative hydrolase, CocE/NonD family  23.29 
 
 
653 aa  87.8  6e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000670988 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06743  hydrolase, CocE/NonD family, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00600)  30.29 
 
 
793 aa  86.7  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0144437 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4096  peptidase S15  23.7 
 
 
555 aa  85.5  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127358  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1894  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.42 
 
 
545 aa  85.5  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00645212  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0281  hypothetical protein  33.14 
 
 
198 aa  84.7  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2821  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like protein  22.99 
 
 
626 aa  83.2  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2865  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  22.99 
 
 
626 aa  83.2  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1252  peptidase S15  27.27 
 
 
667 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.680341  normal  0.327656 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2848  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  22.84 
 
 
645 aa  81.6  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5443  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  23.71 
 
 
625 aa  80.9  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5030  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.83 
 
 
524 aa  81.3  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0204968  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1111  peptidase S15  22.37 
 
 
677 aa  80.1  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2887  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  23.99 
 
 
561 aa  78.6  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000279173  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0936  peptidase S15  23.78 
 
 
704 aa  78.2  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.311153  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4789  peptidase S15  25.97 
 
 
499 aa  78.2  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00440  putative hydrolase, CocE/NonD family  26.06 
 
 
637 aa  77.8  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.403131 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0414  peptidase S15  34.32 
 
 
763 aa  76.3  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.272153  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3981  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  24.63 
 
 
529 aa  76.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28231  predicted protein  23.66 
 
 
711 aa  76.6  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3127  peptidase S15  23.24 
 
 
571 aa  76.3  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.582625  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0594  hypothetical protein  26.64 
 
 
558 aa  73.6  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000382895  normal  0.552928 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2184  peptidase S15  23.84 
 
 
665 aa  71.2  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.173724 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>