92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4824 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4824  protein of unknown function DUF222  100 
 
 		 553 aa  1123    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2802  protein of unknown function DUF222  81.19 
 
 		 551 aa  902    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0845411  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4288  protein of unknown function DUF222  50.09 
 
 		 524 aa  540  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.429378  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3811  protein of unknown function DUF222  44.73 
 
 		 593 aa  368  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3136  hypothetical protein  51.43 
 
 		 387 aa  333  4e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4191  protein of unknown function DUF222  42.43 
 
 		 533 aa  290  6e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.650463  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0796  protein of unknown function DUF222  41.94 
 
 		 534 aa  284  4.0000000000000003e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2293  protein of unknown function DUF222  34.51 
 
 		 540 aa  235  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3745  protein of unknown function DUF222  34.13 
 
 		 531 aa  220  6e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4127  protein of unknown function DUF222  34.13 
 
 		 532 aa  218  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4437  hypothetical protein  34.09 
 
 		 507 aa  212  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.835135  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4351  hypothetical protein  34.09 
 
 		 507 aa  212  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489972  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4731  hypothetical protein  34.2 
 
 		 507 aa  205  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5741  hypothetical protein  35.08 
 
 		 519 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.316715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1709  hypothetical protein  33.98 
 
 		 507 aa  204  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1730  hypothetical protein  33.98 
 
 		 507 aa  204  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1777  hypothetical protein  33.98 
 
 		 507 aa  204  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1835  hypothetical protein  33.05 
 
 		 489 aa  203  7e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3050  hypothetical protein  33.64 
 
 		 495 aa  202  9e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184286 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5454  hypothetical protein  33.98 
 
 		 519 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.157039  decreased coverage  0.0069948 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11151  hypothetical protein  37.64 
 
 		 451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3484  hypothetical protein  34.52 
 
 		 552 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210016  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3231  hypothetical protein  33.4 
 
 		 510 aa  198  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4451  hypothetical protein  33.11 
 
 		 518 aa  197  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5865  hypothetical protein  34.49 
 
 		 511 aa  197  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3851  hypothetical protein  33.11 
 
 		 513 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.432378 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4912  hypothetical protein  32.79 
 
 		 508 aa  196  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477526  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2470  protein of unknown function DUF222  33.65 
 
 		 437 aa  194  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3477  hypothetical protein  33.93 
 
 		 506 aa  194  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.800826  normal  0.648899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4610  hypothetical protein  33.41 
 
 		 448 aa  194  5e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4397  hypothetical protein  33.26 
 
 		 501 aa  193  7e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3803  hypothetical protein  33.41 
 
 		 447 aa  193  8e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.866819  normal  0.47715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2779  hypothetical protein  33.69 
 
 		 473 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2089  hypothetical protein  33.95 
 
 		 493 aa  192  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.129503 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3615  hypothetical protein  33.95 
 
 		 444 aa  190  5e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3542  hypothetical protein  33.95 
 
 		 444 aa  190  5e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3379  hypothetical protein  33.89 
 
 		 497 aa  190  7e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.887374  normal  0.158077 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2106  hypothetical protein  32.02 
 
 		 446 aa  189  8e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.426457  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4827  hypothetical protein  31.98 
 
 		 508 aa  189  9e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.79889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0179  hypothetical protein  33.69 
 
 		 442 aa  189  9e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0170  hypothetical protein  33.69 
 
 		 442 aa  189  9e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523196  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4232  hypothetical protein  32.93 
 
 		 448 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815534  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0348  hypothetical protein  33.69 
 
 		 492 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2749  hypothetical protein  33.86 
 
 		 473 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.621595  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2152  hypothetical protein  32.02 
 
 		 492 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.166446 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0338  hypothetical protein  33.69 
 
 		 492 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2793  hypothetical protein  33.86 
 
 		 473 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.925956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3547  hypothetical protein  33.6 
 
 		 444 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0327  hypothetical protein  33.6 
 
 		 490 aa  187  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11173  hypothetical protein  37.68 
 
 		 499 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4014  hypothetical protein  32.71 
 
 		 464 aa  179  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00728967 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11717  hypothetical protein  35.36 
 
 		 454 aa  178  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.12455 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11974  hypothetical protein  37.06 
 
 		 454 aa  172  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10095  hypothetical protein  39.93 
 
 		 317 aa  157  4e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.391031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5363  hypothetical protein  34.68 
 
 		 355 aa  156  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4658  hypothetical protein  40.68 
 
 		 275 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449109  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11604  REP13E12 repeat-containing protein  40.3 
 
 		 240 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.81222e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13504  hypothetical protein  39.8 
 
 		 239 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  28.33 
 
 		 442 aa  89  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  27.98 
 
 		 546 aa  86.7  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1463  HNH nuclease  25.5 
 
 		 414 aa  82.8  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  28.57 
 
 		 561 aa  81.6  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1741  HNH nuclease  24.24 
 
 		 414 aa  78.6  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.206853  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4665  hypothetical protein  51.43 
 
 		 149 aa  76.6  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  26 
 
 		 432 aa  73.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18050  hypothetical protein  26.98 
 
 		 577 aa  70.1  0.00000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418777  normal  0.174472 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  26.33 
 
 		 485 aa  70.1  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26200  hypothetical protein  26.76 
 
 		 526 aa  67.8  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  28.51 
 
 		 469 aa  66.6  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23120  hypothetical protein  24.21 
 
 		 522 aa  65.5  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0151991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09510  HNH endonuclease  30.48 
 
 		 464 aa  61.2  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531982  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01610  hypothetical protein  25.4 
 
 		 538 aa  60.1  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.746521  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09750  HNH endonuclease  33.61 
 
 		 494 aa  57.8  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00000378313  normal  0.0136835 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  24.36 
 
 		 413 aa  57  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  23.7 
 
 		 572 aa  56.6  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  29.17 
 
 		 469 aa  53.5  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7882  HNH endonuclease  29.05 
 
 		 391 aa  51.2  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00294777  hitchhiker  0.00944768 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  30.36 
 
 		 661 aa  51.2  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4589  HNH endonuclease  30.43 
 
 		 428 aa  48.9  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3947  HNH endonuclease  30.25 
 
 		 433 aa  48.9  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2809  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 255 aa  48.9  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46978  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0359  HNH endonuclease  30.43 
 
 		 433 aa  48.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1508  HNH endonuclease  30.43 
 
 		 436 aa  48.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000388947  hitchhiker  0.00249472 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2505  HNH endonuclease  29.63 
 
 		 433 aa  46.6  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4933  HNH nuclease  23.43 
 
 		 407 aa  45.8  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2460  HNH endonuclease  29.81 
 
 		 428 aa  45.8  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3201  HNH endonuclease  29.81 
 
 		 428 aa  46.2  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01940  hypothetical protein  24.18 
 
 		 524 aa  45.8  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0067  HNH endonuclease  35.06 
 
 		 458 aa  45.4  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26470  hypothetical protein  25.68 
 
 		 535 aa  45.4  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.231742 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2278  HNH endonuclease  29.81 
 
 		 440 aa  45.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384645  normal  0.214719 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  26.67 
 
 		 408 aa  44.3  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>