More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4821 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4821  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  100 
 
 
354 aa  699    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09300  MoxR-like ATPase  72.92 
 
 
353 aa  481  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.293908 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1832  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  73.04 
 
 
327 aa  472  1e-132  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0761844  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2447  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  72.73 
 
 
331 aa  466  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3910  ATPase  73.8 
 
 
332 aa  467  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0582346  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2518  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  75.7 
 
 
342 aa  466  9.999999999999999e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2336  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  74.02 
 
 
355 aa  467  9.999999999999999e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00989852  decreased coverage  0.000000618175 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1408  AAA family ATPase  72.84 
 
 
336 aa  458  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  decreased coverage  0.00669065 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2500  ATPase  71.21 
 
 
327 aa  455  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352977  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4860  ATPase  69.79 
 
 
329 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5846  ATPase  73.08 
 
 
346 aa  455  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.666106  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4949  ATPase  69.79 
 
 
329 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7598  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  74.12 
 
 
320 aa  456  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0066135  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5228  ATPase  69.79 
 
 
329 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537917  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5455  ATPase  69.06 
 
 
320 aa  447  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.390863  normal  0.421522 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3819  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  76.68 
 
 
332 aa  446  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0427494  normal  0.0142776 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2716  ATPase  72.96 
 
 
342 aa  447  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0331951  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13723  methanol dehydrogenase transcriptional regulatory protein moxR2  65.35 
 
 
358 aa  444  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.861123  normal  0.434695 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3749  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  71.03 
 
 
327 aa  437  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.234316  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1845  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  65.5 
 
 
326 aa  436  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4048  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  73.08 
 
 
340 aa  434  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0759  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  71.91 
 
 
351 aa  433  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605957  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1337  ATPase  69.81 
 
 
320 aa  428  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.384179 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20690  MoxR-like ATPase  66.04 
 
 
340 aa  423  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.138823  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1835  ATPase  52.92 
 
 
315 aa  325  6e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2509  ATPase  51.3 
 
 
315 aa  323  2e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0164  ATPase  50.95 
 
 
319 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.72 
 
 
310 aa  311  2e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0074  ATPase  49.68 
 
 
315 aa  308  9e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2293  ATPase associated with various cellular activities  51.16 
 
 
316 aa  306  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1054  ATPase  47.13 
 
 
318 aa  306  4.0000000000000004e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1713  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.55 
 
 
318 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0920978  hitchhiker  0.00500993 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0154  ATPase  52.58 
 
 
320 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09798  magnesium chelatase, subunit I, putative ATPase  44.81 
 
 
340 aa  304  2.0000000000000002e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0163  ATPase  52.58 
 
 
320 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489404  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0144  ATPase  52.58 
 
 
320 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0244159 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2136  MoxR-like ATPase, regulator  46.41 
 
 
326 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2229  ATPase  45.22 
 
 
337 aa  301  9e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38370  hypothetical protein  50.79 
 
 
328 aa  301  1e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  48.23 
 
 
323 aa  298  1e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3126  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.68 
 
 
318 aa  298  1e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.336676  normal  0.404825 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0615  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.03 
 
 
319 aa  297  2e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.558521  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.84 
 
 
325 aa  297  2e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  46.3 
 
 
347 aa  295  7e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  47.23 
 
 
327 aa  295  8e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0187  ATPase  45.66 
 
 
313 aa  294  1e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4025  ATPase  45.19 
 
 
346 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.732466  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1709  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.4 
 
 
321 aa  293  3e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0476  ATPase  50 
 
 
317 aa  293  3e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0121  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 
315 aa  293  3e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13785  hitchhiker  0.00112099 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56160  hypothetical protein  47.72 
 
 
335 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4443  ATPase  48.05 
 
 
333 aa  292  7e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.259464  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3320  ATPase  47.53 
 
 
347 aa  291  9e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0180  ATPase  50.32 
 
 
320 aa  291  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0627815  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0600  ATPase  42.48 
 
 
309 aa  290  2e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0120764  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1478  ATPase  50.99 
 
 
340 aa  290  2e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000160729  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4333  moxR protein, putative  44.64 
 
 
349 aa  290  3e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1686  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.45 
 
 
326 aa  290  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1953  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  47.47 
 
 
320 aa  290  4e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.3 
 
 
318 aa  290  4e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2157  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  47.47 
 
 
320 aa  290  4e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1929  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  47.47 
 
 
320 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788825  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2870  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.46 
 
 
324 aa  289  5.0000000000000004e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.648175  normal  0.0812651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3911  methanol dehydrogenase regulatory protein  50.83 
 
 
325 aa  289  6e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0358591  normal  0.240116 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4891  hypothetical protein  47.42 
 
 
335 aa  289  6e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0802  ATPase  49.18 
 
 
317 aa  289  7e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3181  MoxR protein  46.84 
 
 
320 aa  288  8e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2274  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  47.47 
 
 
320 aa  288  9e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  45.48 
 
 
312 aa  288  1e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1968  ATPase  47.47 
 
 
320 aa  287  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2134  MoxR protein  46.51 
 
 
320 aa  287  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2678  ATPase  50.65 
 
 
320 aa  287  2e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13185  methanol dehydrogenase transcriptional regulatory protein moxR3  48.71 
 
 
320 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.585917 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4963  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.42 
 
 
329 aa  286  2.9999999999999996e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000842987 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  46.38 
 
 
310 aa  286  4e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.16 
 
 
313 aa  285  9e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0413  methanol dehydrogenase regulatory protein  46.5 
 
 
325 aa  284  1.0000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0494  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.79 
 
 
313 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1353  ATPase  40.32 
 
 
309 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.130927  hitchhiker  0.00000046022 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1323  ATPase  40.71 
 
 
309 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.305812  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  43.83 
 
 
308 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.25 
 
 
319 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2205  hypothetical protein  47.67 
 
 
320 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277828  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0032  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.01 
 
 
318 aa  282  7.000000000000001e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.062228  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3847  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.24 
 
 
328 aa  281  9e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0237  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.87 
 
 
325 aa  281  1e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  45.74 
 
 
324 aa  281  1e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3925  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.17 
 
 
336 aa  281  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.233193  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0408  ATPase  40.82 
 
 
310 aa  280  3e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00606389  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  41.25 
 
 
315 aa  280  4e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.37 
 
 
331 aa  279  6e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2275  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.33 
 
 
322 aa  278  7e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0464  ATPase AAA_3  51.13 
 
 
318 aa  278  9e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.58496  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0704  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.84 
 
 
314 aa  278  1e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1974  hypothetical protein  46.13 
 
 
296 aa  277  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2122  hypothetical protein  46.13 
 
 
296 aa  277  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2939  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.73 
 
 
325 aa  276  3e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.346358  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  40.42 
 
 
329 aa  276  4e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1679  ATPase  48.76 
 
 
305 aa  276  4e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3802  ATPase  47.08 
 
 
325 aa  276  4e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136563  normal  0.371398 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>