259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4747 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  100 
 
 		 252 aa  503  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  83.15 
 
 		 180 aa  271  8.000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6039  PadR-like family transcriptional regulator  82.95 
 
 		 181 aa  264  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0868  PadR-like family transcriptional regulator  81.82 
 
 		 181 aa  259  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525718  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5375  PadR family transcriptional regulator  81.07 
 
 		 181 aa  234  7e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.658005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5464  PadR family transcriptional regulator  81.07 
 
 		 181 aa  234  7e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5751  PadR family transcriptional regulator  81.07 
 
 		 181 aa  234  7e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.410016 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39320  transcriptional regulator, PadR family  67.03 
 
 		 184 aa  204  8e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.700238 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  67.78 
 
 		 181 aa  203  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4194  transcriptional regulator, PadR-like family  70.11 
 
 		 199 aa  199  5e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5383  transcriptional regulator, PadR-like family  64.97 
 
 		 249 aa  195  7e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9364  transcriptional regulator protein-like protein  53.72 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 229 aa  190  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4957  transcriptional regulator, PadR-like family  55.43 
 
 		 212 aa  188  5.999999999999999e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4562  transcriptional regulator PadR family protein  59.68 
 
 		 211 aa  188  8e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.605184  normal  0.596762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5080  PadR-like family transcriptional regulator  58.29 
 
 		 212 aa  186  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.6626  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3567  PadR-like family transcriptional regulator  54.97 
 
 		 213 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  0.850546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0346  transcriptional regulator, PadR-like family  55.23 
 
 		 201 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824785  normal  0.03301 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5073  transcriptional regulator, PadR-like family  52.28 
 
 		 205 aa  177  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5920  transcriptional regulator, PadR-like family  59.89 
 
 		 198 aa  175  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4677  PadR family transcriptional regulator  52.33 
 
 		 203 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2137  PadR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 199 aa  169  4e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37830  transcriptional regulator, PadR family  50 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3702  transcriptional regulator, PadR-like family  51.16 
 
 		 212 aa  162  6e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4528  PadR family transcriptional regulator  55.11 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2527  transcriptional regulator, PadR-like family  43.75 
 
 		 202 aa  160  3e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3358  transcriptional regulator, PadR-like family  45.55 
 
 		 213 aa  157  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4200  transcriptional regulator, PadR-like family  47.03 
 
 		 209 aa  148  7e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3098  PadR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 187 aa  139  6e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3510  transcriptional regulator, PadR-like family  43.21 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  32.06 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3181  transcriptional regulator, PadR-like family  31.03 
 
 		 177 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000117068  hitchhiker  0.000000000506359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4407  transcriptional regulator protein-like protein  30.34 
 
 		 176 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0291759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  34.68 
 
 		 178 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2526  PadR-like family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 183 aa  64.7  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0713427  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1535  transcriptional regulator, PadR-like family  33.96 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918183  normal  0.0405313 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0038  transcriptional regulator, PadR-like family  37.76 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0379  transcriptional regulator, PadR-like family  30.18 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  28.12 
 
 		 168 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3223  transcriptional regulator, PadR-like family  25.85 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4159  transcriptional regulator, PadR-like family  32.74 
 
 		 176 aa  57.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2658  hypothetical protein  25 
 
 		 165 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287076  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2669  hypothetical protein  25.15 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.010535 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1365  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  37.21 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 110 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  38.37 
 
 		 110 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2376  hypothetical protein  24.4 
 
 		 165 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247862  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  31.1 
 
 		 176 aa  54.3  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  38.37 
 
 		 110 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2451  hypothetical protein  24.4 
 
 		 165 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.073124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2413  hypothetical protein  24.4 
 
 		 165 aa  53.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000015361  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2649  hypothetical protein  24.4 
 
 		 165 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115894 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2631  hypothetical protein  24.4 
 
 		 165 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  35.23 
 
 		 112 aa  53.5  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2509  PadR-like family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 165 aa  53.5  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 168 aa  53.1  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0680  PadR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 179 aa  53.1  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1910  PadR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 174 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5624  transcriptional regulator, PadR-like family  34.34 
 
 		 191 aa  52.8  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 179 aa  53.1  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  23.95 
 
 		 165 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  38.36 
 
 		 114 aa  52.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  29.73 
 
 		 179 aa  52.4  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7568  transcriptional regulator, PadR-like family  40.91 
 
 		 277 aa  52  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0565  PadR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 154 aa  52  0.000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0865  hypothetical protein  39.47 
 
 		 179 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4689  transcriptional regulator  37.65 
 
 		 177 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284032  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  33.04 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0106416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 110 aa  52  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2396  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 111 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.109028  normal  0.171865 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3512  transcriptional repressor PadR  33.33 
 
 		 179 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2496  transcriptional regulator, PadR-like family  28.49 
 
 		 177 aa  50.8  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0617263  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1999  transcriptional regulator, PadR-like family  40.45 
 
 		 198 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.893773  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4125  hypothetical protein  23.86 
 
 		 185 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0396692  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4102  transcriptional regulator, PadR-like family  36.17 
 
 		 277 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.615501 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0172  PadR-like family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 242 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3551  transcriptional regulator, PadR-like family  27.98 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4083  PadR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 110 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  35.44 
 
 		 107 aa  50.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  34.86 
 
 		 180 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5903  transcriptional regulator, PadR-like family  39.73 
 
 		 316 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33122  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  25.93 
 
 		 179 aa  50.1  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3121  transcriptional regulator, PadR-like family  37.04 
 
 		 191 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 152 aa  49.7  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  38.36 
 
 		 263 aa  49.7  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1562  transcriptional regulator, PadR-like family  35.87 
 
 		 186 aa  49.7  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.553173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1578  PadR-like family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 185 aa  50.1  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59882  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1415  transcriptional regulator, PadR-like family  29.24 
 
 		 194 aa  49.7  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0975835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3830  PadR-like family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 185 aa  49.3  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.037852  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1777  hypothetical protein  28.48 
 
 		 176 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.354573 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  35.24 
 
 		 205 aa  49.7  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4316  transcriptional regulator, PadR family  34.09 
 
 		 105 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4871  PadR family transcriptional regulator  30 
 
 		 220 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4960  PadR family transcriptional regulator  30 
 
 		 220 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1537  PadR-like family transcriptional regulator  30 
 
 		 181 aa  49.3  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708005 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4156  transcriptional regulator, PadR family  34.88 
 
 		 110 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.20651  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3678  transcriptional regulator, PadR-like family  43.28 
 
 		 238 aa  48.9  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1946  transcriptional regulator, PadR family  32.1 
 
 		 179 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>