More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4745 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4745  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
769 aa  1557  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4192  Peptidoglycan glycosyltransferase  56.92 
 
 
950 aa  654  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.495608  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5461  glycosyl transferase family protein  51.47 
 
 
806 aa  611  1e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5372  glycosyl transferase family protein  51.47 
 
 
806 aa  611  1e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187051  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5748  glycosyl transferase family protein  51.47 
 
 
806 aa  611  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.409444 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10049  bifunctional penicillin-binding protein 1A/1B ponA1: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  50.21 
 
 
821 aa  602  1e-171  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.57903  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6036  glycosyl transferase family protein  52.72 
 
 
830 aa  574  1e-162  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852412  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0871  glycosyl transferase family protein  50.45 
 
 
815 aa  570  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5071  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.61 
 
 
725 aa  408  1e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404123  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39340  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  39.76 
 
 
814 aa  386  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.794703 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2135  glycosyl transferase family protein  40.41 
 
 
695 aa  375  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194507  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7034  glycosyl transferase family 51  37.73 
 
 
838 aa  342  1e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31830  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  35.86 
 
 
859 aa  317  7e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4560  glycosyl transferase family protein  34.79 
 
 
975 aa  306  1e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5078  glycosyl transferase family protein  35.06 
 
 
979 aa  306  1e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000111802 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3106  family 51 glycosyl transferase  35.62 
 
 
719 aa  301  3e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265076  hitchhiker  0.000700529 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2526  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.69 
 
 
764 aa  300  6e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7315  glycosyl transferase family protein  34.42 
 
 
1245 aa  300  8e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.508122  normal  0.0712916 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37820  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  35.06 
 
 
890 aa  294  4e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603691  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4676  glycosyl transferase family protein  32.68 
 
 
778 aa  293  8e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4182  glycosyl transferase family 51  35.16 
 
 
836 aa  289  1e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4526  glycosyl transferase family protein  35.51 
 
 
1065 aa  289  1e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  34.82 
 
 
761 aa  288  3e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4955  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.87 
 
 
747 aa  286  7e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8542  membrane carboxypeptidase  35.7 
 
 
724 aa  285  3e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3357  glycosyl transferase family 51  34.08 
 
 
825 aa  267  5e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4341  glycosyl transferase family 51  34.07 
 
 
764 aa  265  3e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00883822  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5193  glycosyl transferase family 51  34.52 
 
 
752 aa  265  4e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272717  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1278  membrane carboxypeptidase  32.14 
 
 
727 aa  263  1e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0570  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  31.71 
 
 
1129 aa  263  1e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  31.23 
 
 
681 aa  261  3e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  32.69 
 
 
770 aa  261  3e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1268  glycosyl transferase family 51  36.16 
 
 
1306 aa  261  3e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.796636  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3701  glycosyl transferase family 51  35.24 
 
 
803 aa  260  5e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3356  glycosyl transferase family 51  31.31 
 
 
808 aa  259  1e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5918  glycosyl transferase family 51  31.73 
 
 
927 aa  259  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0388  glycosyl transferase family 51  32.93 
 
 
1117 aa  258  4e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.62292  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5853  glycosyl transferase family protein  33.08 
 
 
819 aa  257  6e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698953  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  32.08 
 
 
723 aa  257  6e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0754  twin-arginine translocation pathway signal  33.57 
 
 
880 aa  256  1e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  31.38 
 
 
905 aa  255  2e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  31.74 
 
 
730 aa  253  9e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  31.6 
 
 
763 aa  252  2e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  29.95 
 
 
683 aa  251  4e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9363  Membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)-like protein  32.44 
 
 
822 aa  246  1e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  29.97 
 
 
683 aa  245  2e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  29.97 
 
 
683 aa  244  3e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5307  glycosyl transferase family 51  32.26 
 
 
789 aa  245  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.93625 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  33 
 
 
712 aa  243  7e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0250  glycosyl transferase family 51  31.69 
 
 
892 aa  243  8e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0340145 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  30.1 
 
 
683 aa  243  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  30.1 
 
 
683 aa  243  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  30.73 
 
 
683 aa  241  3e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  31.53 
 
 
658 aa  241  4e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  29.22 
 
 
683 aa  241  5e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  30.24 
 
 
683 aa  241  5e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  29.93 
 
 
683 aa  240  6e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  30.12 
 
 
683 aa  240  8e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  30.12 
 
 
683 aa  240  8e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  29.8 
 
 
683 aa  239  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  32.41 
 
 
722 aa  239  2e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1310  penicillin-binding protein 1A  32.96 
 
 
704 aa  238  3e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.028236  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  32.6 
 
 
661 aa  237  6e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  31.8 
 
 
784 aa  236  1e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  31.8 
 
 
649 aa  234  4e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  31.41 
 
 
643 aa  233  7e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  31.41 
 
 
643 aa  233  7e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0109  PASTA  32.61 
 
 
801 aa  233  8e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820003  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1277  transglycosylase  30.82 
 
 
774 aa  233  1e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  30.61 
 
 
643 aa  232  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  28.85 
 
 
806 aa  231  3e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  29.79 
 
 
626 aa  231  4e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1399  glycosyl transferase family 51  31.96 
 
 
807 aa  231  4e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248953  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3542  penicillin-binding protein, 1A family  34 
 
 
817 aa  231  4e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  34.03 
 
 
761 aa  231  4e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3097  putative penicillin-binding protein  29.94 
 
 
961 aa  231  5e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1108  glycosyl transferase family protein  34.76 
 
 
678 aa  230  6e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  29.28 
 
 
776 aa  230  9e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  30.53 
 
 
734 aa  229  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04231  putative penicillin binding protein  31.54 
 
 
602 aa  229  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2817  1A family penicillin-binding protein  30.75 
 
 
709 aa  228  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515125  normal  0.127975 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  31.59 
 
 
775 aa  228  5e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  3.21042e-11 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  30.14 
 
 
648 aa  226  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  29.46 
 
 
779 aa  226  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  29.53 
 
 
680 aa  226  2e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  32.4 
 
 
732 aa  226  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  30.38 
 
 
739 aa  226  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1510  penicillin-binding protein  31.1 
 
 
680 aa  225  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00148274  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1180  1A family penicillin-binding protein  30.25 
 
 
679 aa  224  7e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000474619  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  30.83 
 
 
735 aa  224  7e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1578  penicillin-binding protein  31.55 
 
 
680 aa  223  8e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315585  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  32.14 
 
 
710 aa  223  1e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1616  penicillin-binding protein  31.39 
 
 
680 aa  223  1e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  8.66869e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2004  glycosyl transferase family protein  30.76 
 
 
820 aa  222  2e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  29.12 
 
 
727 aa  223  2e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  30.05 
 
 
776 aa  222  2e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  30.82 
 
 
676 aa  221  3e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  31.32 
 
 
757 aa  222  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  31.9 
 
 
750 aa  221  3e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1336  penicillin-binding protein 2A  31.22 
 
 
680 aa  221  4e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  6.91863e-06  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>