61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4690 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4690  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 351 aa  711    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1221  radical SAM domain-containing protein  77.14 
 
 		 356 aa  531  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142364 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2060  Radical SAM domain protein  65.36 
 
 		 374 aa  468  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6661  radical SAM domain-containing protein  63.31 
 
 		 337 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000604358  normal  0.799079 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5394  Radical SAM domain protein  49.26 
 
 		 367 aa  286  4e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.313238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0057  Radical SAM domain protein  48.96 
 
 		 367 aa  285  7e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615692  normal  0.0888986 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2620  Radical SAM domain protein  49.41 
 
 		 371 aa  282  6.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0246  radical SAM domain-containing protein  50.45 
 
 		 367 aa  282  8.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1993  Radical SAM domain protein  50.91 
 
 		 370 aa  281  1e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1409  hypothetical protein  45.54 
 
 		 356 aa  276  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2714  Radical SAM domain protein  45.54 
 
 		 356 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4562  radical SAM domain-containing protein  43.1 
 
 		 360 aa  267  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.343645  normal  0.720303 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13141  hypothetical protein  40.91 
 
 		 362 aa  266  4e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4750  Radical SAM domain protein  47.81 
 
 		 379 aa  265  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0838  Elongator protein 3/MiaB/NifB  44.15 
 
 		 365 aa  265  1e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.195743  normal  0.168484 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3477  hypothetical protein  44.94 
 
 		 359 aa  263  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0560  Radical SAM domain protein  43.22 
 
 		 360 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7577  Biotin synthase-related enzyme  49.64 
 
 		 323 aa  262  8e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2103  radical SAM domain-containing protein  45.4 
 
 		 362 aa  253  3e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.938739  normal  0.248825 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1109  Elongator protein 3/MiaB/NifB  42.4 
 
 		 362 aa  251  1e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1164  Radical SAM domain protein  30.12 
 
 		 331 aa  96.7  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2046  radical SAM domain-containing protein  30.35 
 
 		 331 aa  93.6  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0394  radical SAM domain-containing protein  28.63 
 
 		 322 aa  89.4  9e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2001  radical SAM domain-containing protein  26.54 
 
 		 377 aa  86.7  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2197  radical SAM family protein  24.51 
 
 		 330 aa  80.1  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.804971  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0230  hypothetical protein  25.54 
 
 		 343 aa  79.7  0.00000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0844  radical SAM domain-containing protein  27.43 
 
 		 421 aa  75.1  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.757233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0963  hypothetical protein  24.54 
 
 		 380 aa  74.7  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0756  hypothetical protein  24.46 
 
 		 331 aa  73.2  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000116616 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0775  radical SAM domain-containing protein  24.06 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2885  Radical SAM domain protein  23.51 
 
 		 405 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.806461  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1803  radical SAM family protein  24.8 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1662  radical SAM family Fe-S protein  23.4 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0596  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.351823  normal  0.189258 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0445  radical SAM family protein  37.5 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1508  radical SAM domain-containing protein  24.24 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1131  biotin synthase  23.11 
 
 		 341 aa  55.5  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2257  radical SAM family Fe-S protein  23.61 
 
 		 446 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.452543  normal  0.874565 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1727  hypothetical protein  24.55 
 
 		 421 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0631  radical SAM domain-containing protein  24.53 
 
 		 314 aa  54.3  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0187035  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2140  Radical SAM domain protein  22.83 
 
 		 323 aa  52.8  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5825  hypothetical protein  24.87 
 
 		 433 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.952499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2204  radical SAM domain protein  25.76 
 
 		 383 aa  50.8  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0028  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 368 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6000  radical SAM domain-containing protein  23.9 
 
 		 380 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0196  hypothetical protein  22.31 
 
 		 401 aa  49.7  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2088  Radical SAM domain protein  29.31 
 
 		 351 aa  48.1  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2543  radical SAM domain protein  23.97 
 
 		 378 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2171  Radical SAM domain protein  23.97 
 
 		 378 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00159358  decreased coverage  0.000000000651126 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2747  hypothetical protein  26.98 
 
 		 401 aa  48.5  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0270  hypothetical protein  22.22 
 
 		 405 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.901692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0644  Radical SAM domain protein  24.06 
 
 		 390 aa  46.2  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.14053  normal  0.0928811 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0033  radical SAM domain-containing protein  22.22 
 
 		 296 aa  45.1  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.531209  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1052  Radical SAM domain protein  26.13 
 
 		 366 aa  44.7  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1552  lipoyl synthase  26.06 
 
 		 368 aa  44.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3791  lipoyl synthase  21.91 
 
 		 350 aa  44.3  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0826  biotin synthase  22.95 
 
 		 341 aa  43.9  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247996  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  33.78 
 
 		 792 aa  43.9  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  30.68 
 
 		 838 aa  42.7  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0899  lipoic acid synthetase  24.12 
 
 		 285 aa  42.7  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0672  lipoyl synthase  25.52 
 
 		 308 aa  42.7  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.61797  normal  0.208975 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>