233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4689 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4689  AIR synthase related protein  100 
 
 
481 aa  948    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1220  GCN5-related N-acetyltransferase  63.66 
 
 
471 aa  526  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.104607 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6662  GCN5-related N-acetyltransferase  57.17 
 
 
486 aa  460  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0223324  normal  0.900242 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2059  GCN5-related N-acetyltransferase  57.89 
 
 
479 aa  436  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1111  hypothetical protein  38.36 
 
 
325 aa  142  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.40084 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7579  selenophosphate synthetase-related protein  37.95 
 
 
328 aa  140  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131257  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13161  hypothetical protein  34.45 
 
 
326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1995  AIR synthase related protein  37.84 
 
 
323 aa  136  9e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3475  hypothetical protein  35.06 
 
 
342 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.451422  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4748  AIR synthase related protein  37.61 
 
 
334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0560199  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1073  AIR synthase related protein  29.87 
 
 
338 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.145823  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0496  hypothetical protein  33.89 
 
 
331 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2622  AIR synthase related protein domain protein  37.13 
 
 
328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0762  AIR synthase-like protein  32.89 
 
 
321 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.353751  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0248  AIR synthase related protein  37.44 
 
 
331 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.484423  normal  0.676888 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0836  hypothetical protein  32.64 
 
 
338 aa  129  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0191838  normal  0.261675 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0917  AIR synthase related protein  34.03 
 
 
333 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0496  AIR synthase related protein  28.46 
 
 
324 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4564  AIR synthase-like protein  34.63 
 
 
328 aa  127  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.299231  normal  0.430179 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1750  methanogenesis marker protein 2  31.5 
 
 
330 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2712  AIR synthase related protein domain protein  34.31 
 
 
327 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0832  AIR synthase-like protein  31.02 
 
 
336 aa  124  5e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.786385  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0059  AIR synthase related protein  34.82 
 
 
331 aa  123  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.148611  normal  0.181031 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1411  putative thiamine-monophosphate kinase  33.2 
 
 
327 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0558  AIR synthase related protein  35.56 
 
 
332 aa  122  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2101  AIR synthase related protein  33.2 
 
 
341 aa  122  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.183279 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5396  AIR synthase related protein  34.04 
 
 
331 aa  121  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0044  AIR synthase related protein  32.3 
 
 
327 aa  113  6e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0844  AIR synthase related protein  30.97 
 
 
323 aa  113  9e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223576  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0779  AIR synthase related protein  32.3 
 
 
323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.278492  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1139  methanogenesis marker protein 2  29.89 
 
 
327 aa  111  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0131  thiamin-monophosphate kinase  29.25 
 
 
326 aa  111  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1267  AIR synthase related protein  29.69 
 
 
331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  28.27 
 
 
332 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  29.76 
 
 
323 aa  72  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0559  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4465  thiamine-monophosphate kinase  34.6 
 
 
325 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269077  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6802  thiamine-monophosphate kinase  32.66 
 
 
328 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.826688 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1820  AIR synthase-like protein  26.39 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.79718  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  29.21 
 
 
324 aa  66.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2621  GCN5-related N-acetyltransferase  34.44 
 
 
196 aa  64.7  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1987  selenide, water dikinase  33.02 
 
 
319 aa  63.5  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2102  GCN5-related N-acetyltransferase  34.44 
 
 
185 aa  63.2  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.442878  normal  0.229032 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3476  hypothetical protein  33.97 
 
 
195 aa  63.5  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0493  thiamine monophosphate kinase  27.97 
 
 
329 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0477  thiamine-monophosphate kinase  23.66 
 
 
306 aa  62.8  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4456  thiamine-monophosphate kinase  37.86 
 
 
329 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1455  thiamine-monophosphate kinase  30.11 
 
 
327 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0812  thiamine-monophosphate kinase  27.27 
 
 
346 aa  61.6  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4320  thiamine-monophosphate kinase  37.86 
 
 
329 aa  60.8  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.267415  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5395  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
181 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4563  GCN5-related N-acetyltransferase  35.21 
 
 
187 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220233  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4475  thiamine-monophosphate kinase  37.14 
 
 
329 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.599379  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0058  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
180 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.23701  normal  0.118558 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2713  GCN5-related N-acetyltransferase  34.53 
 
 
203 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0460  thiamine-monophosphate kinase  31.68 
 
 
315 aa  57.8  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0376  thiamine-monophosphate kinase  31.68 
 
 
315 aa  57  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0343133 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4749  GCN5-related N-acetyltransferase  34.67 
 
 
181 aa  56.6  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.279327  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1410  hypothetical protein  34.53 
 
 
201 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0702  thiamine monophosphate kinase  26.71 
 
 
277 aa  55.8  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1994  GCN5-related N-acetyltransferase  34.11 
 
 
179 aa  56.2  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1093  thiamine-monophosphate kinase  29.28 
 
 
325 aa  56.6  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0247  GCN5-related N-acetyltransferase  30.36 
 
 
180 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293456  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0773  thiamine monophosphate kinase  31.03 
 
 
273 aa  56.2  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0038  AIR synthase related protein  26.26 
 
 
293 aa  56.2  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0184186  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  30 
 
 
316 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1031  thiamine monophosphate kinase  26.62 
 
 
275 aa  55.1  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.7438  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3484  thiamine-monophosphate kinase  29.82 
 
 
325 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  28.11 
 
 
338 aa  55.1  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1543  thiamine-monophosphate kinase  29.7 
 
 
314 aa  55.1  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1457  AIR synthase related protein domain protein  25.28 
 
 
325 aa  54.3  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00681323  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0130  AIR synthase-like protein  27.43 
 
 
293 aa  54.7  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.633994  normal  0.0459155 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3160  thiamine-monophosphate kinase  29.82 
 
 
325 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.172815  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1925  selenophosphate synthase  29.76 
 
 
349 aa  54.7  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3356  thiamine-monophosphate kinase  30.4 
 
 
325 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0794  thiamine-monophosphate kinase  26.76 
 
 
318 aa  53.5  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0837  hypothetical protein  33.96 
 
 
210 aa  53.5  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0565893  normal  0.217195 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4031  thiamine monophosphate kinase  29.57 
 
 
341 aa  53.5  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0483109  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1068  thiamine-monophosphate kinase  30.13 
 
 
304 aa  53.5  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.794513  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  27.92 
 
 
344 aa  53.5  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1773  AIR synthase-like protein  26.86 
 
 
293 aa  53.5  0.000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0884  selenide, water dikinase  30 
 
 
344 aa  53.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000463593 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7541  thiamine-monophosphate kinase  31.22 
 
 
330 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.301752  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2509  thiamine-monophosphate kinase  33.15 
 
 
309 aa  53.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0452713  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0895  thiamine-monophosphate kinase  32.58 
 
 
324 aa  52.8  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0369638  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11290  selenium donor protein  27.95 
 
 
321 aa  52.8  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.327064 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0690  AIR synthase-like protein  26.82 
 
 
293 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.10679  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  26.76 
 
 
319 aa  52.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1244  thiamine-monophosphate kinase  28.37 
 
 
313 aa  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3443  thiamine-monophosphate kinase  31.51 
 
 
315 aa  52.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0088  thiamine monophosphate kinase  27.97 
 
 
272 aa  52  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  27.9 
 
 
333 aa  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  25.93 
 
 
318 aa  51.6  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1852  hydrogenase expression/formation protein  25.58 
 
 
347 aa  51.6  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.138708  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2605  thiamine-monophosphate kinase  30.11 
 
 
286 aa  51.6  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3919  thiamine-monophosphate kinase  31.64 
 
 
331 aa  51.6  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0436  succinate dehydrogenase  26.52 
 
 
286 aa  52  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0447  thiamine-monophosphate kinase  31.82 
 
 
315 aa  51.6  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  26.62 
 
 
358 aa  51.2  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1035  thiamin-monophosphate kinase  33.03 
 
 
340 aa  51.2  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>