More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4530 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4530  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 444 aa  858    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0210  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 476 aa  375  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4887  major facilitator superfamily MFS_1  53 
 
 		 424 aa  363  3e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2819  major facilitator superfamily MFS_1  48.11 
 
 		 462 aa  326  6e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000630163  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4147  H+ antiporter protein  44.69 
 
 		 424 aa  323  5e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4301  H+ antiporter protein  44.69 
 
 		 424 aa  323  5e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0532  major facilitator superfamily MFS_1  44.36 
 
 		 428 aa  322  7e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4580  H+ antiporter protein  45.65 
 
 		 443 aa  316  6e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120622 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0310  major facilitator transporter  43.15 
 
 		 443 aa  300  3e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14790  Major Facilitator Superfamily transporter  41.78 
 
 		 464 aa  271  1e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.13794 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  25.06 
 
 		 412 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0062  putative membrane transport protein  28.61 
 
 		 418 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  25.92 
 
 		 420 aa  106  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  23.98 
 
 		 433 aa  100  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 429 aa  98.2  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0885  major facilitator transporter  26.41 
 
 		 415 aa  95.1  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  25.52 
 
 		 418 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3575  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 		 416 aa  92.8  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0805  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 459 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0062  major facilitator superfamily protein  27.57 
 
 		 431 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4138  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 435 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1062  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 423 aa  83.2  0.000000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.264864  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  24.85 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 		 433 aa  82  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  22.63 
 
 		 444 aa  82  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 474 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  23.7 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1864  major facilitator transporter  23.73 
 
 		 417 aa  80.1  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.436032 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 		 412 aa  79.7  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 426 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  24.14 
 
 		 426 aa  79  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  27.2 
 
 		 418 aa  78.6  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  24.22 
 
 		 420 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  21.46 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  24.22 
 
 		 420 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  24.22 
 
 		 420 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  24.85 
 
 		 420 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  22.55 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 408 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0871  macrolide efflux protein, putative  25.31 
 
 		 394 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2989  putative permease  23.8 
 
 		 362 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  21.71 
 
 		 413 aa  76.3  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  23.93 
 
 		 420 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  21.71 
 
 		 413 aa  76.3  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  23.95 
 
 		 412 aa  76.3  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  23.8 
 
 		 404 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  23.91 
 
 		 420 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  25.52 
 
 		 431 aa  75.5  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  24.1 
 
 		 420 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  23.45 
 
 		 424 aa  74.7  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  24.68 
 
 		 420 aa  74.3  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  22.69 
 
 		 432 aa  74.7  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 		 494 aa  74.3  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4925  major facilitator superfamily MFS_1  27.57 
 
 		 420 aa  73.9  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  normal  0.164864 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 450 aa  73.9  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0534  hypothetical protein  26.1 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  21.92 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  21.04 
 
 		 423 aa  73.6  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  21.92 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4750  major facilitator transporter  22.95 
 
 		 415 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  24.1 
 
 		 420 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  25.88 
 
 		 453 aa  73.2  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  22.3 
 
 		 406 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5069  putative transporter  21.25 
 
 		 415 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  22.92 
 
 		 474 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4800  transporter  21.53 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2984  putative permease  22.3 
 
 		 404 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000116191 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4642  transporter  22.47 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5040  putative transporter  21.53 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4661  transporter  21.53 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5163  transporter  21.53 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  22.01 
 
 		 390 aa  72  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  22.01 
 
 		 390 aa  72  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1625  major facilitator transporter  24.54 
 
 		 417 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.568704  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 		 461 aa  71.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  23.15 
 
 		 421 aa  71.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5067  transporter, putative  23.16 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0174  putative transporter  22.95 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5073  putative transporter  21.53 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  27.5 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  24.23 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2526  H+ Antiporter protein  27.3 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000735797  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 435 aa  70.5  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 416 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5551  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 		 420 aa  69.7  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138486  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3679  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 		 410 aa  68.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.709991  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2699  permease, putative  19.9 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000249599  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 		 432 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2925  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 425 aa  68.6  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2289  major facilitator transporter  27.05 
 
 		 432 aa  68.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.995339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  26.41 
 
 		 418 aa  68.6  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0092  major facilitator superfamily MFS_1  29.28 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.031642  normal  0.214383 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3541  major facilitator transporter  21.53 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  23.52 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1662  major facilitator superfamily MFS_1  20.26 
 
 		 405 aa  68.2  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0772  major facilitator superfamily MFS_1  25.32 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 463 aa  67.8  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  24.37 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>