33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4487 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4487  fatty acid hydroxylase  100 
 
 
244 aa  483  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2728  fatty acid hydroxylase  61.21 
 
 
224 aa  275  5e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32022  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2772  fatty acid hydroxylase  61.21 
 
 
224 aa  275  5e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.626718  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2758  fatty acid hydroxylase  62.15 
 
 
224 aa  274  9e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.85391  normal  0.349911 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2943  fatty acid hydroxylase  60.28 
 
 
221 aa  268  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0607383  normal  0.39522 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0010  fatty acid hydroxylase  52.65 
 
 
246 aa  257  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7455  fatty acid hydroxylase  39.82 
 
 
252 aa  145  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.084393  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3875  fatty acid hydroxylase  38.65 
 
 
287 aa  124  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0850  fatty acid hydroxylase  38.73 
 
 
250 aa  121  9e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0804636  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1724  fatty acid hydroxylase-like protein  32.35 
 
 
209 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0138554  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1516  fatty acid hydroxylase-like protein  32.52 
 
 
209 aa  95.9  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.567618  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1478  fatty acid hydroxylase FAH1P  33.33 
 
 
209 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1633  fatty acid hydroxylase-like protein  32.52 
 
 
209 aa  95.9  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1775  fatty acid hydroxylase-like protein  33 
 
 
209 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.267446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1488  fatty acid hydroxylase FAH1P  33 
 
 
209 aa  95.1  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00473725  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5647  fatty acid hydroxylase  31.4 
 
 
210 aa  94.4  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.220259 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1701  fatty acid hydroxylase-like protein  32.04 
 
 
209 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1521  fatty acid hydroxylase  30.73 
 
 
209 aa  93.6  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1670  fatty acid hydroxylase-like protein  30.73 
 
 
209 aa  92  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4993  fatty acid hydroxylase  36.27 
 
 
221 aa  88.2  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.655235  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3674  fatty acid hydroxylase-like protein  31.61 
 
 
209 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.236693  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3415  fatty acid hydroxylase  28.83 
 
 
260 aa  57.8  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1979  fatty acid hydroxylase  33 
 
 
240 aa  58.2  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.919937  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3907  fatty acid hydroxylase  26.92 
 
 
276 aa  52.4  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.544374  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0498  fatty acid hydroxylase  29.32 
 
 
220 aa  52.4  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0787  hypothetical protein  22.99 
 
 
271 aa  50.1  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399793  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3325  hypothetical protein  23.11 
 
 
277 aa  48.5  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.038125  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2889  fatty acid hydroxylase  20.83 
 
 
272 aa  48.1  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00520579  normal  0.0784368 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2648  hypothetical protein  26.41 
 
 
228 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.437546  normal  0.57129 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0011  fatty acid hydroxylase  23.31 
 
 
209 aa  44.3  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0294  fatty acid hydroxylase  28.48 
 
 
182 aa  43.1  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00278086  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33435  predicted protein  23.75 
 
 
265 aa  43.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3036  fatty acid hydroxylase  26.45 
 
 
222 aa  42.7  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>