More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4469 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4469  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
387 aa  770    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0769269  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0402  glycosyl transferase group 1  61.73 
 
 
380 aa  441  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0209  glycosyl transferase, group 1  60.43 
 
 
386 aa  435  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.959787  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0229  glycosyl transferase, group 1  60.43 
 
 
386 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0736189  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0242  glycosyl transferase, group 1  57.52 
 
 
386 aa  429  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.19746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0426  glycosyl transferase, group 1  56.73 
 
 
386 aa  425  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10227  hypothetical protein  56.36 
 
 
384 aa  424  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.990297  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0219  glycosyl transferase, group 1  58.57 
 
 
360 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0211  glycosyl transferase group 1  44.62 
 
 
393 aa  295  6e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0193  glycosyl transferase, group 1  43.83 
 
 
398 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3000  glycosyl transferase, group 1  47.97 
 
 
384 aa  279  7e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0763479  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3993  glycosyl transferase group 1  35.85 
 
 
392 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.083077  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5675  glycosyl transferase group 1  34.39 
 
 
388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.333063 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3707  glycosyl transferase group 1  35.05 
 
 
468 aa  162  7e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271047  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0804  group 1 glycosyl transferase  35.23 
 
 
425 aa  161  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.817981  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2468  putative glycosyltransferase  36.41 
 
 
448 aa  159  7e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0230  glycosyl transferase group 1  34.82 
 
 
499 aa  156  6e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4957  glycosyl transferase group 1  36.2 
 
 
518 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0837434  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1051  glycosyl transferase, group 1  31.56 
 
 
445 aa  153  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5300  glycosyl transferase group 1  35 
 
 
565 aa  153  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.225407  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1470  Glycosyltransferase-like protein  35.06 
 
 
440 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5500  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 
455 aa  151  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0983279 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  29.76 
 
 
361 aa  147  5e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1008  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 
353 aa  145  9e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000479257  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0483  glycosyl transferase, group 1  28.38 
 
 
370 aa  142  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1844  glycosyl transferase, group 1  27.66 
 
 
348 aa  124  3e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0112136  normal  0.849327 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1167  glycosyl transferase, group 1  33.41 
 
 
605 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290628  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0156  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 
359 aa  111  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0588  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 
349 aa  102  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00564235  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  26.95 
 
 
389 aa  96.3  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  32.44 
 
 
353 aa  95.1  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  32.42 
 
 
426 aa  90.1  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  27.66 
 
 
363 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  33.03 
 
 
367 aa  88.6  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  26.15 
 
 
935 aa  87.4  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0431  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 
380 aa  87.4  3e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.16111  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 
382 aa  87.4  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  26.16 
 
 
371 aa  87  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0587  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  25.9 
 
 
490 aa  86.7  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0601  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  25.9 
 
 
490 aa  86.7  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.86353  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2134  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 
370 aa  86.3  9e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1731  N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol biosynthetic protein  21.89 
 
 
376 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.183221  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  32.61 
 
 
346 aa  85.9  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
396 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 
371 aa  82.4  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2630  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 
438 aa  80.1  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.451665  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0588  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  21.94 
 
 
496 aa  80.1  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.409757  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0602  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  21.94 
 
 
496 aa  80.1  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.655223  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  24.75 
 
 
371 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0526  glycosyl transferase, group 1  26.87 
 
 
363 aa  79.7  0.00000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.548625  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0984  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
403 aa  79.3  0.00000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137415 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0208  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.31 
 
 
500 aa  78.6  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.1 
 
 
407 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  23.84 
 
 
359 aa  77.8  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 
392 aa  77.8  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  22.98 
 
 
373 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3565  glycosyl transferase group 1  31.49 
 
 
390 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  24.58 
 
 
393 aa  76.6  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  25.94 
 
 
386 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0375  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 
383 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2773  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 
385 aa  75.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  20.93 
 
 
375 aa  75.9  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.78 
 
 
409 aa  75.5  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  33.71 
 
 
396 aa  75.1  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  34.17 
 
 
363 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  31.29 
 
 
476 aa  74.3  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2666  group 1 glycosyl transferase  29.21 
 
 
367 aa  74.3  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.882197  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 
381 aa  73.9  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  35.68 
 
 
405 aa  73.9  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  33.5 
 
 
370 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  29.6 
 
 
419 aa  73.6  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0080  hypothetical protein  29.12 
 
 
513 aa  73.6  0.000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  32.03 
 
 
457 aa  73.6  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  25.8 
 
 
392 aa  73.2  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 
414 aa  73.2  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  30.11 
 
 
373 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 
366 aa  72.8  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 
373 aa  72.4  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  28.82 
 
 
366 aa  72.4  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1803  glycosyl transferase, group 1  28.7 
 
 
409 aa  72.8  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  33.13 
 
 
377 aa  72  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  31.19 
 
 
770 aa  72  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 
396 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 
380 aa  71.6  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  30.59 
 
 
448 aa  71.6  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  25.37 
 
 
360 aa  71.6  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2204  glycosyl transferase group 1  35.75 
 
 
372 aa  71.2  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  30.47 
 
 
377 aa  71.2  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  33.74 
 
 
374 aa  70.9  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  30.8 
 
 
423 aa  70.9  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  32.35 
 
 
383 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.07 
 
 
380 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  26.73 
 
 
427 aa  70.9  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 
435 aa  70.9  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14750  glycosyltransferase  29.81 
 
 
743 aa  70.9  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00041718 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  26.7 
 
 
391 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  30.11 
 
 
409 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  32.34 
 
 
420 aa  70.5  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0972  glycosyl transferase, group 1  26.61 
 
 
379 aa  70.5  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.775545  normal  0.23686 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2561  glycosyl transferase, group 1  22.14 
 
 
355 aa  70.1  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>