More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4430 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4430  PDZ/DHR/GLGF domain protein  100 
 
 
338 aa  646    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0225  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  54.14 
 
 
365 aa  335  7e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6331  2-alkenal reductase  51.69 
 
 
372 aa  334  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1988  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  56.61 
 
 
347 aa  314  9.999999999999999e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.968187  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0601  PDZ/DHR/GLGF  50.17 
 
 
361 aa  263  2e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.367147  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0667  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.32 
 
 
376 aa  258  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  41.67 
 
 
513 aa  207  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4344  2-alkenal reductase  41.32 
 
 
382 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  36.96 
 
 
403 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  36.96 
 
 
407 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  36.59 
 
 
407 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  39.57 
 
 
526 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  41.54 
 
 
483 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.87 
 
 
398 aa  189  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1605  2-alkenal reductase  38.99 
 
 
385 aa  189  5.999999999999999e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436797 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  39.49 
 
 
528 aa  189  8e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  36.96 
 
 
402 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3690  HtrA2 peptidase  42.5 
 
 
396 aa  187  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.104241  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  37.5 
 
 
398 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  40.22 
 
 
396 aa  187  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  40.81 
 
 
483 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  40.81 
 
 
483 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  36.96 
 
 
402 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  41.61 
 
 
508 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  36.96 
 
 
402 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  37.59 
 
 
404 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  36.96 
 
 
388 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1904  HtrA2 peptidase  39.07 
 
 
423 aa  187  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  36.96 
 
 
402 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  37.23 
 
 
403 aa  186  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  37.32 
 
 
402 aa  186  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1216  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.74 
 
 
401 aa  186  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  36.96 
 
 
402 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  41.22 
 
 
411 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  34.81 
 
 
452 aa  185  8e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.32 
 
 
401 aa  185  9e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  38.04 
 
 
456 aa  185  9e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  37.23 
 
 
404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2700  serine protease  36.59 
 
 
388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1196  protease Do  40.51 
 
 
451 aa  184  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  36.96 
 
 
401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.96 
 
 
401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.59 
 
 
401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1398  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.88 
 
 
349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.96 
 
 
401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  36.59 
 
 
401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  40.7 
 
 
385 aa  184  3e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  37.09 
 
 
467 aa  183  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  37.16 
 
 
453 aa  184  3e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  36.43 
 
 
459 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0769  endopeptidase  40.51 
 
 
451 aa  182  5.0000000000000004e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.5 
 
 
428 aa  182  6e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4323  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.43 
 
 
405 aa  182  8.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1183  HtrA2 peptidase  38.27 
 
 
386 aa  182  8.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  38.85 
 
 
491 aa  182  9.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0133  2-alkenal reductase  35.94 
 
 
392 aa  182  9.000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.14619 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1561  2-alkenal reductase  41.22 
 
 
402 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  36.17 
 
 
508 aa  182  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  40.73 
 
 
496 aa  182  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  38.99 
 
 
383 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  36.08 
 
 
459 aa  181  1e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  37.91 
 
 
408 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1398  protease Do  39.56 
 
 
496 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  37.06 
 
 
408 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0585  PDZ/DHR/GLGF  40.43 
 
 
406 aa  181  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357237  normal  0.0103671 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  39.07 
 
 
411 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  39.13 
 
 
527 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0807  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.59 
 
 
398 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3822  peptidase S1C, Do  38.99 
 
 
501 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  35.87 
 
 
387 aa  179  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  38.69 
 
 
502 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0645  peptidase  39.19 
 
 
509 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.146477 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0410  protease Do  38.83 
 
 
474 aa  179  5.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.134213  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.55 
 
 
380 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  38.89 
 
 
494 aa  179  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1192  protease Do  38.13 
 
 
493 aa  179  7e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0123913  normal  0.0156708 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0752  2-alkenal reductase  39.51 
 
 
372 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0327336 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.77 
 
 
385 aa  179  8e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98033  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  37.55 
 
 
477 aa  178  9e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  37.55 
 
 
477 aa  178  9e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3226  2-alkenal reductase  38.49 
 
 
403 aa  178  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1594  protease Do  38.1 
 
 
520 aa  178  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.81 
 
 
415 aa  178  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  39.07 
 
 
415 aa  178  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1270  serine protease  34.64 
 
 
442 aa  177  2e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000478038  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  36.5 
 
 
474 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1081  hypothetical protein  38.55 
 
 
507 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  38.32 
 
 
478 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2006  peptidase S1C, Do  38.52 
 
 
493 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  40.94 
 
 
509 aa  177  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2913  2-alkenal reductase  38.11 
 
 
393 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0108818  normal  0.221837 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  38.52 
 
 
493 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  36.13 
 
 
474 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  38.52 
 
 
493 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  37.87 
 
 
449 aa  177  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  38.15 
 
 
479 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2903  protease Do  38.32 
 
 
505 aa  176  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580104  normal  0.459508 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  37.32 
 
 
523 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.97 
 
 
442 aa  177  3e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0193596  normal  0.0193298 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3107  protease Do  38.1 
 
 
504 aa  177  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202807  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>