More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4399 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4399  Alkylglycerone-phosphate synthase  100 
 
 		 540 aa  1067    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1798  Alkylglycerone-phosphate synthase  60.31 
 
 		 528 aa  580  1e-164  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00290405  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2238  alkylglycerone-phosphate synthase  58.49 
 
 		 532 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.185547 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4590  FAD linked oxidase domain-containing protein  59.46 
 
 		 518 aa  543  1e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0387906  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1958  Alkylglycerone-phosphate synthase  59.07 
 
 		 531 aa  540  9.999999999999999e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.778758  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6682  Alkylglycerone-phosphate synthase  57.77 
 
 		 521 aa  528  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0557877  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3761  alkylglycerone-phosphate synthase  55.05 
 
 		 527 aa  503  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12280  flavoprotein  51.89 
 
 		 529 aa  495  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00816767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3385  alkylglycerone-phosphate synthase  54.39 
 
 		 525 aa  488  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3436  alkylglycerone-phosphate synthase  54.39 
 
 		 525 aa  488  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0692131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3374  alkylglycerone-phosphate synthase  54.39 
 
 		 525 aa  488  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2772  alkylglycerone-phosphate synthase  53.14 
 
 		 527 aa  476  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0943  FAD linked oxidase-like  53.73 
 
 		 545 aa  456  1e-127  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0368093  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2774  alkylglycerone-phosphate synthase  52.18 
 
 		 521 aa  455  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757745  hitchhiker  0.000882641 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5599  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.35 
 
 		 572 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0254483  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2577  alkylglycerone-phosphate synthase  52.58 
 
 		 520 aa  442  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0302  Alkylglycerone-phosphate synthase  51.35 
 
 		 524 aa  426  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.709623 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33270  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  49.01 
 
 		 534 aa  390  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.495555  normal  0.797078 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5413  Alkylglycerone-phosphate synthase  47.77 
 
 		 550 aa  378  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1669  alkylglycerone-phosphate synthase  41.84 
 
 		 556 aa  345  1e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.216533  normal  0.884657 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0358  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.48 
 
 		 533 aa  320  5e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000693187  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3149  FAD linked oxidase domain protein  38.39 
 
 		 552 aa  314  2.9999999999999996e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0907968  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27110  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  34.21 
 
 		 568 aa  306  8.000000000000001e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2132  hypothetical protein  38.52 
 
 		 531 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24940  hypothetical protein  38.52 
 
 		 531 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2176  oxidase, FAD-binding  32.26 
 
 		 563 aa  300  5e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000623586  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2658  FAD linked oxidase-like  36.47 
 
 		 584 aa  299  1e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128646  normal  0.201188 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0015  FAD linked oxidase-like  34.11 
 
 		 583 aa  298  1e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.344556 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1558  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.82 
 
 		 531 aa  294  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0927889 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1346  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.82 
 
 		 534 aa  293  7e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1001  FAD linked oxidase domain protein  34.92 
 
 		 554 aa  290  3e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4359  alkylglycerone-phosphate synthase  36.16 
 
 		 559 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19490  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  34.3 
 
 		 557 aa  281  2e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2332  FAD linked oxidase-like  36.55 
 
 		 538 aa  276  6e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16388  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0594  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.05 
 
 		 565 aa  271  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.227015 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0138  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, putative  30.2 
 
 		 586 aa  266  8.999999999999999e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.568715  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1045  FAD linked oxidase domain protein  41.21 
 
 		 546 aa  263  4.999999999999999e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0325485 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3390  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.54 
 
 		 579 aa  242  1e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6436  FAD linked oxidase domain protein  32.44 
 
 		 534 aa  240  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466111 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5107  FAD linked oxidase-like  33.4 
 
 		 534 aa  236  7e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.477653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3120  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.27 
 
 		 535 aa  233  8.000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0913078  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2483  FAD linked oxidase-like  32.98 
 
 		 502 aa  232  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146767  normal  0.0195086 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3350  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.26 
 
 		 536 aa  232  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0117199 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2614  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.97 
 
 		 564 aa  228  3e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.010282  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1454  FAD linked oxidase domain protein  36.5 
 
 		 531 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13124  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase agpS  35.11 
 
 		 527 aa  225  1e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1270  FAD linked oxidase-like  36.5 
 
 		 532 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544288 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8219  FAD linked oxidase domain protein  35.76 
 
 		 470 aa  224  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3848  FAD linked oxidase-like  36.19 
 
 		 532 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.16086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1372  alkylglycerone-phosphate synthase  32.74 
 
 		 465 aa  219  1e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.782717  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2454  Alkylglycerone-phosphate synthase  34.66 
 
 		 467 aa  211  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000169679  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4360  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.47 
 
 		 520 aa  208  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2462  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.28 
 
 		 516 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.806747  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5443  putative alkylglycerone-phosphate synthase  31.08 
 
 		 517 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1119  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.86 
 
 		 516 aa  188  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2080  FAD linked oxidase-like  34.25 
 
 		 520 aa  187  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270192  normal  0.562813 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4576  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.14 
 
 		 523 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539848  normal  0.906341 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1036  FAD linked oxidase-like  32.88 
 
 		 513 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44190  predicted protein  27.49 
 
 		 554 aa  182  1e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.694416  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1876  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.08 
 
 		 510 aa  180  5.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.606958  normal  0.0560108 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02617  predicted FAD containing dehydrogenase  29.53 
 
 		 484 aa  172  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0916  FAD linked oxidase domain protein  29.53 
 
 		 484 aa  172  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02580  hypothetical protein  29.53 
 
 		 484 aa  172  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2901  FAD binding domain-containing protein  29.53 
 
 		 484 aa  171  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2912  FAD binding domain-containing protein  29.53 
 
 		 484 aa  171  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0940  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.53 
 
 		 484 aa  171  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3074  FAD binding domain-containing protein  29.53 
 
 		 484 aa  171  4e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101156  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4029  FAD binding domain protein  29.33 
 
 		 484 aa  170  7e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.637066 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2461  alkylglycerone-phosphate synthase  29.5 
 
 		 484 aa  164  5.0000000000000005e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3321  FAD linked oxidase domain protein  36.42 
 
 		 572 aa  162  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0988206  normal  0.0174959 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3774  putative oxidoreductase  31.63 
 
 		 499 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0098375 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0202  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.86 
 
 		 473 aa  141  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.243944 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2367  FAD linked oxidase domain protein  26.48 
 
 		 451 aa  139  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2776  FAD linked oxidase domain protein  30.09 
 
 		 472 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1351  putative FAD-binding oxidoreductase  29.98 
 
 		 472 aa  133  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652696  normal  0.185636 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0982  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.73 
 
 		 472 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1292  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  30.97 
 
 		 469 aa  131  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0816  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.03 
 
 		 477 aa  131  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.513401  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2787  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  29.98 
 
 		 476 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1124  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.8 
 
 		 488 aa  130  9.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.945144  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.14 
 
 		 474 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_46355  predicted protein  30.66 
 
 		 458 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.111321  normal  0.450226 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0268  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  29.57 
 
 		 462 aa  126  8.000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.843143 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3295  putative glycolate oxidase subunit  30.54 
 
 		 469 aa  126  9e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1477  FAD linked oxidase-like  28.37 
 
 		 474 aa  126  9e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0640821  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3341  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  30.54 
 
 		 469 aa  126  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  24.95 
 
 		 459 aa  126  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  25.58 
 
 		 456 aa  126  1e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3329  putative glycolate oxidase subunit  30.54 
 
 		 469 aa  126  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.87 
 
 		 457 aa  126  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.7 
 
 		 474 aa  125  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2415  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  30.32 
 
 		 469 aa  125  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576548  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1193  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  30.32 
 
 		 469 aa  125  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2602  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  30.32 
 
 		 469 aa  125  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0332  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  30.32 
 
 		 469 aa  125  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1985  FAD linked oxidase-like  29.19 
 
 		 465 aa  124  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0845932  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1422  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.02 
 
 		 470 aa  123  9e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.524008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0025  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.66 
 
 		 470 aa  123  9e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43762  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0052  FAD linked oxidase domain protein  28.03 
 
 		 474 aa  123  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  26.85 
 
 		 459 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>