137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4393 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4393  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 160 aa  319  9.000000000000001e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0543  NUDIX hydrolase  62.96 
 
 		 174 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.643343  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0555  NUDIX hydrolase  62.96 
 
 		 174 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51062  normal  0.852901 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0533  NUDIX hydrolase  62.96 
 
 		 174 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10418  mutator protein mutT3  59.15 
 
 		 217 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0449167  normal  0.708231 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0706  NUDIX hydrolase  67.09 
 
 		 179 aa  181  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747129 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0199  NUDIX hydrolase  63.29 
 
 		 180 aa  173  9e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3752  NUDIX hydrolase  56.41 
 
 		 156 aa  163  6.9999999999999995e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4360  NUDIX hydrolase  54 
 
 		 153 aa  137  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2056  NUDIX hydrolase  49.02 
 
 		 165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000128394 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0097  hypothetical protein  48.98 
 
 		 299 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0188  hypothetical protein  46.75 
 
 		 287 aa  125  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.626289  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1033  NUDIX hydrolase  50.65 
 
 		 161 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.997989 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0099  NUDIX hydrolase  45.51 
 
 		 291 aa  120  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5298  NUDIX hydrolase  45.86 
 
 		 170 aa  119  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1136  NUDIX hydrolase  49.66 
 
 		 335 aa  116  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.472078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1010  NUDIX hydrolase  47.83 
 
 		 181 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2308  NUDIX hydrolase  48.05 
 
 		 167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000433057  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25510  ADP-ribose pyrophosphatase  46.75 
 
 		 165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0162353  normal  0.120334 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24850  ADP-ribose pyrophosphatase  46.75 
 
 		 305 aa  107  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.203973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1229  septum formation protein Maf  43.87 
 
 		 475 aa  107  8.000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000255715 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0837  NUDIX hydrolase  42.21 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.172365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1609  Nucleotide-binding protein  41.77 
 
 		 484 aa  103  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3604  NUDIX hydrolase  36.54 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.763493  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2026  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0458229  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0080  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 195 aa  53.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5787  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 		 238 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2867  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 195 aa  50.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.321324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2644  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 195 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.688454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1686  MutT/nudix family protein  34.43 
 
 		 202 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231925  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1033  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 		 542 aa  49.7  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0906744 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1345  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 202 aa  48.9  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  34.13 
 
 		 202 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1206  putative phosphohydrolase (mutT/nudix family protein)  35.44 
 
 		 195 aa  48.5  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00244192  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2167  NUDIX hydrolase  28.95 
 
 		 191 aa  48.5  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  31.48 
 
 		 227 aa  48.1  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1043  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 238 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1295  NUDIX hydrolase  36.46 
 
 		 241 aa  48.1  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1069  NUDIX hydrolase  38.37 
 
 		 213 aa  48.1  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0292  hypothetical protein  26.17 
 
 		 147 aa  47.8  0.00006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0394428 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0949  NUDIX hydrolase  29.6 
 
 		 228 aa  47.4  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1694  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 235 aa  47  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1585  NUDIX hydrolase  31.52 
 
 		 199 aa  47  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.254951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  28.69 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0953  NUDIX hydrolase  28.8 
 
 		 228 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0994513  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4229  mutT/nudix family protein  39.44 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000345145  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3615  MutT/nudix family protein  34.51 
 
 		 191 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  30.28 
 
 		 198 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5262  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 240 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5351  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 239 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5641  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 239 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2809  hypothetical protein  32 
 
 		 192 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 		 302 aa  46.2  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01947  NTP pyrophosphohydrolase, NUDIX family protein  33.33 
 
 		 190 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00222276  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2536  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 		 226 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  29.23 
 
 		 234 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 		 234 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0732  hydrolase, NUDIX family  24.78 
 
 		 163 aa  45.1  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00265713 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1929  hypothetical protein  30.22 
 
 		 197 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3928  NUDIX hydrolase  37.89 
 
 		 234 aa  45.1  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4287  hydrolase, NUDIX family  38.03 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000426319  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2220  MutT/nudix family protein  30.93 
 
 		 195 aa  44.7  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2890  NUDIX hydrolase  32.38 
 
 		 199 aa  44.7  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4267  hydrolase, NUDIX family  38.03 
 
 		 154 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.555582  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1022  NUDIX hydrolase  38.16 
 
 		 204 aa  44.7  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2018  hypothetical protein  31.75 
 
 		 203 aa  44.7  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0721  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 		 234 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0967  hydrolase, NUDIX family  38.03 
 
 		 154 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00369926  normal  0.920839 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  32.97 
 
 		 207 aa  44.3  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0773  NUDIX hydrolase  29.69 
 
 		 235 aa  44.3  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.104693 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  29.9 
 
 		 195 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  29.9 
 
 		 195 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  34.15 
 
 		 168 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3909  MutT/Nudix family protein  38.03 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0016299  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 200 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2130  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0604  NUDIX hydrolase  32.22 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0701215  normal  0.289612 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  33.82 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3974  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 169 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0933  hypothetical protein  38.71 
 
 		 209 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.825014 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  34.15 
 
 		 168 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  40.85 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4359  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2246  NUDIX hydrolase  37.97 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171331  decreased coverage  0.0000730626 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2921  NUDIX hydrolase  31.96 
 
 		 193 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0185259  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4063  mutT/nudix family protein  37.84 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000339826  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2224  hypothetical protein  31.25 
 
 		 197 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888042  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3901  MutT/Nudix family protein  38.03 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267829  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0239  hypothetical protein  36.36 
 
 		 197 aa  43.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4380  mutT/nudix family protein  37.84 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000407544  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  37 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0815  NUDIX hydrolase  33.71 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2111  NUDIX hydrolase  31.68 
 
 		 194 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.108274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2177  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 		 211 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  29.9 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2465  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 		 288 aa  43.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316655 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  34.83 
 
 		 243 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2636  mutator MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  32.79 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1198  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 201 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.639623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>