More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4377 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4377  guanine deaminase  100 
 
 
469 aa  947    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5279  amidohydrolase  59.25 
 
 
447 aa  525  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2966  amidohydrolase  53.15 
 
 
443 aa  423  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3845  guanine deaminase  36.82 
 
 
434 aa  246  9e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.397164 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22260  guanine deaminase  37.88 
 
 
432 aa  246  9e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.119985  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4281  guanine deaminase  37.04 
 
 
434 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523934  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2754  guanine deaminase  34.93 
 
 
433 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.481519 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1587  guanine deaminase  36.82 
 
 
434 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3607  guanine deaminase  38.03 
 
 
434 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1794  guanine deaminase  36.27 
 
 
434 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.868706  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3812  guanine deaminase  37.07 
 
 
434 aa  233  5e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203808  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44770  guanine deaminase  36.61 
 
 
434 aa  230  4e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.828703  normal  0.188746 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1677  guanine deaminase  33.26 
 
 
433 aa  229  7e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1812  guanine deaminase  34.55 
 
 
444 aa  227  4e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00974317  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2684  guanine deaminase  32.19 
 
 
441 aa  226  6e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.573349 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3663  guanine aminohydrolase  35.49 
 
 
437 aa  226  8e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1807  guanine deaminase  35.24 
 
 
446 aa  225  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000553099  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2606  guanine deaminase  39.09 
 
 
444 aa  225  2e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4872  guanine deaminase  32.47 
 
 
449 aa  224  4e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.673098  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01787  hypothetical protein  33.19 
 
 
466 aa  223  8e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0256  guanine deaminase  38.34 
 
 
439 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02716  guanine deaminase  33.71 
 
 
439 aa  221  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712282  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02678  hypothetical protein  33.71 
 
 
439 aa  221  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.600174  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3043  guanine deaminase  33.71 
 
 
438 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0809  guanine deaminase  33.71 
 
 
438 aa  219  6e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4173  guanine deaminase  33.71 
 
 
438 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3016  guanine deaminase  33.92 
 
 
438 aa  219  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3209  guanine deaminase  33.71 
 
 
438 aa  219  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0825  guanine deaminase  33.71 
 
 
438 aa  219  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2429  guanine deaminase  33.48 
 
 
431 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3717  guanine deaminase  34.9 
 
 
429 aa  211  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2299  guanine deaminase  32.35 
 
 
443 aa  211  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255928  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0946  guanine deaminase  34.21 
 
 
451 aa  210  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334638  normal  0.424226 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3045  guanine deaminase  33.33 
 
 
457 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.206823  normal  0.141945 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1143  guanine deaminase  32.29 
 
 
428 aa  203  4e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.14597  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1148  amidohydrolase  36.14 
 
 
486 aa  203  5e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0506  guanine deaminase  33.33 
 
 
465 aa  202  8e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1336  guanine deaminase  34.57 
 
 
435 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.521939  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1795  guanine deaminase  33.41 
 
 
432 aa  197  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.319049  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01660  guanine deaminase  32.18 
 
 
456 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000118805  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0210  guanine deaminase  31.53 
 
 
432 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.20137  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0456  guanine deaminase  31.69 
 
 
434 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3192  guanine deaminase  32.89 
 
 
449 aa  191  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.673626  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2377  guanine deaminase  34.35 
 
 
439 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.796063  normal  0.732304 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4625  guanine deaminase  32.65 
 
 
447 aa  188  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.430513 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0709  guanine deaminase  31.33 
 
 
441 aa  188  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4260  guanine deaminase  31.58 
 
 
425 aa  188  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.910106  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2429  guanine deaminase  31.97 
 
 
440 aa  187  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.935428  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0893  guanine deaminase  33.79 
 
 
438 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0756096  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0370  guanine deaminase  31.59 
 
 
434 aa  184  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.230205  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0293  guanine deaminase  31.22 
 
 
426 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0977  guanine deaminase  33.11 
 
 
439 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0414452 
 
 
-
 
NC_004310  BR0354  guanine deaminase  31.82 
 
 
434 aa  184  4.0000000000000006e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0539  guanine deaminase  33.11 
 
 
439 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1018  guanine deaminase  33.11 
 
 
439 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4129  guanine deaminase  33.33 
 
 
438 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3479  guanine deaminase  32.02 
 
 
461 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0889  guanine deaminase  32.32 
 
 
446 aa  182  8.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159977  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1462  guanine deaminase  33.7 
 
 
430 aa  179  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0429597  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0545  guanine deaminase  31.37 
 
 
428 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3326  guanine deaminase  29.45 
 
 
435 aa  177  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1610  guanine deaminase  34 
 
 
437 aa  177  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0801  guanine deaminase  33.41 
 
 
445 aa  177  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2771  guanine deaminase  31.31 
 
 
428 aa  177  4e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.888774  normal  0.860518 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0881  guanine deaminase  33.79 
 
 
438 aa  176  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.821524  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1926  guanine deaminase  31.65 
 
 
444 aa  176  7e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0907648  normal  0.0757179 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1336  guanine deaminase  32.79 
 
 
432 aa  176  9e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.117257  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2099  guanine deaminase  32.27 
 
 
445 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.716358 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1896  guanine deaminase  30.94 
 
 
433 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0081  amidohydrolase  30.13 
 
 
513 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2250  guanine deaminase  31.42 
 
 
444 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1087  guanine deaminase  30.95 
 
 
457 aa  173  6.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0146521 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5972  guanine deaminase  33.18 
 
 
419 aa  173  6.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.747945 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3458  guanine deaminase  33.76 
 
 
434 aa  172  7.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.164027 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1468  guanine deaminase  30.14 
 
 
405 aa  172  9e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00567224  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4494  guanine deaminase  30.21 
 
 
435 aa  172  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0638874  normal  0.0636141 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3881  guanine deaminase  31.24 
 
 
428 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3142  guanine deaminase  29.59 
 
 
436 aa  172  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.14624  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02520  guanine deaminase  32.88 
 
 
435 aa  171  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1905  guanine deaminase  30.43 
 
 
429 aa  171  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1727  guanine deaminase  30.52 
 
 
452 aa  169  8e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.434119  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2046  guanine deaminase  30.52 
 
 
452 aa  169  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177828  normal  0.651599 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4655  guanine deaminase  32.54 
 
 
457 aa  168  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0274988  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2724  guanine deaminase  29.35 
 
 
425 aa  168  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2978  guanine deaminase  33.15 
 
 
436 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528772  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0463  guanine deaminase  33.15 
 
 
436 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.451458  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0166  guanine deaminase  33.15 
 
 
436 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.301231  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3023  guanine deaminase  32.43 
 
 
436 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2918  guanine deaminase  33.15 
 
 
436 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495945  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0981  guanine deaminase  33.15 
 
 
436 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2609  guanine deaminase  33.15 
 
 
436 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.694405  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1496  guanine deaminase  31.64 
 
 
449 aa  166  6.9999999999999995e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1786  guanine deaminase  32.2 
 
 
453 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2870  guanine deaminase  29.52 
 
 
435 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.153116 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1047  guanine deaminase  31.76 
 
 
430 aa  163  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.134811  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3295  guanine deaminase  31.64 
 
 
445 aa  162  9e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.403629  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2623  guanine deaminase  32.25 
 
 
454 aa  156  8e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2838  guanine deaminase  28.96 
 
 
434 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.444806  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1049  guanine deaminase  32.08 
 
 
427 aa  152  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1129  guanine deaminase  31.77 
 
 
427 aa  149  8e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.387393  normal  0.517294 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>