94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4350 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4350  hypothetical protein  100 
 
 
579 aa  1170  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000306151  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1741  hypothetical protein  41.75 
 
 
475 aa  279  1e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0740  hypothetical protein  39.59 
 
 
618 aa  262  1e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  31.73 
 
 
484 aa  147  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  31.73 
 
 
567 aa  146  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  29.26 
 
 
511 aa  145  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  30.94 
 
 
488 aa  143  9e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3935  hypothetical protein  29.7 
 
 
514 aa  137  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0910355 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4917  hypothetical protein  29.14 
 
 
508 aa  134  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.150474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5006  hypothetical protein  29.14 
 
 
508 aa  134  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2756  HNH nuclease  28.26 
 
 
550 aa  129  1e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5065  hypothetical protein  27.27 
 
 
506 aa  123  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4099  hypothetical protein  29.22 
 
 
517 aa  123  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165873  normal  0.595439 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0612  hypothetical protein  27.62 
 
 
491 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0179  hypothetical protein  28.62 
 
 
524 aa  122  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1180  hypothetical protein  29.03 
 
 
519 aa  120  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209528  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0634  hypothetical protein  27.43 
 
 
491 aa  120  9e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0621  hypothetical protein  27.43 
 
 
491 aa  120  9e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3994  hypothetical protein  28.02 
 
 
508 aa  119  2e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00383359  normal  0.960587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3920  hypothetical protein  28.02 
 
 
508 aa  119  2e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1291  hypothetical protein  27.57 
 
 
582 aa  118  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322843  normal  0.107817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5299  hypothetical protein  27.17 
 
 
516 aa  118  4e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0159919  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4927  hypothetical protein  28.87 
 
 
546 aa  114  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.929076 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5546  hypothetical protein  26.27 
 
 
571 aa  113  8e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419973  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  30.55 
 
 
480 aa  113  8e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  30.31 
 
 
480 aa  112  1e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  30.31 
 
 
480 aa  112  1e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3422  hypothetical protein  29.61 
 
 
620 aa  110  7e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.023087  normal  0.778813 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5188  hypothetical protein  27.48 
 
 
586 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0262711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2144  hypothetical protein  26.18 
 
 
593 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170651  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  27.44 
 
 
539 aa  109  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1272  HNH endonuclease  28.06 
 
 
532 aa  107  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.250117 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  26.81 
 
 
464 aa  99  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  31.17 
 
 
441 aa  98.6  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  27.01 
 
 
473 aa  94  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  24.95 
 
 
519 aa  90.1  9e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1040  hypothetical protein  32.24 
 
 
593 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35797  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12134  hypothetical protein  27.6 
 
 
550 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.4137e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1056  hypothetical protein  32.24 
 
 
593 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0807  HNH endonuclease  26.15 
 
 
566 aa  89  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  31.28 
 
 
581 aa  87  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  31.28 
 
 
581 aa  87  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2886  hypothetical protein  30.86 
 
 
578 aa  84  7e-15  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.816212  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0728  hypothetical protein  35.68 
 
 
535 aa  84  8e-15  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  30.86 
 
 
578 aa  83.6  9e-15  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4097  hypothetical protein  32.6 
 
 
578 aa  83.6  9e-15  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.481016  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4022  hypothetical protein  32.6 
 
 
578 aa  83.6  9e-15  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13810  hypothetical protein  26.98 
 
 
519 aa  78.2  3e-13  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200987  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18410  hypothetical protein  47.73 
 
 
521 aa  75.1  3e-12  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.867748  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15770  HNH endonuclease  37.5 
 
 
360 aa  72.4  2e-11  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  26.32 
 
 
567 aa  72.8  2e-11  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2714  hypothetical protein  32.29 
 
 
601 aa  72  3e-11  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.707807  normal  0.117401 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3176  hypothetical protein  33.33 
 
 
601 aa  70.9  6e-11  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436761  normal  0.0313411 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5774  HNH endonuclease  28.23 
 
 
516 aa  68.9  2e-10  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300125  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0314  hypothetical protein  28.21 
 
 
512 aa  68.9  3e-10  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02410  HNH endonuclease  35.25 
 
 
198 aa  64.3  5e-09  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06130  HNH endonuclease  41.9 
 
 
561 aa  63.5  9e-09  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02590  HNH endonuclease  36.51 
 
 
169 aa  63.2  1e-08  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  25.68 
 
 
512 aa  60.8  6e-08  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31690  hypothetical protein  40 
 
 
577 aa  60.5  8e-08  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29150  hypothetical protein  41.1 
 
 
502 aa  59.7  1e-07  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  28.69 
 
 
580 aa  58.9  2e-07  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  26.63 
 
 
556 aa  58.5  3e-07  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00460  HNH endonuclease  34.17 
 
 
565 aa  56.2  2e-06  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.711457 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  41.18 
 
 
553 aa  55.1  3e-06  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  30.06 
 
 
516 aa  54.3  5e-06  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  27.41 
 
 
535 aa  53.1  1e-05  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  30.87 
 
 
443 aa  53.5  1e-05  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06770  hypothetical protein  40.3 
 
 
523 aa  52.8  2e-05  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.417774  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  25.59 
 
 
510 aa  52.4  2e-05  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0062  hypothetical protein  34.04 
 
 
572 aa  52.4  2e-05  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161525  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3219  HNH endonuclease  36.36 
 
 
427 aa  52  3e-05  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125237  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  27.2 
 
 
499 aa  52  3e-05  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  24.83 
 
 
558 aa  51.6  4e-05  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1666  hypothetical protein  32.98 
 
 
557 aa  51.2  5e-05  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  30.87 
 
 
443 aa  50.8  6e-05  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0266  hypothetical protein  32.98 
 
 
602 aa  50.4  8e-05  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4183  HNH endonuclease  35.11 
 
 
434 aa  50.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  22.95 
 
 
508 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  26.48 
 
 
426 aa  48.5  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  33.61 
 
 
605 aa  48.1  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  34.78 
 
 
714 aa  47.8  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  34.43 
 
 
580 aa  47.4  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  24.54 
 
 
551 aa  47.8  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3819  HNH endonuclease  35.64 
 
 
620 aa  47.4  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125126  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  33.33 
 
 
535 aa  47.4  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  31.97 
 
 
530 aa  47  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1476  HNH endonuclease  30.65 
 
 
586 aa  47  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266278  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  28.17 
 
 
602 aa  46.6  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  23.4 
 
 
404 aa  45.4  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  33.61 
 
 
584 aa  45.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3627  HNH endonuclease  34.75 
 
 
743 aa  45.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0415546 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  31.97 
 
 
568 aa  44.7  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  30.89 
 
 
585 aa  44.7  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>