99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4318 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4318  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  100 
 
 
225 aa  448  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.531167  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13140  hypothetical protein  46.5 
 
 
262 aa  191  7e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3210  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  43.1 
 
 
237 aa  187  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.924727  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4709  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  47.98 
 
 
240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.618001 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4922  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  55.86 
 
 
295 aa  174  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.102122  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1217  hypothetical protein  39.3 
 
 
289 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3967  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  47.25 
 
 
246 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1572  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  43.36 
 
 
241 aa  161  9e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615405  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5184  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  52.41 
 
 
232 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0642  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  39.33 
 
 
251 aa  157  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5312  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  40.09 
 
 
232 aa  155  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4984  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  52.48 
 
 
240 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.990283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4601  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  52.48 
 
 
240 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4689  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  52.48 
 
 
240 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.969168 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0119  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  49.32 
 
 
147 aa  151  7e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128418  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4237  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  45.22 
 
 
469 aa  143  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0483  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  41.55 
 
 
222 aa  141  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237703  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0505  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  41.55 
 
 
222 aa  141  9e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.248334 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0494  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  41.55 
 
 
222 aa  141  9e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.462994  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0593  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  39.41 
 
 
244 aa  138  6e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2034  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  43.79 
 
 
241 aa  138  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0321774  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10374  oxidoreductase  38.22 
 
 
200 aa  137  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00057735  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0120  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  42.07 
 
 
212 aa  135  5e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.391115  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1563  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  38.76 
 
 
234 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3032  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  43.66 
 
 
225 aa  128  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0343994  normal  0.0106587 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1865  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  34.47 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4562  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  42.86 
 
 
306 aa  112  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4106  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  40.14 
 
 
208 aa  109  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.875742  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0232  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  38.36 
 
 
198 aa  107  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1636  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  40.14 
 
 
237 aa  105  6e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2767  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  35.4 
 
 
185 aa  96.3  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3792  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding:carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.93 
 
 
390 aa  85.9  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.100636  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2147  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  30.98 
 
 
208 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.295033  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3032  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.52 
 
 
182 aa  79.7  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.128419  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3140  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.52 
 
 
182 aa  79  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0169757  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2945  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.49 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0435616  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4550  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.9 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.735777  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1056  hypothetical protein  29.73 
 
 
241 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184946  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0032  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  28.28 
 
 
206 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.262475 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4285  (2Fe-2S)-binding domain protein  29.38 
 
 
405 aa  75.9  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1564  carbon monoxide dehydrogenase, large subunit apoprotein  28.32 
 
 
1027 aa  74.7  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151361  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0646  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  32.34 
 
 
405 aa  67  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5697  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  31.08 
 
 
400 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00407946 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3553  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.45 
 
 
157 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.530671  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3097  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.88 
 
 
147 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889249  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  34.67 
 
 
155 aa  61.2  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5832  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  31.71 
 
 
399 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671661  hitchhiker  0.00379539 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2963  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.73 
 
 
216 aa  61.6  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748718  normal  0.0394978 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1630  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.51 
 
 
155 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.442595  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2608  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  33.08 
 
 
148 aa  59.3  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5862  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.01 
 
 
158 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4327  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.32 
 
 
154 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.510988  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2879  hypothetical protein  30.95 
 
 
176 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.434233  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5438  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  34.33 
 
 
154 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0339  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.89 
 
 
241 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.30715 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5319  putative carbon monoxide dehydrogenase, coxG accessory protein  30.34 
 
 
148 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1141  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.75 
 
 
178 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.654627  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1525  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.36 
 
 
176 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.187738  normal  0.0565449 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3597  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.34 
 
 
254 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237636  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1748  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.91 
 
 
154 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2206  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.82 
 
 
148 aa  55.5  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0292084  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2235  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.39 
 
 
152 aa  55.5  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000000688113  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0844  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.26 
 
 
249 aa  55.1  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.777561  hitchhiker  0.00161698 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1781  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.82 
 
 
153 aa  55.1  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.378744 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3679  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.14 
 
 
151 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8407  hypothetical protein  22.39 
 
 
279 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.795849  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0470  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.57 
 
 
213 aa  52  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0040  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.79 
 
 
151 aa  52  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0056  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.79 
 
 
151 aa  51.6  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752516  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0072  putative carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.88 
 
 
246 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766775  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20930  hypothetical protein  29.39 
 
 
221 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.451934  normal  0.0186523 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1445  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32 
 
 
158 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.101992  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1283  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32 
 
 
158 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.112632  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3296  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  28.57 
 
 
987 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0204451  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0168  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.28 
 
 
220 aa  49.3  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0668  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  29.29 
 
 
988 aa  48.9  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.295598  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1349  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.22 
 
 
224 aa  48.5  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.224808  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0848  carbon-monoxide dehydrogenase  30.72 
 
 
997 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.682595 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0971  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.91 
 
 
269 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301105  normal  0.374469 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4535  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.73 
 
 
202 aa  47.8  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0006  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.37 
 
 
156 aa  47.8  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1413  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.48 
 
 
224 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal  0.135915 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3719  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  27.01 
 
 
983 aa  47.8  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2526  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.57 
 
 
181 aa  47.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0365  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.85 
 
 
198 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1464  hypothetical protein  27.63 
 
 
213 aa  47.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.273128 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2531  hypothetical protein  27.34 
 
 
161 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0528604 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4723  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  27.21 
 
 
991 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102833  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0420  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26 
 
 
182 aa  46.6  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110218  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0023  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.6 
 
 
152 aa  46.2  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137248 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1744  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  26.76 
 
 
1011 aa  45.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.919932 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2052  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  26.76 
 
 
1011 aa  45.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.806962 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0213  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.45 
 
 
154 aa  44.7  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.62 
 
 
193 aa  42.7  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3913  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.78 
 
 
221 aa  42.4  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0164888  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4356  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  25 
 
 
232 aa  42  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2253  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.9 
 
 
243 aa  42  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0481685 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.33 
 
 
151 aa  41.6  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.679244  normal  0.391598 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0360  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.28 
 
 
187 aa  41.6  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>