More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4312 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  100 
 
 		 372 aa  732    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  63.98 
 
 		 386 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  64.25 
 
 		 386 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  64.25 
 
 		 386 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  63.22 
 
 		 366 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  62.97 
 
 		 374 aa  434  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  61.25 
 
 		 373 aa  425  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  61.35 
 
 		 373 aa  421  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  60.43 
 
 		 385 aa  415  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  60 
 
 		 368 aa  413  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3973  hypothetical protein  60.15 
 
 		 398 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  62.12 
 
 		 363 aa  395  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  58.11 
 
 		 369 aa  390  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  56.72 
 
 		 390 aa  388  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10381  hypothetical protein  61.26 
 
 		 380 aa  385  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000724106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6196  hypothetical protein  60.59 
 
 		 389 aa  385  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0286136 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  56.3 
 
 		 386 aa  384  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  56.68 
 
 		 397 aa  379  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  60.16 
 
 		 385 aa  378  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  60.05 
 
 		 368 aa  370  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2392  hypothetical protein  50.74 
 
 		 425 aa  328  9e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.097794  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  52.16 
 
 		 381 aa  311  2e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  50.41 
 
 		 372 aa  308  1.0000000000000001e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  51.65 
 
 		 370 aa  302  7.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  48.75 
 
 		 357 aa  294  2e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2544  hypothetical protein  49.74 
 
 		 385 aa  292  6e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  0.0393549 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  42.86 
 
 		 367 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0117  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  56.11 
 
 		 266 aa  259  7e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.379471  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3202  protein of unknown function DUF182  43.35 
 
 		 421 aa  248  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4124  protein of unknown function DUF182  44.51 
 
 		 375 aa  242  9e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3868  protein of unknown function DUF182  41.33 
 
 		 389 aa  235  9e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4732  protein of unknown function DUF182  54.39 
 
 		 483 aa  229  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1565  protein of unknown function DUF182  43.78 
 
 		 402 aa  224  2e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.39267  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  41.5 
 
 		 356 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3033  protein of unknown function DUF182  43.9 
 
 		 360 aa  209  7e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112795  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  40.45 
 
 		 323 aa  209  7e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  41.24 
 
 		 342 aa  208  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  39.04 
 
 		 376 aa  197  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  38.87 
 
 		 388 aa  197  3e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0200  hypothetical protein  39.57 
 
 		 369 aa  192  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0521133  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3422  hypothetical protein  56 
 
 		 433 aa  186  5e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  38.53 
 
 		 316 aa  185  9e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0501  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  42.98 
 
 		 244 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  36.91 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  39 
 
 		 340 aa  182  7e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  37.61 
 
 		 306 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1256  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  43.75 
 
 		 248 aa  179  5.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2839  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  42.62 
 
 		 240 aa  177  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  36.47 
 
 		 318 aa  176  5e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  37.06 
 
 		 338 aa  171  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  33.15 
 
 		 345 aa  160  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0122  hypothetical protein  37.54 
 
 		 313 aa  159  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  32.87 
 
 		 340 aa  159  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  31.72 
 
 		 372 aa  156  5.0000000000000005e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  32.6 
 
 		 340 aa  155  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  33.53 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0385  hypothetical protein  34.92 
 
 		 370 aa  154  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2254  hypothetical protein  35.43 
 
 		 356 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.053952 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  33.98 
 
 		 341 aa  153  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4321  hypothetical protein  46.77 
 
 		 233 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2902  xanthine dehydrogenase accessory factor  41.53 
 
 		 250 aa  152  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.977252  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  33.51 
 
 		 343 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  33.51 
 
 		 343 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1378  hypothetical protein  34.58 
 
 		 329 aa  150  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.597595  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  33.7 
 
 		 338 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  32.97 
 
 		 453 aa  149  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  34.08 
 
 		 341 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3673  xanthine dehydrogenase accessory factor  45.6 
 
 		 233 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1787  xanthine dehydrogenase accessory factor  44.21 
 
 		 233 aa  149  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112917  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5313  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  46.93 
 
 		 233 aa  149  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.377214 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  32.41 
 
 		 346 aa  149  9e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  34.54 
 
 		 343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5263  hypothetical protein  37.39 
 
 		 323 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  31.09 
 
 		 398 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  34.54 
 
 		 343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5428  Xanthine dehydrogenase  34.1 
 
 		 389 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2956  hypothetical protein  49.08 
 
 		 225 aa  147  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00897371 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  34.26 
 
 		 339 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4168  hypothetical protein  33.52 
 
 		 326 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0530695  normal  0.0915222 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1636  xanthine dehydrogenase accessory factor  43.84 
 
 		 230 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.215395  normal  0.922249 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61120  hypothetical protein  37.39 
 
 		 323 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  32.51 
 
 		 342 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0531  hypothetical protein  34.39 
 
 		 323 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.916734  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  35.1 
 
 		 315 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0572  hypothetical protein  34.34 
 
 		 364 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2836  hypothetical protein  35.2 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.241522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2443  hypothetical protein  33.43 
 
 		 341 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4205  alanine dehydrogenase  28.68 
 
 		 379 aa  145  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.289956  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3057  hypothetical protein  33.43 
 
 		 341 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  33.15 
 
 		 341 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0474  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  51.19 
 
 		 228 aa  143  5e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0496449  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2968  hypothetical protein  32.96 
 
 		 341 aa  142  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.0976397 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5191  protein of unknown function DUF182  27.89 
 
 		 400 aa  142  9e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.337929 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3102  hypothetical protein  32.96 
 
 		 341 aa  142  9e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6406  hypothetical protein  33.52 
 
 		 342 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  32.59 
 
 		 341 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2602  hypothetical protein  39.51 
 
 		 230 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4137  Xanthine dehydrogenase  29.21 
 
 		 372 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00996475 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3933  hypothetical protein  34.08 
 
 		 327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00672502 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0125  hypothetical protein  30.37 
 
 		 386 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1278  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>