98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4288 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4288  protein of unknown function DUF222  100 
 
 		 524 aa  1066    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.429378  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3136  hypothetical protein  98.44 
 
 		 387 aa  627  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4824  protein of unknown function DUF222  50.09 
 
 		 553 aa  540  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2802  protein of unknown function DUF222  50.09 
 
 		 551 aa  518  1.0000000000000001e-145  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0845411  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3811  protein of unknown function DUF222  46.92 
 
 		 593 aa  380  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4191  protein of unknown function DUF222  46.21 
 
 		 533 aa  329  6e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.650463  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0796  protein of unknown function DUF222  46.21 
 
 		 534 aa  329  7e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2293  protein of unknown function DUF222  34.85 
 
 		 540 aa  226  6e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3745  protein of unknown function DUF222  36.14 
 
 		 531 aa  224  3e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4127  protein of unknown function DUF222  36.39 
 
 		 532 aa  222  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1835  hypothetical protein  34.93 
 
 		 489 aa  203  8e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4610  hypothetical protein  36.04 
 
 		 448 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4232  hypothetical protein  36.29 
 
 		 448 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815534  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2470  protein of unknown function DUF222  35.12 
 
 		 437 aa  195  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3803  hypothetical protein  35.51 
 
 		 447 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.866819  normal  0.47715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2089  hypothetical protein  34 
 
 		 493 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.129503 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3231  hypothetical protein  35.06 
 
 		 510 aa  190  5e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3542  hypothetical protein  35.81 
 
 		 444 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3615  hypothetical protein  35.81 
 
 		 444 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4912  hypothetical protein  35.06 
 
 		 508 aa  187  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2779  hypothetical protein  37.28 
 
 		 473 aa  186  9e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0327  hypothetical protein  34.48 
 
 		 490 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3379  hypothetical protein  33.5 
 
 		 497 aa  184  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.887374  normal  0.158077 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2152  hypothetical protein  34.54 
 
 		 492 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.166446 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0338  hypothetical protein  34.28 
 
 		 492 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2106  hypothetical protein  34.75 
 
 		 446 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.426457  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0348  hypothetical protein  34.28 
 
 		 492 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5865  hypothetical protein  34.13 
 
 		 511 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4014  hypothetical protein  35.81 
 
 		 464 aa  184  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00728967 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4437  hypothetical protein  33.97 
 
 		 507 aa  183  6e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.835135  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5741  hypothetical protein  33.97 
 
 		 519 aa  183  6e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.316715 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4351  hypothetical protein  33.97 
 
 		 507 aa  183  6e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489972  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3547  hypothetical protein  35.01 
 
 		 444 aa  183  7e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4731  hypothetical protein  32.05 
 
 		 507 aa  183  7e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2793  hypothetical protein  35.28 
 
 		 473 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.925956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2749  hypothetical protein  35.28 
 
 		 473 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.621595  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11151  hypothetical protein  39.22 
 
 		 451 aa  182  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1730  hypothetical protein  33.49 
 
 		 507 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3477  hypothetical protein  34.61 
 
 		 506 aa  182  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.800826  normal  0.648899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1709  hypothetical protein  33.49 
 
 		 507 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1777  hypothetical protein  33.49 
 
 		 507 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4827  hypothetical protein  34.59 
 
 		 508 aa  182  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.79889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5454  hypothetical protein  33.73 
 
 		 519 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.157039  decreased coverage  0.0069948 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0170  hypothetical protein  34.22 
 
 		 442 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523196  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0179  hypothetical protein  34.22 
 
 		 442 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4397  hypothetical protein  34.61 
 
 		 501 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3050  hypothetical protein  31.34 
 
 		 495 aa  179  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184286 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3484  hypothetical protein  33.82 
 
 		 552 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210016  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4451  hypothetical protein  31.32 
 
 		 518 aa  177  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3851  hypothetical protein  31.54 
 
 		 513 aa  177  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.432378 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11717  hypothetical protein  37.13 
 
 		 454 aa  170  7e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.12455 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11173  hypothetical protein  37.99 
 
 		 499 aa  168  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11974  hypothetical protein  37.69 
 
 		 454 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10095  hypothetical protein  40.58 
 
 		 317 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.391031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4658  hypothetical protein  44.28 
 
 		 275 aa  148  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449109  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5363  hypothetical protein  33.33 
 
 		 355 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11604  REP13E12 repeat-containing protein  41 
 
 		 240 aa  110  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.81222e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13504  hypothetical protein  40.5 
 
 		 239 aa  108  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  25.78 
 
 		 432 aa  91.3  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  27.51 
 
 		 442 aa  88.2  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  31.21 
 
 		 485 aa  85.9  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  32.17 
 
 		 469 aa  76.6  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18050  hypothetical protein  27.84 
 
 		 577 aa  73.9  0.000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418777  normal  0.174472 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26200  hypothetical protein  27.32 
 
 		 526 aa  72.4  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  24.65 
 
 		 561 aa  68.6  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  23.69 
 
 		 546 aa  67.4  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01610  hypothetical protein  26.33 
 
 		 538 aa  64.3  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.746521  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09510  HNH endonuclease  31.86 
 
 		 464 aa  63.5  0.000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531982  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7882  HNH endonuclease  29.41 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00294777  hitchhiker  0.00944768 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  27.11 
 
 		 413 aa  55.5  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  28.72 
 
 		 572 aa  55.1  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09750  HNH endonuclease  29.1 
 
 		 494 aa  54.7  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00000378313  normal  0.0136835 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  31.72 
 
 		 661 aa  54.3  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1463  HNH nuclease  33.08 
 
 		 414 aa  52.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2505  HNH endonuclease  31.06 
 
 		 433 aa  51.6  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4665  hypothetical protein  48.33 
 
 		 149 aa  51.6  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  29.94 
 
 		 408 aa  50.8  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1741  HNH nuclease  41.03 
 
 		 414 aa  50.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.206853  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3947  HNH endonuclease  31.06 
 
 		 433 aa  50.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3201  HNH endonuclease  31.25 
 
 		 428 aa  50.4  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0067  HNH endonuclease  24.47 
 
 		 458 aa  50.4  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4589  HNH endonuclease  31.25 
 
 		 428 aa  50.4  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  30.95 
 
 		 469 aa  50.4  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2809  HNH endonuclease  40 
 
 		 255 aa  50.4  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46978  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2460  HNH endonuclease  31.25 
 
 		 428 aa  50.1  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01940  hypothetical protein  25.07 
 
 		 524 aa  50.1  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0359  HNH endonuclease  31.25 
 
 		 433 aa  49.7  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2332  HNH endonuclease  33.96 
 
 		 620 aa  49.3  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.934407  normal  0.611085 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1508  HNH endonuclease  31.25 
 
 		 436 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000388947  hitchhiker  0.00249472 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23120  hypothetical protein  27.68 
 
 		 522 aa  48.5  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0151991  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2278  HNH endonuclease  31.25 
 
 		 440 aa  48.5  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384645  normal  0.214719 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1280  HNH nuclease  38.67 
 
 		 414 aa  48.1  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1199  hypothetical protein  32.46 
 
 		 505 aa  47.4  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  25.39 
 
 		 441 aa  45.8  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01520  HNH endonuclease  25.06 
 
 		 504 aa  45.1  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  29.76 
 
 		 558 aa  44.7  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  25.91 
 
 		 510 aa  44.7  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3314  hypothetical protein  33 
 
 		 526 aa  43.9  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0608226  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>