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for query gene Gbro_4279 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 		 486 aa  929    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6356  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.21 
 
 		 492 aa  378  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0603  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.52 
 
 		 498 aa  373  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2252  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.32 
 
 		 529 aa  362  8e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  normal  0.0232648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.87 
 
 		 500 aa  361  2e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0031  EmrB/QacA family drug resistance transporter  56.09 
 
 		 483 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.665432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.2 
 
 		 500 aa  355  8.999999999999999e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.87 
 
 		 471 aa  353  5e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.38 
 
 		 502 aa  353  5e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3231  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.14 
 
 		 479 aa  347  3e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.991608  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2891  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  52.94 
 
 		 539 aa  340  5e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2305  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.87 
 
 		 613 aa  335  1e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1801  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.45 
 
 		 504 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0797811  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0301  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.02 
 
 		 489 aa  323  3e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.112532 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17940  arabinose efflux permease family protein  46.7 
 
 		 457 aa  315  9.999999999999999e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4689  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.41 
 
 		 516 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.200154  hitchhiker  0.00098784 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5313  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.43 
 
 		 542 aa  307  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417718 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.52 
 
 		 520 aa  306  4.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5418  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.65 
 
 		 583 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.97043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.09 
 
 		 522 aa  291  2e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4620  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.12 
 
 		 470 aa  290  5.0000000000000004e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0499  major facilitator superfamily MFS_1  48.31 
 
 		 465 aa  288  2e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0976  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.75 
 
 		 537 aa  281  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2240  major facilitator superfamily MFS_1  45.24 
 
 		 463 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0215877  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.89 
 
 		 488 aa  255  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.77 
 
 		 502 aa  252  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.71 
 
 		 478 aa  249  7e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.63 
 
 		 489 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.46 
 
 		 498 aa  248  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1524  major facilitator superfamily MFS_1  37.7 
 
 		 546 aa  246  4.9999999999999997e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.565851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.91 
 
 		 478 aa  246  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.91 
 
 		 484 aa  246  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.91 
 
 		 478 aa  246  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0982  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.81 
 
 		 497 aa  244  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.92 
 
 		 487 aa  242  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  35.65 
 
 		 467 aa  241  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.84 
 
 		 452 aa  241  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.25 
 
 		 478 aa  241  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.1 
 
 		 478 aa  241  2.9999999999999997e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.71 
 
 		 510 aa  239  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.65 
 
 		 524 aa  238  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.52 
 
 		 478 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.15 
 
 		 528 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.34 
 
 		 532 aa  235  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.71 
 
 		 504 aa  233  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.84 
 
 		 480 aa  227  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  37.09 
 
 		 469 aa  223  8e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.93 
 
 		 534 aa  222  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3692  major facilitator transporter  40.38 
 
 		 479 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.378275  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  36.82 
 
 		 468 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  36.82 
 
 		 468 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4556  major facilitator superfamily MFS_1  38.46 
 
 		 494 aa  221  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4530  major facilitator transporter  40.14 
 
 		 488 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3833  major facilitator transporter  40.14 
 
 		 488 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.57 
 
 		 486 aa  219  8.999999999999998e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.57 
 
 		 486 aa  219  8.999999999999998e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.57 
 
 		 486 aa  219  8.999999999999998e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.57 
 
 		 486 aa  219  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.57 
 
 		 486 aa  219  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.57 
 
 		 486 aa  219  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.9 
 
 		 489 aa  217  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.89 
 
 		 488 aa  216  5.9999999999999996e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  37.47 
 
 		 466 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.63 
 
 		 522 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.12 
 
 		 485 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.45 
 
 		 469 aa  214  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  38.78 
 
 		 463 aa  214  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  38.48 
 
 		 490 aa  213  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.74 
 
 		 479 aa  212  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.384361 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4824  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.27 
 
 		 519 aa  212  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5514  major facilitator transporter  37.22 
 
 		 483 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514216  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5878  major facilitator transporter  37.22 
 
 		 483 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.63 
 
 		 520 aa  211  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6387  major facilitator transporter  36.97 
 
 		 480 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.79 
 
 		 521 aa  210  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  38.59 
 
 		 457 aa  210  4e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1476  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.31 
 
 		 472 aa  210  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1372  multidrug resistance protein B  34.15 
 
 		 534 aa  210  4e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.964869  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.65 
 
 		 508 aa  210  5e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4663  major facilitator transporter  36.85 
 
 		 523 aa  210  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.502876  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.08 
 
 		 516 aa  210  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2263  major facilitator transporter  39.34 
 
 		 482 aa  209  7e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330414  normal  0.0393067 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4713  major facilitator transporter  39 
 
 		 397 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800868  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.56 
 
 		 540 aa  208  2e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  36.43 
 
 		 519 aa  208  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  35.68 
 
 		 463 aa  207  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7158  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.55 
 
 		 502 aa  206  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.454502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5562  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.03 
 
 		 493 aa  206  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.48 
 
 		 529 aa  205  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.56 
 
 		 487 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.45 
 
 		 478 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.76 
 
 		 508 aa  204  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208526 
 
 
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NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.8 
 
 		 474 aa  204  4e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  34.43 
 
 		 522 aa  203  6e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_0921  major facilitator transporter  41.73 
 
 		 455 aa  202  8e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224208  normal  0.285654 
 
 
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NC_007777  Francci3_2757  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.66 
 
 		 500 aa  202  8e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 		 483 aa  202  8e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.647242 
 
 
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NC_013739  Cwoe_5556  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.37 
 
 		 489 aa  202  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798171  normal  1 
 
 
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NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  36.41 
 
 		 528 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007952  Bxe_B0272  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  39.4 
 
 		 494 aa  201  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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