More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4166 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4166  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
407 aa  801  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1347  acetyl-CoA acetyltransferase  76.87 
 
 
403 aa  620  1e-176  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.901733 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1860  acetyl-CoA acetyltransferase  66.75 
 
 
402 aa  504  1e-142  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00028581  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7151  acetyl-CoA acetyltransferase  64.91 
 
 
405 aa  477  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1758  acetyl-CoA acetyltransferase  60.5 
 
 
404 aa  466  1e-130  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1805  acetyl-CoA acetyltransferase  60.5 
 
 
404 aa  466  1e-130  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1739  acetyl-CoA acetyltransferase  60 
 
 
404 aa  461  1e-128  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126801  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1802  acetyl-CoA acetyltransferase  58.77 
 
 
407 aa  452  1e-126  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2726  acetyl-CoA acetyltransferase  59.55 
 
 
404 aa  451  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1976  acetyl-CoA acetyltransferase  57.75 
 
 
405 aa  449  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3929  acetyl-CoA acetyltransferase  61.56 
 
 
403 aa  449  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.041846 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3827  acetyl-CoA acetyltransferase  62.34 
 
 
403 aa  450  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.241233  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4368  acetyl-CoA acetyltransferase  58.29 
 
 
405 aa  445  1e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1524  acetyl-CoA acetyltransferase  58.91 
 
 
407 aa  435  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0742022  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0142  acetyl-CoA acetyltransferase  54.7 
 
 
402 aa  415  1e-115  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.771451  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0124  acetyl-CoA acetyltransferase  54.7 
 
 
402 aa  415  1e-115  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.226626  normal  0.905367 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0192  acetyl-CoA acetyltransferase  54.21 
 
 
402 aa  411  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6898  acetyl-CoA acetyltransferase  53.4 
 
 
398 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1222  acetyl-CoA acetyltransferase  54.32 
 
 
404 aa  391  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0492457  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2896  acetyl-CoA acetyltransferase  53.71 
 
 
404 aa  387  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7332  acetyl-CoA acetyltransferase  50.63 
 
 
401 aa  357  3e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213335  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1362  beta-ketothiolase  45 
 
 
394 aa  310  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2321  acetyl-CoA acetyltransferase  45.68 
 
 
402 aa  306  3e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1850  beta-ketothiolase  44.64 
 
 
394 aa  306  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373704  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2335  beta-ketothiolase  44.39 
 
 
394 aa  306  5e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.268919  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  46.46 
 
 
393 aa  305  8e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38630  acetyl-CoA acetyltransferase  46.21 
 
 
393 aa  304  2e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752168  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0803  acetyl-CoA acetyltransferase  44.67 
 
 
392 aa  303  3e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0515651  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1353  beta-ketothiolase  44 
 
 
394 aa  301  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0274  acetyl-CoA acetyltransferase  44.89 
 
 
390 aa  301  2e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5118  acetyl-CoA acetyltransferase  43.24 
 
 
394 aa  298  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.583102 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0702  acetyl-CoA acetyltransferase  41.98 
 
 
396 aa  298  1e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000219092 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  44.14 
 
 
392 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231134  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0809  beta-ketothiolase  45.52 
 
 
392 aa  297  2e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2284  acetyl-CoA acetyltransferase  42.93 
 
 
392 aa  297  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4636  acetyl-CoA acetyltransferase  43.89 
 
 
392 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1668  acetyl-CoA acetyltransferase  43.78 
 
 
401 aa  295  7e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3469  acetyl-CoA acetyltransferase  43.73 
 
 
394 aa  295  9e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.753408 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0824  acetyl-CoA acetyltransferase  43.25 
 
 
392 aa  295  9e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.122225  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3777  acetyl-CoA acetyltransferase  43.73 
 
 
394 aa  295  9e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2058  acetyl-CoA acetyltransferase  46.25 
 
 
395 aa  295  1e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3108  acetyl-CoA acetyltransferase  44.22 
 
 
392 aa  295  1e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2342  acetyl-CoA acetyltransferase  43.39 
 
 
393 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0091  beta-ketothiolase  43.5 
 
 
394 aa  294  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383998  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2893  beta-ketothiolase  45.5 
 
 
393 aa  294  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1076  beta-ketothiolase  43.5 
 
 
394 aa  294  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4515  acetyl-CoA acetyltransferase  43.7 
 
 
391 aa  294  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.657914 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1316  beta-ketothiolase  43.5 
 
 
394 aa  294  2e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0933153  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1910  beta-ketothiolase  43.39 
 
 
394 aa  293  3e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614831  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2197  beta-ketothiolase  43.39 
 
 
427 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2160  beta-ketothiolase  43.39 
 
 
427 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.473084  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3060  acetyl-CoA acetyltransferase  43.81 
 
 
392 aa  293  3e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.954536  normal  0.134975 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0609  acetyl-CoA acetyltransferase  43 
 
 
392 aa  293  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2261  beta-ketothiolase  43 
 
 
394 aa  293  3e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.955375  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1260  acetyl-CoA acetyltransferase  43.5 
 
 
393 aa  293  4e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  1.97316e-05 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  43.18 
 
 
393 aa  293  4e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1805  beta-ketothiolase  43.39 
 
 
427 aa  293  4e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.815366  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1637  beta-ketothiolase  44.89 
 
 
394 aa  293  4e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.363472 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0975  beta-ketothiolase  42 
 
 
394 aa  293  4e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480972  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0957  acetyl-CoA acetyltransferase  43.43 
 
 
392 aa  293  5e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5080  beta-ketothiolase  43.53 
 
 
396 aa  293  5e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4629  acetyl-CoA acetyltransferase  43.67 
 
 
392 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.817149  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2325  beta-ketothiolase  43.25 
 
 
394 aa  293  5e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2996  acetyl-CoA acetyltransferase  41.9 
 
 
390 aa  292  6e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.811751 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1581  beta-ketothiolase  43.14 
 
 
394 aa  292  8e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.328438  normal  0.0356466 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  44.61 
 
 
398 aa  291  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1514  acetyl-CoA acetyltransferase  44.06 
 
 
394 aa  291  1e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.113339  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1844  acetyl-CoA acetyltransferase  43.14 
 
 
393 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980991  normal  0.0817271 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1159  beta-ketothiolase  43.64 
 
 
394 aa  291  1e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3667  acetyl-CoA acetyltransferase  43.24 
 
 
394 aa  291  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208035  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  44.61 
 
 
398 aa  291  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4344  acetyl-CoA acetyltransferase  42.93 
 
 
408 aa  291  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0427  acetyl-CoA acetyltransferase  40.99 
 
 
391 aa  290  2e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5280  acetyl-CoA acetyltransferase  43.95 
 
 
398 aa  291  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1323  acetyl-CoA acetyltransferase  43.98 
 
 
402 aa  290  2e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.158351 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2804  acetyl-CoA acetyltransferase  43.03 
 
 
392 aa  290  3e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.914723  hitchhiker  1.52049e-05 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1246  acetyl-CoA acetyltransferase  43.64 
 
 
390 aa  290  4e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3597  acetyl-CoA acetyltransferase  44 
 
 
393 aa  290  4e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.840519 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1138  acetyl-CoA acetyltransferase  44.64 
 
 
393 aa  289  5e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.495494 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2074  acetyl-CoA acetyltransferase  43.75 
 
 
393 aa  289  6e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2256  acetyl-CoA acetyltransferase  45 
 
 
390 aa  289  6e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.672895  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0504  acetyl-CoA acetyltransferase  43 
 
 
392 aa  289  6e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0234538 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1632  acetyl-CoA acetyltransferase  42.14 
 
 
393 aa  288  8e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.871042  normal  0.67085 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4348  acetyl-CoA acetyltransferase  43.56 
 
 
396 aa  288  8e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.430233  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2140  acetyl-CoA acetyltransferase  42.79 
 
 
392 aa  288  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0060  beta-ketothiolase  43.64 
 
 
394 aa  288  1e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2857  acetyl-CoA acetyltransferase  44.64 
 
 
392 aa  288  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0832  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  45.41 
 
 
390 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0844376 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1582  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  43.27 
 
 
424 aa  287  2e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3374  acetyl-CoA acetyltransferase  43.73 
 
 
393 aa  287  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2330  acetyl-CoA acetyltransferase  42.64 
 
 
393 aa  286  3e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2487  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1790  acetyl-CoA acetyltransferase  42.64 
 
 
393 aa  286  3e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2202  acetyl-CoA acetyltransferase  42.64 
 
 
393 aa  286  3e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0577057  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2005  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  44.67 
 
 
390 aa  287  3e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.321555  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6289  acetyl-CoA acetyltransferase  42.64 
 
 
393 aa  286  3e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1814  acetyl-CoA acetyltransferase  42.64 
 
 
393 aa  286  3e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.390128 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  42.64 
 
 
393 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  42.64 
 
 
393 aa  286  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  0.0550721 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2772  acetyl-CoA acetyltransferase  42.64 
 
 
393 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2165  acetyl-CoA acetyltransferase  42.64 
 
 
393 aa  286  5e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.810092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>