More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4139 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4139  ThiJ/PfpI domain protein  100 
 
 
321 aa  645    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2725  transcriptional regulator, AraC family  62.18 
 
 
320 aa  356  2.9999999999999997e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0282  AraC family transcriptional regulator  45.37 
 
 
342 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4080  transcriptional regulator  47.28 
 
 
348 aa  281  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3109  AraC family transcriptional regulator  42.54 
 
 
320 aa  280  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.59349 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0475  AraC family transcriptional regulator  47.6 
 
 
350 aa  279  6e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625315  normal  0.0311111 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3963  AraC family transcriptional regulator  43.79 
 
 
335 aa  279  6e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0488  AraC family transcriptional regulator  43.79 
 
 
335 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3836  AraC family transcriptional regulator  44.06 
 
 
335 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3780  transcriptional regulator, AraC family  43.79 
 
 
335 aa  276  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  43.67 
 
 
333 aa  257  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  43.04 
 
 
333 aa  253  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0514  transcriptional regulator, AraC family  44.72 
 
 
334 aa  251  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2002  AraC family transcriptional regulator  43.77 
 
 
341 aa  248  7e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513633  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2612  AraC family transcriptional regulator  43.77 
 
 
341 aa  248  7e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2641  AraC family transcriptional regulator  43.99 
 
 
338 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5943  transcriptional regulator  42.99 
 
 
338 aa  246  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0489  transcriptional regulator, AraC family  46.13 
 
 
325 aa  246  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4085  transcriptional regulator, AraC family  42.77 
 
 
331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.825112  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4197  transcriptional regulator, AraC family  42.77 
 
 
331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  41.46 
 
 
321 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  43.85 
 
 
332 aa  241  7.999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1857  transcriptional regulator, AraC family  42.31 
 
 
342 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0051  transcriptional regulator  38.1 
 
 
323 aa  241  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.929929  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0686  AraC family transcriptional regulator  42.9 
 
 
330 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7121  transcriptional activator FtrA  41.99 
 
 
328 aa  237  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3261  transcriptional regulator, AraC family  45.4 
 
 
337 aa  237  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127584  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1334  putative transcriptional regulator  40.06 
 
 
317 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2532  AraC family transcriptional regulator  43.35 
 
 
333 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0705  AraC family transcriptional regulator  45.05 
 
 
331 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4236  transcriptional regulator, AraC family  39.74 
 
 
325 aa  235  8e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15150  putative transcriptional regulator  40.06 
 
 
317 aa  235  9e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  hitchhiker  0.0000298096 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3186  AraC family transcriptional regulator  37.3 
 
 
333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0419  arac-family transcriptional regulator  36.42 
 
 
317 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000111496  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3031  transcriptional activator FtrA  38.59 
 
 
333 aa  233  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00937108  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1531  transcriptional regulator, AraC family  45.83 
 
 
316 aa  232  5e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.608485 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2364  transcriptional regulator, AraC family  40.19 
 
 
322 aa  231  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0527  transcriptional regulator, AraC family  37.54 
 
 
318 aa  231  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0056  transcriptional activator FtrA  38.85 
 
 
326 aa  226  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  40.84 
 
 
329 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3284  transcriptional activator FtrA  38.26 
 
 
333 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.059892 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1218  transcriptional regulator, AraC family  42.44 
 
 
323 aa  224  1e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0431  transcriptional regulator, AraC family  42.47 
 
 
320 aa  224  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2631  transcriptional regulator  39.62 
 
 
347 aa  224  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133443  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  42.36 
 
 
322 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4403  transcriptional activator FtrA  40.58 
 
 
333 aa  221  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4426  transcriptional activator FtrA  38.19 
 
 
331 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2327  transcriptional regulator  35.9 
 
 
316 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.223293  normal  0.02817 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1097  ThiJ/PfpI domain protein  40.87 
 
 
350 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266562  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0923  AraC family transcriptional regulator  45.63 
 
 
331 aa  220  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147864  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1985  transcriptional activator FtrA  36.79 
 
 
333 aa  220  3e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0670847 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2157  AraC family transcriptional regulator  41.01 
 
 
346 aa  219  6e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256833  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3587  transcriptional activator FtrA  37.74 
 
 
329 aa  219  6e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116485  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  41.48 
 
 
340 aa  219  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4339  transcriptional regulator, AraC family  40.72 
 
 
334 aa  218  7.999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.400268 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1271  transcriptional regulator, AraC family  43.17 
 
 
317 aa  216  5.9999999999999996e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1234  AraC family transcriptional regulator  38.56 
 
 
335 aa  215  7e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4747  AraC family transcriptional regulator  38.91 
 
 
320 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0778  transcriptional activator FtrA  40.76 
 
 
324 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221913  normal  0.0400061 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2214  transcriptional activator FtrA  39.87 
 
 
318 aa  212  9e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00591748  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0964  transcriptional activator FtrA  39.56 
 
 
318 aa  212  9e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2150  transcriptional activator FtrA  35.35 
 
 
330 aa  211  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.077741  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3453  transcriptional activator FtrA  40.45 
 
 
320 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4913  transcriptional activator FtrA  40.45 
 
 
320 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.860168  normal  0.680733 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0835  transcriptional activator FtrA  39.56 
 
 
318 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5328  transcriptional activator FtrA  39.87 
 
 
324 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.417039 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0872  transcriptional activator FtrA  39.56 
 
 
318 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.637455  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1565  transcriptional activator FtrA  39.56 
 
 
318 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0715182  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3843  transcriptional regulator, AraC family  41.43 
 
 
339 aa  210  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.295718  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0055  transcriptional activator FtrA  39.56 
 
 
318 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00213604  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  38.61 
 
 
327 aa  210  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1058  transcriptional regulator, AraC family  42.02 
 
 
322 aa  210  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4864  transcriptional activator FtrA  39.81 
 
 
324 aa  209  6e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  hitchhiker  0.000178687 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5373  transcriptional activator FtrA  40.13 
 
 
320 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379602  normal  0.0775766 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3699  transcriptional activator FtrA  39.87 
 
 
324 aa  207  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507684  normal  0.317961 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3202  transcriptional regulator, AraC family  38.56 
 
 
330 aa  208  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125903  unclonable  0.000000000016632 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4348  transcriptional activator FtrA  39.81 
 
 
324 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000580095 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  38.29 
 
 
325 aa  207  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9264  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  41.32 
 
 
328 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1437  AraC family transcriptional regulator  36.66 
 
 
326 aa  207  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5972  transcriptional regulator, AraC family  39.62 
 
 
343 aa  206  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3631  transcriptional regulator, AraC family  38.8 
 
 
327 aa  206  6e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3344  transcriptional regulator, AraC family  43.27 
 
 
306 aa  204  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107128  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6432  AraC family transcriptional regulator  38.03 
 
 
332 aa  204  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  39.81 
 
 
342 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1760  transcriptional activator FtrA  39.56 
 
 
318 aa  204  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2289  transcriptional regulator, AraC family  40.37 
 
 
332 aa  204  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0296172  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5179  transcriptional regulator, AraC family  40.12 
 
 
352 aa  203  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1692  transcriptional regulator, AraC family  39.32 
 
 
333 aa  202  8e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6166  transcriptional regulator, AraC family  38.61 
 
 
362 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0220245  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1215  transcriptional regulator, AraC family  38.14 
 
 
356 aa  199  5e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0161998 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1680  transcriptional regulator, AraC family  38.99 
 
 
319 aa  199  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00886314  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4599  transcriptional regulator, AraC family  39.49 
 
 
332 aa  199  7e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6224  AraC family transcriptional regulator  48.18 
 
 
367 aa  199  7e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2856  AraC family transcriptional regulator  38.87 
 
 
314 aa  199  7.999999999999999e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3112  ThiJ/PfpI domain protein  38.24 
 
 
321 aa  197  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.226454  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2740  transcriptional activator FtrA  35.06 
 
 
317 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2955  transcriptional regulator, AraC family  38.01 
 
 
317 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.012422  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3549  transcriptional regulator, AraC family  36.62 
 
 
337 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.757715  normal  0.622262 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  41.77 
 
 
326 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>