111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4124 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4124  Saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 361 aa  702    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1643  saccharopine dehydrogenase  40.82 
 
 		 382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15850  UbiD family decarboxylase  43.44 
 
 		 376 aa  211  1e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.647693  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3455  saccharopine dehydrogenase  46.72 
 
 		 378 aa  209  7e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.750747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0316  saccharopine dehydrogenase  42.42 
 
 		 395 aa  162  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.424303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56730  hypothetical protein  32.73 
 
 		 352 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4933  hypothetical protein  33.33 
 
 		 352 aa  123  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.76632  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2359  Saccharopine dehydrogenase  33.65 
 
 		 345 aa  123  6e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0263338  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3399  Saccharopine dehydrogenase  29.48 
 
 		 350 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1361  Saccharopine dehydrogenase  30.58 
 
 		 376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2027  saccharopine dehydrogenase  28.57 
 
 		 351 aa  114  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0488088  normal  0.664425 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1135  Saccharopine dehydrogenase  42.08 
 
 		 368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001157  putative integral membrane protein  26.35 
 
 		 360 aa  110  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1054  hypothetical protein  28.89 
 
 		 351 aa  109  8.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2123  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  37.11 
 
 		 419 aa  109  8.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0383643 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1149  hypothetical protein  28.99 
 
 		 351 aa  109  9.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3635  Saccharopine dehydrogenase  28.25 
 
 		 363 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1339  Saccharopine dehydrogenase  34.24 
 
 		 343 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.072139  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3058  saccharopine dehydrogenase  31.25 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5762  Saccharopine dehydrogenase  22.9 
 
 		 355 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.353531 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4206  saccharopine dehydrogenase  30.05 
 
 		 371 aa  99.8  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3887  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  39.1 
 
 		 386 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.011216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3396  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  39.61 
 
 		 389 aa  97.4  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.705544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0138  saccharopine dehydrogenase  33.33 
 
 		 432 aa  96.7  6e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3008  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  40.68 
 
 		 402 aa  96.3  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.762164  normal  0.0490762 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0783  saccharopine dehydrogenase  32.86 
 
 		 388 aa  95.9  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4764  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  30.43 
 
 		 410 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1653  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  37.89 
 
 		 398 aa  95.1  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0173557  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2986  saccharopine dehydrogenase  31.19 
 
 		 365 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3672  saccharopine dehydrogenase  29.43 
 
 		 353 aa  94  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.420648 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3084  Saccharopine dehydrogenase  31.53 
 
 		 352 aa  93.6  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3639  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  37.99 
 
 		 389 aa  92.8  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3185  Saccharopine dehydrogenase  31.43 
 
 		 352 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.418477  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0129  hypothetical protein  32.05 
 
 		 432 aa  90.9  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.150233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3229  Saccharopine dehydrogenase  27.72 
 
 		 405 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0356215 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2098  Saccharopine dehydrogenase  45.33 
 
 		 406 aa  90.1  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.176484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5529  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  31.85 
 
 		 413 aa  89.7  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12850  hypothetical protein  36.77 
 
 		 391 aa  89.4  9e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5681  saccharopine dehydrogenase  30.8 
 
 		 416 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6045  saccharopine dehydrogenase  30.8 
 
 		 416 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.233405 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1105  Saccharopine dehydrogenase  36.36 
 
 		 422 aa  87.8  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0726  Saccharopine dehydrogenase  34.95 
 
 		 421 aa  87  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.945634  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7476  putative saccharopine dehydrogenase  32.04 
 
 		 414 aa  87  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4609  hypothetical protein  26.58 
 
 		 392 aa  86.7  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.856643  normal  0.0914614 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6392  saccharopine dehydrogenase:NmrA-like  28.18 
 
 		 377 aa  85.9  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.370059  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2140  saccharopine dehydrogenase  36.49 
 
 		 389 aa  85.5  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.307672 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6531  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  31.94 
 
 		 416 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429838  normal  0.0830191 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5854  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  31.75 
 
 		 419 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1088  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  37.58 
 
 		 430 aa  85.9  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.147664  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2746  saccharopine dehydrogenase  28.76 
 
 		 377 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000611807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2628  saccharopine dehydrogenase  36.76 
 
 		 420 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4278  saccharopine dehydrogenase  33.78 
 
 		 388 aa  84.7  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3559  saccharopine dehydrogenase  35.75 
 
 		 419 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.924034  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3632  saccharopine dehydrogenase  35.75 
 
 		 419 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.288883 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3564  saccharopine dehydrogenase  35.75 
 
 		 419 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2039  Saccharopine dehydrogenase  37.97 
 
 		 409 aa  84.3  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.823725  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2300  Saccharopine dehydrogenase  39.01 
 
 		 408 aa  84  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0134168  hitchhiker  0.00267876 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0528  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  30.69 
 
 		 414 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0538  saccharopine dehydrogenase  36.91 
 
 		 394 aa  84  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01040  Saccharopine dehydrogenase  33.7 
 
 		 391 aa  84  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6092  saccharopine dehydrogenase  31.22 
 
 		 419 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0541  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  30.16 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1467  saccharopine dehydrogenase  30.37 
 
 		 413 aa  81.3  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.071229  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12475  hypothetical protein  38.41 
 
 		 419 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.487465 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0966  saccharopine dehydrogenase  33.33 
 
 		 394 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.287353  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12967  hypothetical protein  35.85 
 
 		 418 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6607  saccharopine dehydrogenase  29.91 
 
 		 340 aa  79.7  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4088  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  34.04 
 
 		 422 aa  79.3  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0761  saccharopine dehydrogenase  32.14 
 
 		 390 aa  79  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.092015  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07293  conserved hypothetical protein  25.98 
 
 		 430 aa  78.2  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.087222 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0612  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  37.5 
 
 		 404 aa  78.2  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0147  saccharopine dehydrogenase  35.81 
 
 		 390 aa  77.4  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3626  saccharopine dehydrogenase  34.76 
 
 		 410 aa  76.3  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1410  saccharopine dehydrogenase  34 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0176  hypothetical protein  27.03 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0020  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  32.64 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.947878 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32292  predicted protein  29.94 
 
 		 502 aa  74.3  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0355171  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5035  saccharopine dehydrogenase  27.96 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5825  saccharopine dehydrogenase  27.96 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.382888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4354  saccharopine dehydrogenase  27.96 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2468  saccharopine dehydrogenase  35.33 
 
 		 392 aa  73.6  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1758  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  27.51 
 
 		 407 aa  73.6  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.819467 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3544  putative integral membrane protein  26.74 
 
 		 324 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3953  saccharopine dehydrogenase  35 
 
 		 421 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0682928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5296  saccharopine dehydrogenase  29.14 
 
 		 351 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.813788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3474  saccharopine dehydrogenase  29.75 
 
 		 351 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1404  saccharopine dehydrogenase  24.93 
 
 		 344 aa  68.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.581965 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2873  saccharopine dehydrogenase  34.29 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4494  saccharopine dehydrogenase  36.43 
 
 		 343 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0514  saccharopine dehydrogenase  31.25 
 
 		 377 aa  63.2  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2316  Saccharopine dehydrogenase  33.33 
 
 		 413 aa  59.3  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.385349  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03750  conserved hypothetical protein  30.41 
 
 		 427 aa  56.6  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0864  saccharopine dehydrogenase  25.55 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.109477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_41409  predicted protein  23.81 
 
 		 1506 aa  55.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.974379  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34724  predicted protein  33.58 
 
 		 454 aa  53.5  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1613  hypothetical protein  31.21 
 
 		 342 aa  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.899214  normal  0.0629949 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  24.5 
 
 		 415 aa  51.2  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89710  predicted protein  30.61 
 
 		 436 aa  50.8  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.332936 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0494  saccharopine dehydrogenase  29.85 
 
 		 371 aa  51.2  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.961307  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.17 
 
 		 377 aa  50.4  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00494367  normal  0.0229045 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>