More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4065 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4065  SNARE associated Golgi protein-like protein  100 
 
 		 240 aa  471  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4066  SNARE associated Golgi protein-like protein  63.86 
 
 		 248 aa  259  3e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0237  hypothetical protein  55.84 
 
 		 236 aa  239  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0668  hypothetical protein  54.7 
 
 		 232 aa  237  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0501  hypothetical protein  55.65 
 
 		 231 aa  231  5e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0512  hypothetical protein  55.65 
 
 		 231 aa  231  5e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0490  hypothetical protein  55.65 
 
 		 231 aa  231  5e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164166  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0509  SNARE associated Golgi protein-related protein  55.46 
 
 		 239 aa  230  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35260  uncharacterized membrane-associated protein  48.95 
 
 		 277 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10369  transmembrane protein  49.56 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.702136 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  53.4 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  51.82 
 
 		 268 aa  202  3e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  51.94 
 
 		 237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6926  SNARE associated Golgi protein  46.52 
 
 		 249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  47.37 
 
 		 286 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  49.55 
 
 		 363 aa  194  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  46.05 
 
 		 259 aa  179  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5157  SNARE associated Golgi protein  49.74 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  43.46 
 
 		 256 aa  169  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  47.34 
 
 		 221 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  46.81 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  44.28 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3663  SNARE associated Golgi protein-like protein  39.34 
 
 		 209 aa  161  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  44.28 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  43.78 
 
 		 219 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  43.78 
 
 		 219 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  43.78 
 
 		 219 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  42.05 
 
 		 219 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  42.05 
 
 		 219 aa  157  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0005  integral membrane protein; DedA family protein  46.94 
 
 		 218 aa  157  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.695694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  42.05 
 
 		 219 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  41.79 
 
 		 220 aa  156  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  42.05 
 
 		 219 aa  157  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  42.05 
 
 		 219 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  42.05 
 
 		 219 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  42.41 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  42.41 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  42.41 
 
 		 219 aa  154  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  40.19 
 
 		 221 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  40 
 
 		 221 aa  152  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  42.71 
 
 		 222 aa  152  5e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  44.5 
 
 		 216 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  40.78 
 
 		 220 aa  151  8e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  39.32 
 
 		 219 aa  149  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  41.94 
 
 		 217 aa  148  7e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  39.52 
 
 		 232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  38.65 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4379  hypothetical protein  46.2 
 
 		 234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.76296  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1595  phosphoesterase, PA-phosphatase related  44.1 
 
 		 458 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3233  SNARE associated Golgi protein  36.59 
 
 		 230 aa  146  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30240  uncharacterized membrane-associated protein  38.86 
 
 		 228 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.397546 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4180  SNARE associated Golgi protein  41.2 
 
 		 246 aa  144  9e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.531841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4994  hypothetical protein  43.72 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0585  SNARE associated Golgi protein  42.02 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654254 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  39.39 
 
 		 213 aa  144  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  37.25 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  36.59 
 
 		 215 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  41.71 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  40.1 
 
 		 220 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  40.1 
 
 		 220 aa  143  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  36.87 
 
 		 211 aa  142  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  40.1 
 
 		 220 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  36.1 
 
 		 215 aa  142  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0724  DedA family protein  40.59 
 
 		 215 aa  142  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3379  SNARE associated Golgi protein-related protein  39.69 
 
 		 216 aa  142  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3395  SNARE associated Golgi protein  42.02 
 
 		 216 aa  142  5e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  37 
 
 		 224 aa  142  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  38.73 
 
 		 221 aa  141  8e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  36.94 
 
 		 253 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  43.45 
 
 		 201 aa  141  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4353  DedA family membrane protein  38.12 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0592  SNARE associated Golgi protein  42.55 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2073  SNARE associated Golgi protein-like protein  43.32 
 
 		 231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  37 
 
 		 214 aa  138  7e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0086  SNARE associated Golgi protein  39.8 
 
 		 216 aa  137  2e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.862215  hitchhiker  0.00916794 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  38.89 
 
 		 220 aa  137  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  36.68 
 
 		 220 aa  136  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  39.34 
 
 		 227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4444  SNARE associated Golgi protein  41.8 
 
 		 218 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0626  hypothetical protein  40 
 
 		 215 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1922  hypothetical protein  42.27 
 
 		 218 aa  135  6.0000000000000005e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000155723  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2907  hypothetical protein  36.18 
 
 		 219 aa  134  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0540  SNARE associated Golgi protein  41.49 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0667  DedA family protein  39.09 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385755  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0579  SNARE associated Golgi protein  41.49 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.6837  normal  0.582888 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2484  SNARE associated Golgi protein  39.71 
 
 		 229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2173  hypothetical protein  38.5 
 
 		 218 aa  132  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0706  SNARE associated Golgi protein-like protein  40.82 
 
 		 213 aa  132  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.240923  normal  0.524025 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4068  SNARE associated Golgi protein  35.78 
 
 		 220 aa  132  6e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  37.7 
 
 		 220 aa  132  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2201  hypothetical protein  37.97 
 
 		 218 aa  131  7.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0208  SNARE associated Golgi protein-like protein  40.09 
 
 		 226 aa  131  7.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  40.88 
 
 		 218 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  41.18 
 
 		 214 aa  131  9e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5129  SNARE associated Golgi protein  38.55 
 
 		 244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0751  SNARE associated Golgi protein  38.28 
 
 		 223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  36.92 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  41.34 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  40.78 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  41.62 
 
 		 219 aa  129  5.0000000000000004e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>