35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4060 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4060  membrane protein-like protein  100 
 
 		 367 aa  715    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.270426  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0515  hypothetical protein  54.22 
 
 		 388 aa  375  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6914  hypothetical protein  40.74 
 
 		 359 aa  227  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5891  membrane protein-like protein  39.42 
 
 		 371 aa  194  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8716  membrane protein-like protein  35.29 
 
 		 365 aa  193  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3085  membrane protein-like protein  35.69 
 
 		 373 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000157468 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3171  hypothetical protein  34.51 
 
 		 378 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12810  predicted membrane protein  31.99 
 
 		 396 aa  162  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.157231  decreased coverage  0.00366432 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0274  membrane protein-like protein  35.69 
 
 		 399 aa  157  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.024335 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0361  hypothetical protein  33.52 
 
 		 375 aa  156  6e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0317  membrane protein-like protein  35.41 
 
 		 425 aa  153  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0942874  hitchhiker  0.000244181 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0201  hypothetical protein  32.1 
 
 		 375 aa  146  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0445  hypothetical protein  31.1 
 
 		 369 aa  145  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.379085 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4101  membrane protein-like protein  33.99 
 
 		 369 aa  144  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.453683 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01600  hypothetical protein  35.85 
 
 		 389 aa  144  3e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3414  hypothetical protein  35.14 
 
 		 379 aa  139  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2373  membrane protein-like protein  34.38 
 
 		 378 aa  133  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3704  hypothetical protein  33.05 
 
 		 366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0978741  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25710  predicted membrane protein  29.71 
 
 		 443 aa  109  9.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04990  predicted membrane protein  30.75 
 
 		 365 aa  104  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2813  hypothetical protein  37.77 
 
 		 431 aa  95.5  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12591  hypothetical protein  30.96 
 
 		 355 aa  92  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.168318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3027  membrane protein-like protein  32.39 
 
 		 374 aa  87.4  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3973  hypothetical protein  26.5 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215582  hitchhiker  0.00962889 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0385  hypothetical protein  26.13 
 
 		 347 aa  65.5  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0370  hypothetical protein  26.13 
 
 		 347 aa  65.5  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.168954  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0479  hypothetical protein  30 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2712  hypothetical protein  37.3 
 
 		 395 aa  59.7  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.354831 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05220  hypothetical protein  22.31 
 
 		 366 aa  50.8  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8385  protein of unknown function DUF939  24.72 
 
 		 415 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2972  membrane protein-like protein  30.16 
 
 		 401 aa  49.7  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211258  normal  0.0161367 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1593  hypothetical protein  36.22 
 
 		 176 aa  48.5  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419241  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4561  membrane protein  29.81 
 
 		 391 aa  47.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07150  predicted membrane protein  24.04 
 
 		 392 aa  45.8  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.269027 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2089  membrane protein  28.77 
 
 		 409 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>