156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4056 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4056  peptidase M50  100 
 
 
276 aa  537  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0507  peptidase M50  50 
 
 
259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0518  peptidase M50  50 
 
 
259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0496  peptidase M50  50 
 
 
259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0867338  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0674  peptidase M50  47.74 
 
 
259 aa  218  6e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.945567  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0230  peptidase M50  48.65 
 
 
256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.074479  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3906  peptidase M50  46.4 
 
 
267 aa  206  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10364  integral membrane protein  48.29 
 
 
259 aa  202  5e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.215218  normal  0.790846 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3543  peptidase M50  47.71 
 
 
265 aa  190  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000703837 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3311  peptidase M50  46.56 
 
 
254 aa  187  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107098  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31080  Zn-dependent protease  42.86 
 
 
256 aa  167  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.726243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2333  peptidase M50  38.97 
 
 
281 aa  166  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4173  peptidase M50  42.22 
 
 
252 aa  149  7e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.917374  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6332  peptidase M50  46.05 
 
 
226 aa  142  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000444849  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3959  peptidase M50  40.81 
 
 
259 aa  142  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227967  normal  0.395043 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0488  putative peptidase  36.36 
 
 
283 aa  126  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3906  peptidase M50  35.45 
 
 
358 aa  123  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1047  peptidase M50  32.83 
 
 
245 aa  89.4  6e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5073  membrane protein; metalloprotease  32.51 
 
 
224 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5058  membrane protein; metalloprotease  32.51 
 
 
224 aa  85.5  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5170  peptidase M50  32.51 
 
 
224 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5225  hypothetical protein  32.51 
 
 
224 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0980  hypothetical protein  30.89 
 
 
219 aa  84.3  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0950  hypothetical protein  30.89 
 
 
219 aa  84.3  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5625  hypothetical protein  32.51 
 
 
224 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5555  peptidase, M50 family  32.51 
 
 
224 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5506  hypothetical protein  32.51 
 
 
224 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5469  peptidase, M50 family  32.02 
 
 
224 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5499  peptidase, M50 family  32.51 
 
 
224 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5451  peptidase, M50 family  32.51 
 
 
224 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3464  peptidase M50  35.14 
 
 
222 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1298  Zn-dependent proteases  31.47 
 
 
247 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3898  peptidase M50  32.85 
 
 
224 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5642  peptidase M50  31.16 
 
 
229 aa  76.3  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.723367 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3354  peptidase M50  34.74 
 
 
225 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000013117  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2208  hypothetical protein  29.52 
 
 
205 aa  73.9  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2251  peptidase M50  30.89 
 
 
226 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694823  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1748  peptidase M50  34.36 
 
 
213 aa  72.8  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.658788  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1737  peptidase M50  31.79 
 
 
201 aa  72.4  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1229  peptidase M50  30.9 
 
 
222 aa  71.6  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000442117  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0386  peptidase M50  27.45 
 
 
220 aa  71.2  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0579866  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0830  M50 family peptidase  32.83 
 
 
218 aa  72  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.115362  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1881  peptidase M50  30.94 
 
 
225 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000148344  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1961  peptidase M50  32.42 
 
 
226 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000652923  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2118  peptidase M50  33.68 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.507617  normal  0.0277239 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1202  peptidase M50  34.9 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3859  peptidase M50  29.69 
 
 
214 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1924  peptidase M50  32.98 
 
 
226 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1653  peptidase M50  29.23 
 
 
220 aa  68.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.580306 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0819  peptidase M50  31.55 
 
 
213 aa  68.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2259  peptidase M50  28.12 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1834  M50 family peptidase  29.84 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143147  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2299  peptidase M50  30.53 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1685  peptidase M50  31.88 
 
 
219 aa  65.9  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.800401  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0801  peptidase M50  28.57 
 
 
216 aa  65.5  0.0000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2981  peptidase M50  30.73 
 
 
215 aa  64.7  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1036  peptidase M50  32 
 
 
223 aa  63.9  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.375981  normal  0.481389 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2016  peptidase M50  26.98 
 
 
227 aa  63.9  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0347485  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2485  peptidase M50  31.69 
 
 
235 aa  62.8  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.904327  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0685  peptidase M50  30 
 
 
223 aa  62.8  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1362  peptidase M50  31.49 
 
 
209 aa  60.8  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1172  peptidase M50  28.8 
 
 
214 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.346735  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1365  peptidase M50  32.48 
 
 
217 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.572687 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2170  peptidase M50  32.11 
 
 
222 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141859  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1225  peptidase M50  29.57 
 
 
226 aa  60.5  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.460426  normal  0.363921 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5404  peptidase M50  28.5 
 
 
220 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.535457  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1231  peptidase M50  29.73 
 
 
216 aa  60.1  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2135  peptidase M50  29.02 
 
 
220 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3547  hypothetical protein  32.18 
 
 
226 aa  60.1  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1456  peptidase M50  29.67 
 
 
218 aa  59.7  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2756  peptidase M50  28.64 
 
 
232 aa  59.7  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000185404  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0984  peptidase M50  27.62 
 
 
221 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0881393 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1102  peptidase M50  27.62 
 
 
221 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2008  peptidase M50  29.02 
 
 
220 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672002  hitchhiker  0.0000725285 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1686  peptidase M50  32.11 
 
 
222 aa  59.3  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2568  M50 family peptidase  27.81 
 
 
221 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1681  M50 family peptidase  29.26 
 
 
221 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1624  peptidase M50  27.14 
 
 
225 aa  58.2  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0374548  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1066  peptidase M50  28.57 
 
 
221 aa  58.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.128232  normal  0.764642 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2183  M50 family peptidase  29.26 
 
 
221 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3134  M50 family peptidase  29.26 
 
 
221 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.524339  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2622  M50 family peptidase  29.26 
 
 
221 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1456  M50 family peptidase  29.26 
 
 
221 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.848737  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1132  peptidase M50  31.65 
 
 
207 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.262722  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1903  M50 family peptidase  29.26 
 
 
221 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5979  peptidase M50  27.57 
 
 
220 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189316  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2098  peptidase M50  27.57 
 
 
220 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3710  peptidase M50  30.05 
 
 
222 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0475  peptidase M50  27.6 
 
 
239 aa  57.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1937  peptidase, M50 family protein  31.25 
 
 
230 aa  58.2  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000010669  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2116  peptidase M50  27.57 
 
 
220 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00340207 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1776  peptidase M50  28.92 
 
 
228 aa  57.4  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00724949  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07160  peptidase M50  26.73 
 
 
218 aa  57  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000643376  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1686  peptidase M50  28.57 
 
 
225 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.156673  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1080  peptidase M50  27.07 
 
 
221 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146579  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4024  peptidase M50  29.35 
 
 
223 aa  57.4  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.684648  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0256  membrane endopeptidase, M50 family  31.25 
 
 
230 aa  57  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1176  peptidase M50  28.29 
 
 
220 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000267002 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1271  peptidase M50  30.32 
 
 
227 aa  56.6  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194788  normal  0.0570245 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3427  peptidase M50  28.18 
 
 
214 aa  56.6  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>