298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4014 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4014  dihydroneopterin aldolase  100 
 
 
125 aa  249  1e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0562  dihydroneopterin aldolase  76.8 
 
 
127 aa  187  3e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5153  dihydroneopterin aldolase  74.17 
 
 
123 aa  182  9e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.579067 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4853  dihydroneopterin aldolase  75.44 
 
 
125 aa  176  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4767  dihydroneopterin aldolase  75.44 
 
 
125 aa  176  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35620  dihydroneopterin aldolase  65.85 
 
 
130 aa  165  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.192701  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0316  dihydroneopterin aldolase  66.95 
 
 
125 aa  163  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.17709  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13639  dihydroneopterin aldolase folB  69.3 
 
 
133 aa  160  7e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00551431  hitchhiker  0.00236264 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5369  dihydroneopterin aldolase  71.9 
 
 
124 aa  158  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040071 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1419  dihydroneopterin aldolase  73.33 
 
 
123 aa  154  5e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.391018 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0851  dihydroneopterin aldolase  62.9 
 
 
131 aa  138  2e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4974  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  58.82 
 
 
310 aa  135  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.21423  normal  0.895367 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4731  dihydroneopterin aldolase  58.33 
 
 
120 aa  134  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0109626  decreased coverage  2.15916e-05 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9171  Dihydroneopterin aldolase  55.46 
 
 
120 aa  134  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2891  dihydroneopterin aldolase  56.41 
 
 
126 aa  132  1e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4296  dihydroneopterin aldolase  56.78 
 
 
120 aa  130  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.505209 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0317  dihydroneopterin aldolase  52.94 
 
 
135 aa  128  2e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4406  dihydroneopterin aldolase  56.41 
 
 
155 aa  127  4e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.114139  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01270  dihydroneopterin aldolase  58.47 
 
 
126 aa  127  7e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0169  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  56.67 
 
 
337 aa  126  1e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0060964  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8421  dihydroneopterin aldolase  51.69 
 
 
147 aa  125  1e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6217  dihydroneopterin aldolase  52.54 
 
 
123 aa  124  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0541  dihydroneopterin aldolase  54.24 
 
 
137 aa  123  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0208  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  55.56 
 
 
333 aa  123  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0493459 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2101  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  50.43 
 
 
841 aa  122  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0630  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridin epyrophosphokinase  52.46 
 
 
525 aa  118  2e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00284446  normal  0.33156 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32060  dihydroneopterin aldolase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  52.14 
 
 
1211 aa  118  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4501  dihydroneopterin aldolase  52.54 
 
 
124 aa  117  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0154  dihydroneopterin aldolase  47.46 
 
 
119 aa  113  7e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0447  dihydroneopterin aldolase  49.58 
 
 
128 aa  112  1e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2984  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  51.28 
 
 
612 aa  111  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.261755  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0705  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridin epyrophosphokinase  52.46 
 
 
372 aa  111  4e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.912553  normal  0.672512 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3443  dihydroneopterin aldolase  55.56 
 
 
135 aa  109  1e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.996393  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1852  dihydroneopterin aldolase  46.03 
 
 
470 aa  99.4  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0155  dihydroneopterin aldolase  40.5 
 
 
131 aa  98.2  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0407  dihydroneopterin aldolase  43.22 
 
 
122 aa  95.5  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  decreased coverage  0.00598583 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24750  dihydroneopterin aldolase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  43.7 
 
 
295 aa  95.5  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3025  dihydroneopterin aldolase (DHNA)  44.17 
 
 
122 aa  95.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0152  dihydroneopterin aldolase  39.83 
 
 
122 aa  94.7  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.011872  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0619  dihydroneopterin aldolase  47.86 
 
 
128 aa  93.6  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4785  dihydroneopterin aldolase  46.61 
 
 
144 aa  92.8  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0888028  normal  0.076763 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0826  dihydroneopterin aldolase  42.37 
 
 
125 aa  90.5  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2234  dihydroneopterin aldolase  41.67 
 
 
121 aa  89.7  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1764  dihydroneopterin aldolase  41.8 
 
 
126 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3529  dihydroneopterin aldolase  43.22 
 
 
145 aa  88.2  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.959626  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0236  dihydroneopterin aldolase  41.18 
 
 
121 aa  87.8  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.965704 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2043  dihydroneopterin aldolase  39.67 
 
 
121 aa  87.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1931  dihydroneopterin aldolase  38.84 
 
 
125 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.190594  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12830  dihydroneopterin aldolase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  41.53 
 
 
305 aa  86.7  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0897405  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3534  dihydroneopterin aldolase  38.84 
 
 
125 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0920565  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0537  dihydroneopterin aldolase  37.19 
 
 
121 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0923688  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0550  dihydroneopterin aldolase  37.19 
 
 
121 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2634  dihydroneopterin aldolase  40.83 
 
 
121 aa  84.3  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0808161  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3225  dihydroneopterin aldolase family protein  42.31 
 
 
121 aa  83.2  1e-15  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0154  dihydroneopterin aldolase  40.35 
 
 
121 aa  82.4  2e-15  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.867161  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0084  dihydroneopterin aldolase  37.29 
 
 
120 aa  81.6  3e-15  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.940735  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0040  dihydroneopterin aldolase dihydroneopterin aldolase  38.21 
 
 
125 aa  81.6  3e-15  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0071  dihydroneopterin aldolase  37.29 
 
 
120 aa  81.6  3e-15  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0329  dihydroneopterin aldolase  40 
 
 
126 aa  81.6  3e-15  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0687  dihydroneopterin aldolase  40.78 
 
 
120 aa  81.3  4e-15  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2582  dihydroneopterin aldolase  39.66 
 
 
122 aa  81.3  4e-15  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0068  dihydroneopterin aldolase  37.29 
 
 
120 aa  81.3  4e-15  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0072  dihydroneopterin aldolase  37.29 
 
 
120 aa  81.3  4e-15  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0081  dihydroneopterin aldolase  37.29 
 
 
120 aa  81.3  4e-15  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08398e-06 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0072  dihydroneopterin aldolase  37.29 
 
 
120 aa  81.3  4e-15  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0068  dihydroneopterin aldolase  37.29 
 
 
120 aa  81.3  4e-15  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0068  dihydroneopterin aldolase  37.29 
 
 
120 aa  81.3  4e-15  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0080  dihydroneopterin aldolase  37.29 
 
 
120 aa  80.9  5e-15  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.884777  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2579  dihydroneopterin aldolase  46.46 
 
 
126 aa  80.9  6e-15  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1428  dihydroneopterin aldolase  35.92 
 
 
120 aa  80.1  9e-15  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5236  dihydroneopterin aldolase  36.44 
 
 
120 aa  79.7  1e-14  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  9.22875e-06 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0068  dihydroneopterin aldolase  36.44 
 
 
120 aa  79.7  1e-14  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27090  dihydroneopterin aldolase  38.14 
 
 
119 aa  79.7  1e-14  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5982  dihydroneopterin aldolase  41.67 
 
 
122 aa  79  2e-14  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102976  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0921  dihydroneopterin aldolase  39.42 
 
 
119 aa  78.2  3e-14  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.294269  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2116  dihydroneopterin aldolase  39.09 
 
 
119 aa  77.4  6e-14  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0311  dihydroneopterin aldolase  39.83 
 
 
118 aa  76.6  9e-14  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0073  dihydroneopterin aldolase  35.59 
 
 
126 aa  76.3  1e-13  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1882  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  35.71 
 
 
292 aa  76.6  1e-13  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.586042  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1880  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  35.77 
 
 
276 aa  75.5  2e-13  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00242746  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1765  dihydroneopterin aldolase  40.98 
 
 
126 aa  75.9  2e-13  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0803324  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0965  dihydroneopterin aldolase  38.68 
 
 
128 aa  75.1  3e-13  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.877647  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1813  dihydroneopterin aldolase  39.67 
 
 
130 aa  75.1  3e-13  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.968446 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1114  dihydroneopterin aldolase  35.59 
 
 
120 aa  74.3  5e-13  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1072  dihydroneopterin aldolase  33.61 
 
 
135 aa  73.9  6e-13  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000958516 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2247  dihydroneopterin aldolase  38.79 
 
 
122 aa  73.9  7e-13  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.830681  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0512  dihydroneopterin aldolase  39.32 
 
 
125 aa  73.9  7e-13  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2149  dihydroneopterin aldolase  38.84 
 
 
130 aa  72.8  2e-12  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.457154  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1499  dihydroneopterin aldolase  37.82 
 
 
119 aa  72  3e-12  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00115418  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1230  dihydroneopterin aldolase  41.53 
 
 
127 aa  71.6  3e-12  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0996  dihydroneopterin aldolase  41 
 
 
119 aa  70.9  6e-12  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1030  dihydroneopterin aldolase  41 
 
 
119 aa  70.9  6e-12  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.235973  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0096  dihydroneopterin aldolase  42.37 
 
 
123 aa  70.5  7e-12  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1675  dihydroneopterin aldolase  35.78 
 
 
143 aa  68.9  2e-11  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0522559 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0397  dihydroneopterin aldolase  38.74 
 
 
124 aa  68.9  2e-11  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.294634  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1044  dihydroneopterin aldolase  34.75 
 
 
119 aa  68.2  3e-11  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00112146  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0517  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  38.38 
 
 
291 aa  68.2  4e-11  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.200312  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0098  dihydroneopterin aldolase; RBL03201  42.86 
 
 
123 aa  68.2  4e-11  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.473342  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03450  dihydroneopterin aldolase FolB, putative  36.73 
 
 
117 aa  67  8e-11  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1533  dihydroneopterin aldolase  36.36 
 
 
123 aa  66.2  1e-10  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.42318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>