More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3937 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3937  Thiosulfate sulfurtransferase  100 
 
 
279 aa  572  1.0000000000000001e-162  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3547  Thiosulfate sulfurtransferase  88.04 
 
 
277 aa  504  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.81334  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13137  thiosulfate sulfurtransferase cysA3  86.59 
 
 
277 aa  503  1e-141  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.34791 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10830  thiosulfate sulfurtransferase cysA2  86.59 
 
 
277 aa  503  1e-141  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594352 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5101  thiosulfate sulfurtransferase  86.96 
 
 
277 aa  501  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1646  thiosulfate sulfurtransferase  85.14 
 
 
277 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0108718  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4529  thiosulfate sulfurtransferase  82.61 
 
 
277 aa  484  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4616  thiosulfate sulfurtransferase  82.61 
 
 
277 aa  484  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4912  thiosulfate sulfurtransferase  82.61 
 
 
277 aa  484  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0296  rhodanese domain-containing protein  80.87 
 
 
301 aa  480  1e-134  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0340  rhodanese domain-containing protein  79.06 
 
 
282 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.316076  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1030  Thiosulfate sulfurtransferase  79.42 
 
 
283 aa  470  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0259593 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6828  Rhodanese domain protein  78.49 
 
 
281 aa  462  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4642  Rhodanese domain protein  78.47 
 
 
275 aa  456  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37710  rhodanese-related sulfurtransferase  76.53 
 
 
279 aa  448  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.272937 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0460  thiosulfate sulfurtransferase  76.34 
 
 
279 aa  447  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.755575  normal  0.367746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4986  Rhodanese domain protein  76.45 
 
 
275 aa  442  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0902  rhodanese-like domain protein  75.63 
 
 
279 aa  441  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8246  Rhodanese domain protein  75.72 
 
 
287 aa  438  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4351  thiosulfate sulfurtransferase  74.91 
 
 
281 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  0.607689 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4230  rhodanese domain-containing protein  74.37 
 
 
282 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0059  thiosulfate sulfurtransferase  76.98 
 
 
279 aa  432  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2719  thiosulfate sulfurtransferase  74.55 
 
 
279 aa  428  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0602  Thiosulfate sulfurtransferase  76.34 
 
 
279 aa  429  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0449  rhodanese-like protein  73.55 
 
 
277 aa  406  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.890664 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6169  rhodanese domain-containing protein  72.46 
 
 
277 aa  403  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845163  normal  0.179847 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  60 
 
 
288 aa  345  4e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0983  Rhodanese domain protein  56.27 
 
 
289 aa  322  3e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  57.82 
 
 
280 aa  319  3e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2206  thiosulfate sulfurtransferase  56 
 
 
286 aa  318  7.999999999999999e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0405  rhodanese domain-containing protein  54.23 
 
 
296 aa  314  9.999999999999999e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0954  Rhodanese domain protein  54.35 
 
 
283 aa  308  5.9999999999999995e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0717  rhodanese domain-containing protein  53.99 
 
 
281 aa  304  8.000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140717  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0920  Thiosulfate sulfurtransferase  52.65 
 
 
286 aa  304  1.0000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.189036 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0312  rhodanese domain-containing protein  53.99 
 
 
281 aa  304  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.811038  normal  0.0240425 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2270  Thiosulfate sulfurtransferase  52.5 
 
 
285 aa  303  2.0000000000000002e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2652  Rhodanese domain protein  54.51 
 
 
306 aa  298  5e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.619492  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0976  thiosulfate sulfurtransferase  54.09 
 
 
293 aa  298  6e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26242  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2352  thiosulfate sulfurtransferase  54.09 
 
 
293 aa  298  6e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287651  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5151  rhodanese domain-containing protein  54.81 
 
 
321 aa  296  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541862  normal  0.700824 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0028  rhodanese domain-containing protein  52.55 
 
 
297 aa  296  2e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53804  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0252  Rhodanese domain protein  54.64 
 
 
285 aa  296  3e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13312  thiosulfate sulfurtransferase sseA  51.62 
 
 
297 aa  293  2e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1488  rhodanese domain-containing protein  55.15 
 
 
355 aa  291  6e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.305791  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4335  rhodanese domain-containing protein  52.73 
 
 
308 aa  291  7e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1669  rhodanese domain-containing protein  51.62 
 
 
312 aa  291  8e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.704815  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3079  Rhodanese domain protein  52.13 
 
 
301 aa  291  8e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946899  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4780  rhodanese domain-containing protein  51.09 
 
 
305 aa  291  1e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.720691  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1146  Rhodanese domain protein  54.42 
 
 
297 aa  288  6e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0368023  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0441  rhodanese domain-containing protein  50.9 
 
 
281 aa  287  1e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000883325 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2095  Rhodanese domain protein  53.19 
 
 
297 aa  287  1e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1291  rhodanese-like protein  51.09 
 
 
298 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1308  rhodanese domain-containing protein  51.09 
 
 
298 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.207323  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1327  rhodanese domain-containing protein  51.09 
 
 
298 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.905195 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0899  thiosulfate sulfurtransferase  50.9 
 
 
282 aa  284  9e-76  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1977  rhodanese domain-containing protein  51.79 
 
 
291 aa  284  1.0000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1659  Rhodanese domain protein  52.48 
 
 
307 aa  283  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000135994 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2079  rhodanese domain-containing protein  53.68 
 
 
340 aa  282  5.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0912  Rhodanese domain protein  51.59 
 
 
305 aa  280  2e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1666  thiosulfate sulfurtransferase  51.77 
 
 
303 aa  278  7e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.200846  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10720  rhodanese-related sulfurtransferase  51.44 
 
 
297 aa  278  8e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00583448  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1808  Rhodanese domain protein  51.59 
 
 
297 aa  278  8e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1835  Rhodanese domain protein  50.36 
 
 
304 aa  277  1e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03590  rhodanese-related sulfurtransferase  50 
 
 
304 aa  275  6e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1034  Rhodanese domain protein  51.09 
 
 
297 aa  275  7e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0591  rhodanese domain-containing protein  48.8 
 
 
295 aa  266  2.9999999999999995e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1409  thiosulfate sulfurtransferase  48.58 
 
 
285 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0120648 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2659  Rhodanese domain protein  48.23 
 
 
293 aa  261  1e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.119104  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1687  Rhodanese domain protein  47.75 
 
 
290 aa  258  5.0000000000000005e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0301278  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1210  rhodanese domain-containing protein  47.16 
 
 
289 aa  257  1e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0995  Rhodanese domain protein  47.42 
 
 
296 aa  250  1e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.079295  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1052  transcriptional regulator, MarR family  40.79 
 
 
366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.911033  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1989  Rhodanese domain protein  41.48 
 
 
273 aa  211  1e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0356  rhodanese domain-containing protein  41.24 
 
 
267 aa  193  2e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4850  Rhodanese domain protein  36 
 
 
277 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0194219  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7584  rhodanese domain-containing protein  38.13 
 
 
283 aa  175  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450962  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4065  Rhodanese domain protein  32.62 
 
 
282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.235987  normal  0.0718409 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2989  rhodanese domain-containing protein  32.03 
 
 
281 aa  139  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.700254 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3061  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.22 
 
 
279 aa  138  7.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122579  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02674  thiosulfate sulfurtransferase  38.16 
 
 
327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3457  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.56 
 
 
285 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167949  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3775  rhodanese domain-containing protein  32.36 
 
 
288 aa  132  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  33.6 
 
 
291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1161  Rhodanese domain protein  30.94 
 
 
314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.459743  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0191  thiosulfate sulfurtransferase  30.6 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  30.18 
 
 
477 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2858  Rhodanese domain protein  29.37 
 
 
305 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4133  Rhodanese domain protein  30.56 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2490  rhodanese-related sulfurtransferase  31.25 
 
 
292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36636  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0430  Rhodanese domain protein  30.88 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3630  rhodanese-like protein  31.96 
 
 
282 aa  127  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.69295  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2916  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.82 
 
 
286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1365  rhodanese domain-containing protein  30.07 
 
 
287 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.247662  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1697  rhodanese domain-containing protein  31.87 
 
 
258 aa  126  5e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.347959 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1915  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.25 
 
 
285 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.021654  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0405  rhodanese-like protein  32.52 
 
 
284 aa  125  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.484971  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6380  Rhodanese domain protein  31.21 
 
 
280 aa  125  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2634  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.68 
 
 
283 aa  124  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6256  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.34 
 
 
285 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  29.86 
 
 
288 aa  123  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.183819 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>