More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3903 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3903  flavodoxin/nitric oxide synthase  100 
 
 
153 aa  310  2.9999999999999996e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2284  flavodoxin/nitric oxide synthase  51.7 
 
 
147 aa  148  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0838733  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0673  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.16 
 
 
152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.704486  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1899  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.66 
 
 
144 aa  80.1  0.000000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1906  FAD-binding domain protein  40.58 
 
 
628 aa  78.6  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0001  flavodoxin  36.96 
 
 
146 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.337726  hitchhiker  0.000580002 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2878  flavodoxin FldA  34.45 
 
 
169 aa  73.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1186  flavodoxin  37.84 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.35635  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3168  flavodoxin  28.76 
 
 
154 aa  72  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745936  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3857  flavodoxin  35.65 
 
 
146 aa  72  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000243053 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0459  flavodoxin  32.76 
 
 
161 aa  71.2  0.000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.728762  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2890  flavodoxin  29.05 
 
 
154 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3335  flavodoxin  40 
 
 
147 aa  70.9  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000659666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3300  flavodoxin  40 
 
 
147 aa  70.9  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.31078e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3596  flavodoxin  40 
 
 
147 aa  70.9  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000203482  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3550  flavodoxin  40 
 
 
147 aa  70.9  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.52439e-45 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4910  flavodoxin  36.84 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3244  flavodoxin  40.83 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000023193  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3231  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  29.86 
 
 
1006 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1668  flavodoxin  40 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000400583  hitchhiker  1.50261e-20 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0001  flavodoxin  33.09 
 
 
146 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3250  flavodoxin  40 
 
 
154 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000245665  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3250  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  29.86 
 
 
1065 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.95935  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0858  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  33.79 
 
 
605 aa  69.3  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1305  sulphite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.97 
 
 
610 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3559  flavodoxin  39.17 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2982  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.12 
 
 
163 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00353782  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3937  flavodoxin  32.62 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000104179 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4029  flavodoxin  35.9 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.355082 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3968  flavodoxin  38.32 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3288  flavodoxin  31.76 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000161903 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3649  flavodoxin  39.17 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000118678  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3555  flavodoxin  39.17 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000142004  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4252  flavodoxin  37.39 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2981  NADPH-cytochrome P450 reductase  29.86 
 
 
1065 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.313998  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2642  flavodoxin  30.87 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.66337  normal  0.959919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1692  flavodoxin  36.3 
 
 
150 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1706  flavodoxin  30.87 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2016  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  30.28 
 
 
1065 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0164  flavodoxin FldA  31.16 
 
 
170 aa  67.8  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.243866  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2801  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.36 
 
 
582 aa  67.4  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.310808  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3229  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  29.86 
 
 
1065 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3239  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  29.17 
 
 
1065 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19660  flavodoxin  35.62 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.16255  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03036  flavodoxin  30.67 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.230795  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4057  flavodoxin  33.09 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.343212  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0897  flavodoxin  35.14 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4498  flavodoxin  34.78 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000121939 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3588  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.41 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6268  Nitric oxide synthase NOS  33.33 
 
 
1524 aa  65.1  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3764  flavodoxin  33.09 
 
 
147 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.188706  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0324  flavodoxin  30.12 
 
 
168 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1132  flavodoxin  31.65 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3807  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.13 
 
 
591 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0251884 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2936  cytochrome P450  29.17 
 
 
1065 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.807105  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0827  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.94 
 
 
607 aa  64.7  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0590  sulphite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.23 
 
 
613 aa  65.1  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.257613  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2698  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.46 
 
 
626 aa  64.7  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2643  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.46 
 
 
629 aa  64.7  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2993  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  29.17 
 
 
1065 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3221  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  29.17 
 
 
1065 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0431  flavodoxin domain-containing protein  34.45 
 
 
883 aa  63.9  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2795  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  31.61 
 
 
614 aa  63.9  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0773977  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2649  flavodoxin  28.38 
 
 
154 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2716  flavodoxin  28.38 
 
 
154 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3434  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  34.75 
 
 
600 aa  63.9  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417124 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0953  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  36.21 
 
 
599 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3416  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  36.21 
 
 
599 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1622  flavodoxin  28.48 
 
 
154 aa  63.5  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2921  NADPH-cytochrome P450 reductase  28.47 
 
 
1065 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01320  electron transporter, putative  33.33 
 
 
741 aa  63.2  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0944  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  36.21 
 
 
599 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0347  FAD-binding domain-containing protein  39.34 
 
 
538 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0919  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  36.21 
 
 
599 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1666  flavodoxin FldA  36.88 
 
 
171 aa  63.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122613  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3283  flavodoxin  36.49 
 
 
149 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0003  flavodoxin  34.19 
 
 
146 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.664218  hitchhiker  0.0000119397 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2823  flavodoxin  28.38 
 
 
154 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0653  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.22 
 
 
598 aa  63.2  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.988648  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10283  oxidoreductase, hypothetical protein (Eurofung)  30.88 
 
 
654 aa  62.8  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.384937  normal  0.391793 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1438  flavodoxin  28.19 
 
 
154 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2733  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  37.82 
 
 
584 aa  62.4  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.461724  hitchhiker  0.00000324313 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4907  flavodoxin  28.57 
 
 
146 aa  62.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000204961  hitchhiker  0.000475727 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1806  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.28 
 
 
153 aa  62.4  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2225  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.54 
 
 
509 aa  62.4  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.653659  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3767  sulfite reductase alpha subunit (flavoprotein)-like protein  32.54 
 
 
969 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2191  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  30.07 
 
 
614 aa  62  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0001  flavodoxin  28.47 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5483  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.7 
 
 
589 aa  62  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0248188  normal  0.020248 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0776  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.12 
 
 
594 aa  62  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3064  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  36.21 
 
 
599 aa  61.6  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2839  sulfite reductase subunit alpha  35.54 
 
 
602 aa  62  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1365  flavodoxin, long chain  33.58 
 
 
171 aa  61.6  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.180035  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002018  flavoprotein MioC  26.43 
 
 
144 aa  61.6  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00370796  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2909  flavodoxin  27.52 
 
 
154 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.129799  normal  0.479147 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2427  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  36.13 
 
 
608 aa  61.2  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3738  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  33.62 
 
 
607 aa  61.2  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04097  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.09 
 
 
145 aa  61.2  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1443  flavodoxin  27.52 
 
 
154 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0682  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.14 
 
 
613 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>