More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3845 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3845  cytochrome P450  100 
 
 
414 aa  850    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4963  cytochrome P450  59.31 
 
 
402 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.500706 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4580  cytochrome P450  59.31 
 
 
402 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4668  cytochrome P450  59.31 
 
 
402 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1598  cytochrome P450  57.32 
 
 
402 aa  462  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5159  cytochrome P450  57.43 
 
 
402 aa  464  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.709517 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10781  cytochrome P450 123 cyp123  55.28 
 
 
402 aa  436  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.983786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6442  cytochrome P450 CYP109C2  45.98 
 
 
387 aa  324  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175786  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3437  cytochrome P450  42.86 
 
 
418 aa  303  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.701371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1766  cytochrome P450  40.99 
 
 
405 aa  282  8.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333614  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1785  cytochrome P450  40.99 
 
 
405 aa  282  8.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1832  cytochrome P450  40.99 
 
 
405 aa  282  8.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3698  cytochrome P450  40.35 
 
 
405 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3771  cytochrome P450  40.35 
 
 
405 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3711  cytochrome P450  40.1 
 
 
405 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4343  cytochrome P450  40.69 
 
 
412 aa  276  6e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2477  cytochrome P450  39.39 
 
 
401 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4324  cytochrome P450  40.3 
 
 
395 aa  273  3e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6537  cytochrome P450  40.76 
 
 
427 aa  272  8.000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0627  cytochrome P450  39.75 
 
 
395 aa  268  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2001  cytochrome P450  40.55 
 
 
405 aa  265  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.717574  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3696  cytochrome P450  39.4 
 
 
400 aa  264  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3769  cytochrome P450  39.4 
 
 
400 aa  264  3e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.526814  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3709  cytochrome P450  38.85 
 
 
400 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.681823  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0584  cytochrome P450  37.66 
 
 
395 aa  259  9e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2479  cytochrome P450  37.97 
 
 
400 aa  258  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4175  cytochrome P450  38.69 
 
 
400 aa  255  9e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498623  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  38.6 
 
 
392 aa  245  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4218  cytochrome P450  37.97 
 
 
395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  38 
 
 
398 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  39 
 
 
398 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  35.07 
 
 
395 aa  236  8e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7099  cytochrome P450  36.79 
 
 
396 aa  236  8e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3721  cytochrome P450  35.29 
 
 
400 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.153528  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3733  cytochrome P450  35.29 
 
 
400 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.123768  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3794  cytochrome P450  35.29 
 
 
400 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.209215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  34.09 
 
 
404 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  34.09 
 
 
404 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  34.09 
 
 
404 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2913  cytochrome P450  34.8 
 
 
396 aa  224  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1257  cytochrome P450  35.29 
 
 
395 aa  224  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160229 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5310  cytochrome P450  35.06 
 
 
394 aa  223  7e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4929  cytochrome P450  34.32 
 
 
411 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5017  cytochrome P450  34.32 
 
 
394 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147849  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5154  cytochrome P450  35.73 
 
 
418 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5535  cytochrome P450  35.73 
 
 
406 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0101021  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5243  cytochrome P450  35.73 
 
 
406 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3187  cytochrome P450  34.41 
 
 
396 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25675  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  35.62 
 
 
388 aa  216  5e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  36.19 
 
 
412 aa  216  5e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  34.61 
 
 
380 aa  216  5.9999999999999996e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2431  cytochrome P450  32.91 
 
 
413 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4029  cytochrome P450  34.08 
 
 
398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4221  cytochrome P450  33.42 
 
 
403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.939357 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  36.54 
 
 
426 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3863  cytochrome P450  33.49 
 
 
408 aa  213  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  37.1 
 
 
399 aa  213  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4145  cytochrome P450  32.82 
 
 
398 aa  212  9e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1266  cytochrome P450  34.07 
 
 
393 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0318577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2591  cytochrome P450  32.83 
 
 
401 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  34.87 
 
 
414 aa  209  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2552  cytochrome P450  32.83 
 
 
401 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6395  cytochrome P450  34.49 
 
 
399 aa  208  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2597  cytochrome P450  32.83 
 
 
401 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.138605  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4732  cytochrome P450  32.67 
 
 
398 aa  207  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  32.86 
 
 
404 aa  205  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  35.31 
 
 
406 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  32.93 
 
 
407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  36.19 
 
 
423 aa  201  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2569  cytochrome P450  32.89 
 
 
397 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2532  cytochrome P450  32.89 
 
 
397 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.225488  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2577  cytochrome P450  32.89 
 
 
397 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591553  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  34.95 
 
 
429 aa  197  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  34.18 
 
 
402 aa  196  5.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  31.99 
 
 
408 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  34.26 
 
 
417 aa  196  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  34.72 
 
 
410 aa  195  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3778  cytochrome P450  33.41 
 
 
403 aa  194  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0737  cytochrome P450  31.46 
 
 
411 aa  194  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000124677  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  33.67 
 
 
405 aa  194  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  33.75 
 
 
417 aa  193  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  33.41 
 
 
411 aa  193  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  32.84 
 
 
398 aa  193  5e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  33.25 
 
 
412 aa  193  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11282  cytochrome P450 130 cyp130  32.58 
 
 
405 aa  193  6e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.112897  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1008  cytochrome P450 superfamily  31.92 
 
 
408 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.773004  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  34.09 
 
 
399 aa  192  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  34.02 
 
 
399 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0425  cytochrome P450  34.37 
 
 
406 aa  191  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0314572  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3250  P450 heme-thiolate protein, putative  31.22 
 
 
411 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191944  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3663  cytochrome P450  31.22 
 
 
411 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  34.58 
 
 
414 aa  190  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  33.01 
 
 
436 aa  189  5.999999999999999e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  32.95 
 
 
417 aa  189  5.999999999999999e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5481  cytochrome P450  33.68 
 
 
409 aa  189  7e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170378  normal  0.213356 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  32.41 
 
 
402 aa  189  8e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  33.92 
 
 
407 aa  188  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4465  cytochrome P450  31.74 
 
 
413 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1032  cytochrome P450  31.44 
 
 
414 aa  187  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0161128  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2229  cytochrome P450  31.34 
 
 
412 aa  187  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>