More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3782 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3782  ferredoxin  100 
 
 
352 aa  725  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00690243  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0319  ferredoxin  58.91 
 
 
346 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220078  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0329  ferredoxin  58.91 
 
 
346 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.106229 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2893  ferredoxin  55.23 
 
 
347 aa  392  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200106  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4115  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  56.27 
 
 
345 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0310  oxidoreductase FAD-binding subunit  56.43 
 
 
339 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13604  hemoglobine-related protein hmp  53.69 
 
 
358 aa  377  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.714491  normal  0.806459 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4710  ferredoxin  53.89 
 
 
350 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.748194  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4796  ferredoxin  53.89 
 
 
350 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1462  ferredoxin  51.29 
 
 
358 aa  368  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.611989  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5095  ferredoxin  53.89 
 
 
350 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.276207 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5309  ferredoxin  51.58 
 
 
356 aa  366  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.185586 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3447  ferredoxin  51.58 
 
 
340 aa  352  7e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3520  ferredoxin  50.15 
 
 
351 aa  343  2e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0320  ferredoxin  49.26 
 
 
348 aa  317  2e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18640  flavodoxin reductase family protein  48.25 
 
 
355 aa  310  2e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3851  ferredoxin  48.18 
 
 
360 aa  306  4e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2520  ferredoxin  44.75 
 
 
366 aa  303  2e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2674  ferredoxin  46.61 
 
 
330 aa  302  6e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333884  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3517  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  46.69 
 
 
346 aa  293  4e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.611569  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1416  ferredoxin  44.44 
 
 
353 aa  292  6e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.15311  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2882  oxidoreductase FAD-binding subunit  43.95 
 
 
341 aa  285  1e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.07552  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1546  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  42.65 
 
 
354 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729888  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2130  ferredoxin  39.11 
 
 
361 aa  264  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.896649  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3712  ferredoxin  39.23 
 
 
339 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.709133  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3785  ferredoxin  39.23 
 
 
339 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.870039  normal  0.280135 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3725  ferredoxin  39.23 
 
 
339 aa  236  6e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4186  ferredoxin  38.89 
 
 
346 aa  233  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2468  ferredoxin  37.61 
 
 
344 aa  226  5e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0543  ferredoxin  38.14 
 
 
339 aa  214  1e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00032188 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2973  oxidoreductase FAD-binding subunit  37.17 
 
 
341 aa  209  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0900  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.88 
 
 
389 aa  205  9e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4563  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.67 
 
 
364 aa  201  1e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.659135 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3491  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.67 
 
 
364 aa  201  1e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.168778 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0757  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.03 
 
 
358 aa  199  4e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123298  normal  0.178298 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3739  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.85 
 
 
358 aa  196  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184178  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0608  ferredoxin reductase protein  36.49 
 
 
363 aa  195  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3373  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase PaaK subunit  35.2 
 
 
361 aa  192  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3091  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.7 
 
 
357 aa  188  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.255521  hitchhiker  0.000372207 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1903  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.33 
 
 
368 aa  184  2e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2143  ferredoxin  31.56 
 
 
344 aa  182  6e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000191342  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3210  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.73 
 
 
362 aa  182  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4306  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.92 
 
 
329 aa  182  8e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.264864  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2622  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.46 
 
 
358 aa  182  9e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.367598 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1502  ferredoxin  33.52 
 
 
365 aa  182  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2635  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.75 
 
 
358 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.8381  normal  0.0570519 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2485  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.75 
 
 
358 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.960936  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3274  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.75 
 
 
358 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.60541  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2487  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.11 
 
 
369 aa  181  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141396  normal  0.0209402 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2612  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.17 
 
 
362 aa  180  3e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0254  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.72 
 
 
362 aa  180  3e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0292434  normal  0.0307686 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0245  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.72 
 
 
362 aa  180  3e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0306  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.72 
 
 
362 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.144813  hitchhiker  0.000507312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4069  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.53 
 
 
369 aa  179  4e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.194384 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0654  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  31.07 
 
 
351 aa  179  5e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4806  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.37 
 
 
358 aa  179  5e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.234643 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05340  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaK subunit  32.58 
 
 
357 aa  179  8e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.000116603  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0381  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  33.05 
 
 
365 aa  179  8e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.155408  hitchhiker  0.00902786 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0326  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.72 
 
 
362 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0291  phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase PaaE  33.98 
 
 
362 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2780  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.72 
 
 
362 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0478602  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2861  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.72 
 
 
362 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00257919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3723  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.33 
 
 
358 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3372  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.96 
 
 
369 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3425  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.7 
 
 
362 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0901107  normal  0.882381 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3666  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.54 
 
 
362 aa  174  2e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100364  hitchhiker  3.84073e-07 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3779  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.98 
 
 
362 aa  174  2e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0589683  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2202  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.26 
 
 
363 aa  174  2e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0120685  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0011  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.26 
 
 
362 aa  174  3e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  33.24 
 
 
380 aa  173  3e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3840  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.26 
 
 
362 aa  174  3e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1564  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  31.96 
 
 
348 aa  173  3e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.517649 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1048  ferredoxin  31.28 
 
 
350 aa  173  4e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  33.71 
 
 
380 aa  173  4e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03005  Phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.05 
 
 
349 aa  173  4e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  33.24 
 
 
381 aa  173  4e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2477  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  32.39 
 
 
367 aa  173  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0991  putative ring-hydroxylation complex protein 4  34.27 
 
 
361 aa  172  6e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153237  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3533  phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase PaaE  33.98 
 
 
362 aa  172  7e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2577  phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase PaaE  33.98 
 
 
362 aa  172  7e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.616553  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0008  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.98 
 
 
362 aa  172  7e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0203524  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3115  phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase PaaE  33.98 
 
 
362 aa  172  7e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0136188  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1980  phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase PaaE  33.98 
 
 
362 aa  172  7e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.144649  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0228  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.7 
 
 
362 aa  172  8e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0180747  hitchhiker  0.0014836 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3101  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.43 
 
 
362 aa  172  9e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0125326  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26490  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  32.76 
 
 
360 aa  172  9e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.365765  normal  0.166146 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4468  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  32.87 
 
 
369 aa  172  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.488012  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1860  iron-sulfur cluster-binding protein  33.52 
 
 
379 aa  172  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0479  putative ferredoxin, 2Fe-2S  32.95 
 
 
381 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0998  putative ferredoxin, 2Fe-2S  32.95 
 
 
380 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0388253  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1242  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase PaaK subunit  32.3 
 
 
366 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0702  putative ferredoxin, 2Fe-2S  32.95 
 
 
380 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.54952  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3569  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  32.58 
 
 
362 aa  171  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0579  ferredoxin/oxidoreductase  33.52 
 
 
382 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1971  putative ferredoxin, 2Fe-2S  32.95 
 
 
380 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.851205  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4285  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  31.64 
 
 
362 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481656  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5014  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.86 
 
 
382 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240099  normal  0.858048 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4880  ferredoxin  32.4 
 
 
350 aa  169  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.30814 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4489  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.86 
 
 
382 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.320814  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7195  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.43 
 
 
358 aa  169  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.601931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>