More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3734 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001306  ANIA_02621  N-(5-amino-5-carboxypentanoyl)-L-cysteinyl-D- valine synthase (EC 6.3.2.26)(Delta-(L-alpha-aminoadipyl)-L-cysteinyl-D- valine synthetase)(ACV synthetase)(ACVS) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P27742]  27.05 
 
 
3770 aa  648    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.830211 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  34.24 
 
 
2370 aa  901    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2025  putative syringomycin synthetase  31 
 
 
6272 aa  892    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  31.73 
 
 
3470 aa  956    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2574  amino acid adenylation domain-containing protein  26.76 
 
 
6404 aa  811    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4221  non-ribosomal peptide synthetase  30.82 
 
 
2174 aa  754    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.206011 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  33.6 
 
 
4317 aa  892    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2338  peptide synthetase  29.08 
 
 
2387 aa  656    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  35.29 
 
 
5953 aa  1134    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  35.09 
 
 
6889 aa  1263    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  34.22 
 
 
2385 aa  1143    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  31.63 
 
 
4336 aa  982    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  33.37 
 
 
2151 aa  884    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10102  peptide synthetase nrp  33.61 
 
 
2512 aa  687    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0362  amino acid adenylation domain-containing protein  32.24 
 
 
2350 aa  751    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.197157 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  31.37 
 
 
5929 aa  830    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2088  amino acid adenylation domain-containing protein  26.71 
 
 
2894 aa  838    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  31.05 
 
 
3432 aa  1063    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  31.99 
 
 
4531 aa  974    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  34.55 
 
 
2385 aa  1150    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  31.33 
 
 
6176 aa  804    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  34.36 
 
 
2385 aa  1154    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  34.32 
 
 
2385 aa  1155    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  35.87 
 
 
3328 aa  880    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0164  thioester reductase domain-containing protein  28.43 
 
 
2391 aa  640    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  28.76 
 
 
4186 aa  654    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  31.71 
 
 
3021 aa  782    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  31.51 
 
 
4336 aa  973    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  32.92 
 
 
2154 aa  874    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1089  putative non-ribosomal peptide synthase  30.76 
 
 
5467 aa  660    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.993162 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  33.64 
 
 
2386 aa  1128    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  31.78 
 
 
5926 aa  835    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  32.69 
 
 
9498 aa  1090    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  32.27 
 
 
5372 aa  872    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2615  amino acid adenylation  28.39 
 
 
5469 aa  642    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.301045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  32.65 
 
 
13537 aa  1088    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  33.93 
 
 
6676 aa  1099    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  34.83 
 
 
3629 aa  869    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0363  amino acid adenylation domain-containing protein  33.23 
 
 
2125 aa  876    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.831612 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  30.02 
 
 
2791 aa  655    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  32.6 
 
 
3308 aa  1313    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  28.85 
 
 
3498 aa  942    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  31.72 
 
 
2033 aa  646    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  33.88 
 
 
5328 aa  1090    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4754  amino acid adenylation domain-containing protein  29.98 
 
 
3331 aa  781    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2161  hypothetical protein  31.03 
 
 
6274 aa  891    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2961  amino acid adenylation domain-containing protein  31.38 
 
 
2201 aa  791    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956293  hitchhiker  0.00505571 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  33.21 
 
 
6072 aa  1066    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  32.91 
 
 
4572 aa  893    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  31.67 
 
 
3291 aa  1013    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  35.95 
 
 
8914 aa  1070    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  31.4 
 
 
4502 aa  1032    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2211  amino acid adenylation  29.48 
 
 
2136 aa  653    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  29.18 
 
 
5422 aa  688    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  34.59 
 
 
4882 aa  1087    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  32.06 
 
 
3002 aa  789    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  31.97 
 
 
4332 aa  954    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  33.5 
 
 
4317 aa  900    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  28.23 
 
 
2138 aa  789    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  34.55 
 
 
2385 aa  1150    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  31.94 
 
 
4037 aa  783    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0169  thioester reductase domain-containing protein  28.43 
 
 
2391 aa  640    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  32 
 
 
8915 aa  652    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.47545 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2413  amino acid adenylation domain-containing protein  30.53 
 
 
1569 aa  690    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2450  amino acid adenylation  34.44 
 
 
4290 aa  1164    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  36.84 
 
 
4489 aa  1254    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2460  amino acid adenylation  34.72 
 
 
2605 aa  865    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.441641  normal  0.494441 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2054  amino acid adenylation  29.63 
 
 
3102 aa  848    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5940  amino acid adenylation domain-containing protein  32.99 
 
 
6999 aa  826    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  31.21 
 
 
4991 aa  882    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  34.75 
 
 
6661 aa  1067    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2093  amino acid adenylation domain-containing protein  25.75 
 
 
2410 aa  744    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2570  amino acid adenylation domain-containing protein  27.56 
 
 
3114 aa  729    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0117255 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4562  amino acid adenylation domain-containing protein  37.28 
 
 
7785 aa  1274    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  32.91 
 
 
6081 aa  1055    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  32.63 
 
 
3176 aa  738    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  32.73 
 
 
4478 aa  643    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21020  putative non-ribosomal peptide synthetase  30.89 
 
 
2352 aa  689    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  31.94 
 
 
4342 aa  1003    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  32.19 
 
 
5149 aa  905    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  31.65 
 
 
2189 aa  812    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  32.38 
 
 
2448 aa  821    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3098  amino acid adenylation domain-containing protein  33.9 
 
 
3524 aa  1109    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2095  amino acid adenylation domain-containing protein  26.83 
 
 
3395 aa  683    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.800691  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  30.85 
 
 
5230 aa  835    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  31.67 
 
 
4968 aa  1226    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1574  amino acid adenylation domain-containing protein  33.49 
 
 
1714 aa  816    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  32.03 
 
 
4342 aa  996    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1881  amino acid adenylation domain-containing protein  32.51 
 
 
1689 aa  674    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4658  amino acid adenylation domain-containing protein  39.04 
 
 
1449 aa  654    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.702591  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  32.52 
 
 
3291 aa  1106    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  29.29 
 
 
2820 aa  645    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4420  amino acid adenylation domain-containing protein  34.52 
 
 
1726 aa  713    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.466879 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3063  amino acid adenylation domain-containing protein  34.53 
 
 
5620 aa  1066    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.384616 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  32.55 
 
 
8646 aa  892    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  35.87 
 
 
3352 aa  880    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  31.28 
 
 
3348 aa  1015    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  33.56 
 
 
5596 aa  1145    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2005  putative syringomycin synthetase  31.03 
 
 
6271 aa  892    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2213  non-ribosomal peptide synthase  32.96 
 
 
4468 aa  892    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>