More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3726 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3726  Pirin domain protein  100 
 
 		 336 aa  678    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0788  pirin domain-containing protein  61.26 
 
 		 321 aa  390  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4144  Pirin domain protein  60.78 
 
 		 329 aa  378  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.173069  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3633  Pirin domain protein  58.53 
 
 		 330 aa  380  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5391  pirin domain-containing protein  62.78 
 
 		 317 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5681  pirin domain-containing protein  62.78 
 
 		 317 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5302  Pirin-like protein  62.78 
 
 		 317 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.178895  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0062  pirin domain-containing protein  59.46 
 
 		 321 aa  378  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0100  Pirin domain protein  56.93 
 
 		 335 aa  370  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0663  pirin domain-containing protein  62.84 
 
 		 351 aa  356  2.9999999999999997e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3190  Pirin domain protein  53.69 
 
 		 351 aa  347  1e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2745  Pirin domain-containing protein  58.13 
 
 		 319 aa  345  7e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.211686  normal  0.964257 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35540  Pirin-related protein  50.26 
 
 		 381 aa  323  2e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0508  Pirin domain protein  51.75 
 
 		 329 aa  317  1e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  decreased coverage  0.000000344824 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02280  Pirin-related protein  47.54 
 
 		 335 aa  278  1e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2016  Pirin domain protein  46.74 
 
 		 343 aa  276  5e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.656131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2245  hypothetical protein  49.24 
 
 		 332 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169099  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1645  Pirin domain protein  46.67 
 
 		 324 aa  271  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.156047 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23410  Pirin-related protein  44.91 
 
 		 348 aa  263  3e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0699691  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0490  Pirin domain protein  46.53 
 
 		 322 aa  261  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0687764  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2844  pirin domain-containing protein  40.86 
 
 		 363 aa  245  6.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.923717  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2558  Pirin domain protein  42.15 
 
 		 336 aa  241  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000413123 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4173  hypothetical protein  43.14 
 
 		 332 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0050  Pirin-like protein  42.07 
 
 		 301 aa  229  5e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48730  hypothetical protein  43.14 
 
 		 315 aa  229  7e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159869 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3476  Pirin domain protein  44.11 
 
 		 319 aa  228  9e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.944311 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2835  pirin domain-containing protein  40.31 
 
 		 313 aa  226  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1778  Pirin-like protein  42.22 
 
 		 313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3147  Pirin domain protein  41.49 
 
 		 301 aa  211  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.933167  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3541  pirin-like protein  40.26 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0053  pirin domain-containing protein  39.71 
 
 		 307 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030122 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0061  pirin domain-containing protein  39.01 
 
 		 308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000222873 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0055  pirin domain-containing protein  38.65 
 
 		 307 aa  196  6e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241022 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0050  pirin domain-containing protein  36.3 
 
 		 307 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0017274  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0058  pirin domain-containing protein  37.94 
 
 		 307 aa  195  9e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000580792 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0919  pirin domain-containing protein  38.29 
 
 		 338 aa  194  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.200809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0057  Pirin domain protein  38.01 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4301  pirin domain-containing protein  38.01 
 
 		 307 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.411445  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0053  pirin domain-containing protein  33.96 
 
 		 307 aa  189  8e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0649  Pirin-like protein  37.34 
 
 		 294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0954189 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1965  pirin domain-containing protein  36.84 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0444426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1805  Pirin domain protein  36.03 
 
 		 296 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.5163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2897  Pirin-like  34.67 
 
 		 294 aa  166  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2928  pirin domain-containing protein  35.45 
 
 		 304 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2143  pirin domain-containing protein  35.2 
 
 		 305 aa  165  8e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0640  pirin-related protein  34.33 
 
 		 291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.524638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2913  Pirin-like  34.12 
 
 		 296 aa  162  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2359  Pirin domain protein  38.08 
 
 		 306 aa  162  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.355023 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1817  pirin-like protein  34.81 
 
 		 312 aa  161  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.123159  normal  0.257408 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2278  pirin domain-containing protein  37.27 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263885  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1300  pirin domain-containing protein  36.58 
 
 		 294 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.937895  normal  0.0576323 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1596  Pirin domain protein  36.9 
 
 		 301 aa  160  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1266  pirin domain-containing protein  37.58 
 
 		 294 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2089  Pirin domain protein  36.24 
 
 		 304 aa  160  4e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0185  pirin domain-containing protein  35.17 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0128  Pirin domain protein  35.17 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.266704 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1954  Pirin-like  37.29 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0828005  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2565  pirin domain-containing protein  37.29 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0286  pirin-related protein  36.52 
 
 		 306 aa  157  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04763  pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  34.09 
 
 		 296 aa  156  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1889  Pirin-like  34.11 
 
 		 313 aa  155  8e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0019  putative Pirin family protein  34.68 
 
 		 305 aa  155  9e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1918  pirin domain-containing protein  35.91 
 
 		 297 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.883605 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3573  Pirin domain protein  35.1 
 
 		 307 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3641  Pirin domain protein  35.1 
 
 		 307 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4855  pirin domain-containing protein  36.18 
 
 		 312 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3490  pirin domain-containing protein  32.52 
 
 		 293 aa  153  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.970505  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0219  pirin  35.27 
 
 		 306 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4532  Pirin-like protein  37.15 
 
 		 294 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3489  Pirin-like  34.7 
 
 		 307 aa  152  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0435  pirin-related protein  35.69 
 
 		 290 aa  151  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2092  Pirin domain protein  32.48 
 
 		 311 aa  151  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0364  pirin domain-containing protein  35.25 
 
 		 318 aa  151  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0346  Pirin-like  34.71 
 
 		 305 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0493  pirin domain-containing protein  33.55 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4570  pirin domain-containing protein  35.56 
 
 		 296 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203406  normal  0.316672 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0566  Pirin domain protein  32.61 
 
 		 307 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.660641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0009  Pirin-like  35.84 
 
 		 306 aa  151  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00543202  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0731  pirin domain-containing protein  36.36 
 
 		 293 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4923  Pirin domain protein  33.22 
 
 		 310 aa  150  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.695284  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2513  Pirin-like  34.24 
 
 		 311 aa  150  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.277892 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5897  Pirin-like protein  36.01 
 
 		 293 aa  149  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.867942  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2116  pirin domain-containing protein  36.13 
 
 		 297 aa  150  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0157857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0326  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  36.15 
 
 		 291 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2589  pirin domain-containing protein  35.93 
 
 		 293 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.437288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0561  Pirin domain protein  35.66 
 
 		 305 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3510  pirin domain-containing protein  36.3 
 
 		 314 aa  149  9e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0703  Pirin-like protein  33.75 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0546  pirin domain-containing protein  34.63 
 
 		 306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.266378  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2613  pirin domain-containing protein  35.77 
 
 		 293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1367  pirin domain-containing protein  34.9 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0431465 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0744  hypothetical protein  34.27 
 
 		 291 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.738482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0588  putative pirin-like protein  35.31 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.927348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3218  Pirin domain protein  34.49 
 
 		 291 aa  146  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3120  Pirin domain protein  32.8 
 
 		 307 aa  146  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.680161  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2372  pirin domain-containing protein  34.97 
 
 		 311 aa  146  6e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178763  normal  0.995053 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0734  Pirin-like  35.09 
 
 		 306 aa  146  6e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0907  Pirin-like  34.9 
 
 		 293 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1389  pirin domain-containing protein  34.9 
 
 		 293 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.614726  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0149  Pirin-like  33.79 
 
 		 305 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>