24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3696 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3696  Protein of unknown function DUF2068, transmembrane  100 
 
 		 253 aa  508  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0100204  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3414  membrane protein-like protein  60.98 
 
 		 263 aa  305  4.0000000000000004e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00178043  hitchhiker  0.000103691 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2709  Protein of unknown function DUF2068, transmembrane  55.65 
 
 		 249 aa  285  4e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3735  hypothetical protein  49.21 
 
 		 272 aa  239  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.939012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1263  hypothetical protein  45.14 
 
 		 295 aa  217  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1347  hypothetical protein  45.53 
 
 		 268 aa  201  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.5454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10091  hypothetical protein  45.34 
 
 		 256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.403914  normal  0.141403 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0019  membrane protein-like protein  39.02 
 
 		 170 aa  65.1  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0178254  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0149  hypothetical protein  36.14 
 
 		 159 aa  61.6  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0072  membrane protein-like protein  32.86 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0117  hypothetical protein  30.14 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1839  hypothetical protein  35 
 
 		 152 aa  57.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4734  hypothetical protein  31.07 
 
 		 166 aa  52.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1179  hypothetical protein  34.67 
 
 		 152 aa  51.6  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.630438  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2680  hypothetical protein  24.36 
 
 		 153 aa  50.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2700  hypothetical protein  27.78 
 
 		 162 aa  50.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3486  membrane protein  35.29 
 
 		 176 aa  50.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1587  hypothetical protein  34.78 
 
 		 155 aa  50.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3034  hypothetical protein  31.87 
 
 		 153 aa  49.3  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2637  membrane protein-like  40.82 
 
 		 159 aa  45.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000516806  normal  0.56497 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4330  hypothetical protein  27.15 
 
 		 153 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131814  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1221  membrane protein  23.81 
 
 		 170 aa  43.5  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.780478  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2492  hypothetical protein  32.73 
 
 		 159 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0533  hypothetical protein  43.9 
 
 		 187 aa  42.4  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0288544 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>