More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3691 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  100 
 
 
178 aa  356  1e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  2.82439e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  79.33 
 
 
179 aa  296  9e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  79.33 
 
 
179 aa  295  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  5.14634e-05  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3402  ribosomal protein L6  78.21 
 
 
179 aa  291  2e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1030  50S ribosomal protein L6  79.33 
 
 
179 aa  291  4e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  3.75476e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1059  50S ribosomal protein L6  79.33 
 
 
179 aa  291  4e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  5.26273e-07  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1047  50S ribosomal protein L6  79.33 
 
 
179 aa  291  4e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000313329  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5032  50S ribosomal protein L6  78.21 
 
 
179 aa  289  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  3.33726e-06  normal  0.564685 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  78.21 
 
 
179 aa  283  1e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  74.3 
 
 
179 aa  277  7e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20720  LSU ribosomal protein L6P  70.95 
 
 
179 aa  267  5e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  70.79 
 
 
178 aa  265  3e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  67.42 
 
 
178 aa  264  4e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  69.1 
 
 
178 aa  263  1e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  69.83 
 
 
179 aa  261  4e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  69.66 
 
 
178 aa  260  8e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  67.42 
 
 
178 aa  258  2e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  69.66 
 
 
178 aa  259  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  69.27 
 
 
179 aa  258  3e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0602  ribosomal protein L6  67.6 
 
 
179 aa  256  2e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.273648  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0577  50S ribosomal protein L6  68.89 
 
 
180 aa  254  4e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  67.04 
 
 
179 aa  252  2e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0946  50S ribosomal protein L6  67.6 
 
 
180 aa  252  2e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.183711  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  65.36 
 
 
179 aa  251  3e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  66.48 
 
 
179 aa  251  5e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1101  50S ribosomal protein L6  67.78 
 
 
180 aa  249  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  64.8 
 
 
180 aa  248  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  64.25 
 
 
179 aa  249  2e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  65.17 
 
 
177 aa  248  3e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  3.13624e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  66.48 
 
 
179 aa  246  9e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  65.73 
 
 
178 aa  244  4e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  63.13 
 
 
180 aa  243  1e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  64.25 
 
 
179 aa  242  2e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  64.61 
 
 
178 aa  241  4e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23650  LSU ribosomal protein L6P  62.78 
 
 
180 aa  238  5e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.291924  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  58.99 
 
 
179 aa  223  1e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  59.55 
 
 
181 aa  219  2e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  1.13192e-06 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1355  ribosomal protein L6  61.71 
 
 
177 aa  218  4e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  55.06 
 
 
180 aa  216  1e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  1.69605e-05 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1816  50S ribosomal protein L6  57.87 
 
 
178 aa  216  2e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.997854  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  59.55 
 
 
178 aa  212  2e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  56.98 
 
 
179 aa  210  8e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  56.98 
 
 
179 aa  210  8e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2262  50S ribosomal protein L6  56.74 
 
 
178 aa  209  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00376277  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  58.43 
 
 
178 aa  209  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2303  50S ribosomal protein L6  56.74 
 
 
178 aa  209  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0125142  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4306  ribosomal protein L6  57.3 
 
 
185 aa  209  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2140  50S ribosomal protein L6P  55.93 
 
 
177 aa  207  5e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105025  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  55.68 
 
 
182 aa  206  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23171  50S ribosomal protein L6  57.87 
 
 
179 aa  205  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  57.87 
 
 
179 aa  205  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  7.76648e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0413  ribosomal protein L6  56.98 
 
 
179 aa  204  4e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  54.24 
 
 
179 aa  204  5e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  52.57 
 
 
177 aa  204  6e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  55.06 
 
 
178 aa  201  3e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  57.63 
 
 
177 aa  201  4e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  53.67 
 
 
179 aa  201  5e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  51.69 
 
 
180 aa  200  8e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  1.79167e-09  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16641  50S ribosomal protein L6  55.62 
 
 
179 aa  199  1e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0362  50S ribosomal protein L6  55 
 
 
181 aa  198  3e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.08503  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01320  ribosomal protein L6  56.42 
 
 
179 aa  198  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.299584  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1270  ribosomal protein L6  55.37 
 
 
177 aa  197  6e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0996  50S ribosomal protein L6  53.63 
 
 
180 aa  197  8e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.156125  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  54.49 
 
 
179 aa  196  2e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1969  50S ribosomal protein L6  55.06 
 
 
179 aa  196  2e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2803  50S ribosomal protein L6  54.29 
 
 
177 aa  194  5e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.536694  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  53.67 
 
 
181 aa  194  5e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1856  50S ribosomal protein L6  53.14 
 
 
177 aa  194  7e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.789542  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  54.71 
 
 
182 aa  193  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  6.72522e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3313  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 
179 aa  193  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.24387e-10 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 
179 aa  192  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  9.64591e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1146  ribosomal protein L6  57.87 
 
 
178 aa  192  2e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  1.04709e-06  hitchhiker  0.00466337 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 
179 aa  192  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.12924e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 
179 aa  192  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 
179 aa  192  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  2.01317e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 
179 aa  192  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.62457e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 
177 aa  192  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0730  ribosomal protein L6  56.21 
 
 
184 aa  192  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1852  50S ribosomal protein L6  52.07 
 
 
185 aa  192  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.668423 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 
179 aa  192  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  2.65093e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 
179 aa  192  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 
179 aa  192  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  3.15024e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3009  50S ribosomal protein L6  54.59 
 
 
187 aa  192  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149447  hitchhiker  0.00994922 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0565  50S ribosomal protein L6  52.57 
 
 
177 aa  191  3e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  52.81 
 
 
179 aa  191  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0948  50S ribosomal protein L6  52.81 
 
 
179 aa  191  5e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00150811  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0492  ribosomal protein L6  51.7 
 
 
178 aa  191  6e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187085  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2573  50S ribosomal protein L6  55.56 
 
 
182 aa  191  7e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 
179 aa  191  7e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  1.68089e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1369  50S ribosomal protein L6  51.43 
 
 
177 aa  190  8e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  52.05 
 
 
182 aa  189  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  7.64662e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0705  50S ribosomal protein L6  55.56 
 
 
182 aa  189  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  2.89089e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  53.14 
 
 
177 aa  190  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  51.43 
 
 
177 aa  190  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 
179 aa  189  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  5.19907e-09  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  53.63 
 
 
180 aa  189  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1001  50S ribosomal protein L6  51.43 
 
 
177 aa  189  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.372687  normal  0.0102466 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2751  ribosomal protein L6  52 
 
 
177 aa  188  3e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22493  normal  0.2065 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1115  50S ribosomal protein L6  52.81 
 
 
179 aa  188  3e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19891  50S ribosomal protein L6  52.81 
 
 
179 aa  188  3e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>