66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3680 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3680  putative F420-dependent oxidoreductase  100 
 
 		 281 aa  567  1e-161  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38250  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  55.56 
 
 		 280 aa  277  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1367  hypothetical protein  54.14 
 
 		 285 aa  269  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134083 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1094  hypothetical protein  56.08 
 
 		 283 aa  267  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1067  hypothetical protein  56.08 
 
 		 283 aa  267  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1083  hypothetical protein  56.08 
 
 		 283 aa  267  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.377526  normal  0.11045 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13500  hypothetical protein  54.98 
 
 		 285 aa  267  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000277953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1368  hypothetical protein  56.06 
 
 		 281 aa  264  8.999999999999999e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233326  normal  0.203451 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5006  hypothetical protein  53.14 
 
 		 287 aa  265  8.999999999999999e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1068  hypothetical protein  54.92 
 
 		 276 aa  264  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1084  hypothetical protein  54.92 
 
 		 276 aa  264  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0372016 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1095  hypothetical protein  54.92 
 
 		 276 aa  264  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5005  hypothetical protein  54.01 
 
 		 294 aa  263  3e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1512  hypothetical protein  53.54 
 
 		 279 aa  261  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00633715  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3207  putative F420-dependent oxidoreductase  52.77 
 
 		 272 aa  253  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2385  putative F420-dependent oxidoreductase  51.71 
 
 		 288 aa  242  5e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.742445 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0252  hypothetical protein  51.38 
 
 		 290 aa  238  5.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6698  hypothetical protein  53.01 
 
 		 291 aa  222  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.490421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0151  hypothetical protein  50.39 
 
 		 283 aa  218  7e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5643  hypothetical protein  48.22 
 
 		 297 aa  209  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4343  hypothetical protein  45.55 
 
 		 288 aa  208  9e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3932  hypothetical protein  48.8 
 
 		 286 aa  203  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0952  hypothetical protein  46.03 
 
 		 285 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1545  hypothetical protein  48.79 
 
 		 301 aa  195  6e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0000935429  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3854  hypothetical protein  46.56 
 
 		 286 aa  189  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.357835  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2688  hypothetical protein  46.25 
 
 		 286 aa  189  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.566827  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7266  hypothetical protein  43.45 
 
 		 334 aa  178  7e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6257  hypothetical protein  41.28 
 
 		 285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.949372  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0059  hypothetical protein  41.82 
 
 		 303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2620  hypothetical protein  40.64 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3644  hypothetical protein  41.96 
 
 		 307 aa  158  7e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1071  hypothetical protein  42.8 
 
 		 304 aa  158  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3965  hypothetical protein  38.52 
 
 		 324 aa  156  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4349  hypothetical protein  36.88 
 
 		 324 aa  154  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5428  hypothetical protein  39.17 
 
 		 275 aa  135  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4154  hypothetical protein  36.54 
 
 		 301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.238248  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5686  hypothetical protein  38.33 
 
 		 271 aa  124  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100066 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0508  hypothetical protein  35.43 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0486  hypothetical protein  35.43 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0497  hypothetical protein  35.43 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  28.33 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  30.45 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  25.56 
 
 		 322 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  28.84 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  27.92 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0410  luciferase family protein  27.24 
 
 		 306 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  25.69 
 
 		 335 aa  52  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2916  luciferase family protein  31.76 
 
 		 330 aa  51.2  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3725  luciferase family protein  28.47 
 
 		 316 aa  50.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.290268  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1630  methylenetetrahydromethanopterin reductase  35.59 
 
 		 333 aa  49.3  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.497354  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  26.3 
 
 		 359 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2761  luciferase-like  25.35 
 
 		 353 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2852  luciferase family protein  25.94 
 
 		 314 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.709446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0261  luciferase family protein  25.54 
 
 		 309 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110692 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2098  Luciferase-like monooxygenase  26.36 
 
 		 330 aa  46.6  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0305503  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  26.22 
 
 		 344 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4020  Luciferase-like monooxygenase  27.83 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169591  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.16 
 
 		 327 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  24.1 
 
 		 360 aa  43.9  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.18 
 
 		 334 aa  43.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  28.05 
 
 		 326 aa  43.1  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3743  luciferase family protein  26.64 
 
 		 318 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3804  luciferase family protein  26.64 
 
 		 318 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0754765 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3731  luciferase-like protein  26.64 
 
 		 318 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2778  Luciferase-like monooxygenase  36.71 
 
 		 317 aa  43.1  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00690  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  27.99 
 
 		 331 aa  42.4  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.889784  normal  0.0731127 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>