20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3645 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3645  hypothetical protein  100 
 
 
275 aa  546  1e-154  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0322  putative DNA-binding protein  32.16 
 
 
290 aa  100  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300719  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0419  putative DNA-binding protein  30.98 
 
 
286 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.327919 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10296  hypothetical protein  29.37 
 
 
295 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000550077  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0366  putative DNA-binding protein  31.28 
 
 
314 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0378  putative DNA-binding protein  30.77 
 
 
314 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0387  putative DNA-binding protein  30.77 
 
 
314 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.609186 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13901  hypothetical protein  28.83 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0775  hypothetical protein  27.17 
 
 
308 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5969  putative DNA-binding protein  26.7 
 
 
276 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.977885  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5566  putative DNA-binding protein  26.7 
 
 
276 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.777934  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5539  hypothetical protein  27.65 
 
 
280 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.147784 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0070  hypothetical protein  23.92 
 
 
283 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0604808 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0052  hypothetical protein  25.23 
 
 
282 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0077164 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0071  hypothetical protein  25.23 
 
 
282 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0926033  normal  0.0816672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0062  hypothetical protein  25.23 
 
 
282 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6402  hypothetical protein  24.35 
 
 
268 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.577893  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3371  hypothetical protein  29.41 
 
 
241 aa  45.8  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11825  hypothetical protein  24.06 
 
 
300 aa  44.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.14861  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1531  hypothetical protein  27.81 
 
 
254 aa  42  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>