More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3604 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3604  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 409 aa  820    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.289297  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1357  oxidoreductase domain protein  70.65 
 
 		 393 aa  521  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5196  oxidoreductase domain protein  67.11 
 
 		 388 aa  493  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2773  oxidoreductase domain protein  62.04 
 
 		 391 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1729  oxidoreductase-like protein  47.23 
 
 		 396 aa  342  8e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0833766  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  42.27 
 
 		 394 aa  295  7e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  35.77 
 
 		 378 aa  232  8.000000000000001e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  36.34 
 
 		 376 aa  221  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  35.42 
 
 		 377 aa  219  7e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  35.68 
 
 		 377 aa  218  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  35 
 
 		 396 aa  218  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  36.05 
 
 		 388 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  34.56 
 
 		 388 aa  216  7e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1911  oxidoreductase domain-containing protein  36.72 
 
 		 390 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  34.29 
 
 		 377 aa  211  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  33.94 
 
 		 390 aa  211  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.11 
 
 		 377 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  34.11 
 
 		 377 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1871  hypothetical protein  34.11 
 
 		 377 aa  208  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529235 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  36.01 
 
 		 387 aa  199  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2827  oxidoreductase domain-containing protein  37.17 
 
 		 373 aa  196  4.0000000000000005e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  34.7 
 
 		 382 aa  196  4.0000000000000005e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  34.81 
 
 		 371 aa  197  4.0000000000000005e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  36.58 
 
 		 369 aa  196  5.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2763  oxidoreductase domain protein  35.82 
 
 		 395 aa  196  6e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403107  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  30.87 
 
 		 371 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  30.61 
 
 		 371 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  32.63 
 
 		 376 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  32.2 
 
 		 380 aa  194  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  33.16 
 
 		 376 aa  193  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  33.25 
 
 		 371 aa  192  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  33.25 
 
 		 386 aa  192  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  35.49 
 
 		 387 aa  190  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  32.99 
 
 		 371 aa  189  5.999999999999999e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  33.59 
 
 		 385 aa  188  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  32.24 
 
 		 382 aa  187  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  31.2 
 
 		 393 aa  186  4e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  32.65 
 
 		 378 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  32.46 
 
 		 376 aa  185  1.0000000000000001e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  36.84 
 
 		 373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  36.99 
 
 		 386 aa  184  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  38.31 
 
 		 387 aa  181  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2881  oxidoreductase domain-containing protein  37.28 
 
 		 388 aa  182  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  31.94 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  32.13 
 
 		 387 aa  179  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0250  oxidoreductase domain protein  36.96 
 
 		 403 aa  176  5e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0390  oxidoreductase domain protein  34.86 
 
 		 397 aa  175  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  decreased coverage  0.00594685 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  33.15 
 
 		 359 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4326  oxidoreductase domain protein  36.2 
 
 		 413 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0117  oxidoreductase domain protein  33.07 
 
 		 398 aa  171  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  34.81 
 
 		 378 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1488  oxidoreductase domain protein  29.64 
 
 		 389 aa  169  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.927102 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  32.89 
 
 		 378 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  32.04 
 
 		 382 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4617  oxidoreductase domain protein  37.46 
 
 		 397 aa  167  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3848  oxidoreductase domain protein  39.02 
 
 		 387 aa  166  5e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  32.64 
 
 		 419 aa  166  5.9999999999999996e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1680  oxidoreductase domain-containing protein  36.75 
 
 		 372 aa  166  6.9999999999999995e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.507228 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  34.58 
 
 		 369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3430  oxidoreductase  30.26 
 
 		 359 aa  162  8.000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1384  oxidoreductase domain protein  29.9 
 
 		 389 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000847261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1619  oxidoreductase domain protein  32.56 
 
 		 377 aa  159  8e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.699315 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3682  oxidoreductase domain-containing protein  36.18 
 
 		 418 aa  157  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.595723  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  32.05 
 
 		 386 aa  157  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1270  oxidoreductase domain protein  32.75 
 
 		 372 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.722291 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  29.01 
 
 		 384 aa  155  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  35.84 
 
 		 379 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0572  oxidoreductase domain-containing protein  34.74 
 
 		 398 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3347  oxidoreductase-like  32.59 
 
 		 367 aa  150  6e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0144127  normal  0.198218 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1354  oxidoreductase domain protein  35.43 
 
 		 398 aa  149  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.189914  normal  0.772434 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1811  oxidoreductase domain-containing protein  35.03 
 
 		 392 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.483948 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  34 
 
 		 382 aa  147  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0087  oxidoreductase domain-containing protein  32.35 
 
 		 397 aa  146  8.000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1421  oxidoreductase-like  31.14 
 
 		 367 aa  145  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8256  hypothetical protein  31.95 
 
 		 409 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0185065 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  26.99 
 
 		 385 aa  142  9e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10530  predicted dehydrogenase  31.25 
 
 		 396 aa  142  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 382 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2398  oxidoreductase domain protein  34.58 
 
 		 398 aa  140  6e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1190  oxidoreductase domain protein  31.91 
 
 		 389 aa  139  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.103704  normal  0.518496 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  29.43 
 
 		 386 aa  137  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  27.96 
 
 		 381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0068  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 		 409 aa  134  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0978  oxidoreductase domain-containing protein  24.21 
 
 		 378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  26.74 
 
 		 381 aa  127  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  32.29 
 
 		 374 aa  126  7e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  28.87 
 
 		 384 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  30.18 
 
 		 366 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  26.06 
 
 		 374 aa  120  3.9999999999999996e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  26.57 
 
 		 380 aa  120  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  29.43 
 
 		 383 aa  119  7.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  26.8 
 
 		 383 aa  119  7.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1260  oxidoreductase domain-containing protein  31.29 
 
 		 372 aa  119  9e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.140047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  27.65 
 
 		 364 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  27.6 
 
 		 373 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  27.81 
 
 		 384 aa  117  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  29.36 
 
 		 390 aa  116  6e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0507  oxidoreductase domain-containing protein  28.98 
 
 		 371 aa  116  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09791  putative oxidoreductase  25 
 
 		 373 aa  114  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.678537  normal  0.0468377 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  27.66 
 
 		 370 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>