104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3585 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3585  NUDIX hydrolase  100 
 
 
162 aa  330  7e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00428581  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1098  NUDIX hydrolase  55.63 
 
 
155 aa  166  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448476  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2044  NUDIX hydrolase  52.98 
 
 
160 aa  159  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5859  NUDIX hydrolase  51.33 
 
 
153 aa  156  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315919  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4431  NUDIX hydrolase  49.68 
 
 
164 aa  155  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0113  NUDIX hydrolase  57.52 
 
 
165 aa  155  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4521  NUDIX hydrolase  57.14 
 
 
156 aa  153  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.506364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7253  NUDIX hydrolase  51.66 
 
 
160 aa  153  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13765  hypothetical protein  50.68 
 
 
166 aa  153  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.983203 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5357  NUDIX hydrolase  53.64 
 
 
154 aa  150  6e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.737057 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3182  NUDIX hydrolase  53.29 
 
 
163 aa  148  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.565463  normal  0.196576 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3428  NUDIX hydrolase  50.99 
 
 
163 aa  149  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2879  NUDIX hydrolase  52.32 
 
 
157 aa  147  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2909  NUDIX hydrolase  52.32 
 
 
157 aa  147  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188033  normal  0.899663 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2923  NUDIX hydrolase  52.32 
 
 
157 aa  147  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.928534  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0645  NUDIX hydrolase  53.42 
 
 
155 aa  147  8e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2570  hypothetical protein  48 
 
 
172 aa  147  8e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00072063  normal  0.0208228 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1987  NUDIX hydrolase  52.41 
 
 
155 aa  146  1e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2817  NUDIX hydrolase  50 
 
 
152 aa  146  2e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0671  NUDIX hydrolase  51.01 
 
 
153 aa  144  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.616571  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16970  predicted NTP pyrophosphohydrolase  51.02 
 
 
154 aa  144  4e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.542075  normal  0.366756 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5719  NUDIX hydrolase  51.35 
 
 
154 aa  143  8e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0645  hypothetical protein  53.33 
 
 
154 aa  142  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0358  NUDIX hydrolase  50.63 
 
 
162 aa  141  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4185  NUDIX hydrolase  45.03 
 
 
154 aa  140  7e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3569  NUDIX hydrolase  49.35 
 
 
163 aa  140  7e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2262  NUDIX hydrolase  50.34 
 
 
155 aa  138  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.997578  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0064  NUDIX hydrolase  48.5 
 
 
168 aa  137  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2646  NUDIX hydrolase  51.33 
 
 
155 aa  135  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3663  NUDIX hydrolase  53.9 
 
 
154 aa  135  3e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3404  NUDIX hydrolase  48 
 
 
174 aa  127  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0230  NUDIX hydrolase  49.08 
 
 
166 aa  127  6e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1389  NUDIX hydrolase  45.68 
 
 
324 aa  126  2e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.524565  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2993  NUDIX hydrolase  52.41 
 
 
154 aa  123  9e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2455  NUDIX hydrolase  42.76 
 
 
162 aa  116  2e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.610267 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0649  NUDIX hydrolase  45.32 
 
 
154 aa  115  2e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  36.72 
 
 
160 aa  63.9  9e-10  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  35.43 
 
 
160 aa  63.5  1e-09  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  35.43 
 
 
160 aa  63.5  1e-09  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0747  hypothetical protein  35.94 
 
 
153 aa  62  3e-09  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  35.43 
 
 
160 aa  61.6  5e-09  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  35.43 
 
 
157 aa  61.6  5e-09  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  35.43 
 
 
160 aa  61.6  5e-09  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  35.43 
 
 
160 aa  61.6  5e-09  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 
156 aa  60.8  7e-09  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  34.38 
 
 
158 aa  59.7  2e-08  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 
156 aa  59.3  2e-08  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4548  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 
156 aa  58.9  3e-08  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0697  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 
153 aa  56.6  2e-07  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405136  normal  0.276525 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0922  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 
156 aa  55.1  4e-07  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1404  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 
157 aa  55.1  4e-07  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567181  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1382  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 
156 aa  53.5  1e-06  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.162154 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1305  NUDIX family hydrolase  34.09 
 
 
149 aa  52.8  2e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0763  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
153 aa  52.4  3e-06  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0534462 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 
167 aa  52  3e-06  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2830  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 
149 aa  52  4e-06  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282197  normal  0.0206964 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
152 aa  49.7  2e-05  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5641  NUDIX hydrolase  29.32 
 
 
146 aa  47.4  8e-05  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0969  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 
158 aa  47  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.767014  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 
324 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  40.74 
 
 
146 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2132  NUDIX hydrolase  27.5 
 
 
162 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  28.99 
 
 
302 aa  45.1  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 
296 aa  44.7  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  3.96101e-08 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  30 
 
 
336 aa  44.7  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  31.34 
 
 
308 aa  43.9  0.0009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  31.03 
 
 
305 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 
311 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 
311 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 
311 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  36.54 
 
 
289 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  49.18 
 
 
164 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2492  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2595  NUDIX hydrolase  40 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 
341 aa  42.4  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  46.67 
 
 
148 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0515  ADP-ribose pyrophosphatase  44.44 
 
 
168 aa  41.6  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0455  NUDIX hydrolase  29.13 
 
 
171 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2534  NUDIX hydrolase  50 
 
 
153 aa  42  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  32.88 
 
 
326 aa  41.6  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  37.5 
 
 
229 aa  42  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  2.76659e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  45 
 
 
343 aa  41.6  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  41.07 
 
 
128 aa  41.6  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  42.5 
 
 
144 aa  41.6  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1257  NUDIX hydrolase  29.55 
 
 
146 aa  41.6  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 
139 aa  41.2  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  37.97 
 
 
149 aa  41.2  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  40.62 
 
 
153 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3268  MutT/nudix family protein  52.78 
 
 
132 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  40.62 
 
 
153 aa  41.2  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.00422e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2564  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
173 aa  41.2  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  3.03675e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  30.26 
 
 
322 aa  41.2  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  51.28 
 
 
156 aa  40.8  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5262  NUDIX hydrolase  41.82 
 
 
240 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 
140 aa  41.2  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5351  NUDIX hydrolase  41.82 
 
 
239 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5641  NUDIX hydrolase  41.82 
 
 
239 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1094  phosphohydrolase (MutT/nudix family protein)  31.94 
 
 
260 aa  41.2  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.10735  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2686  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 
182 aa  40.8  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
139 aa  40.8  0.008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>