132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3572 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3572  protein of unknown function DUF470  100 
 
 		 346 aa  712    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4813  protein of unknown function DUF470  55.18 
 
 		 723 aa  360  1e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4377  hypothetical protein  47.43 
 
 		 905 aa  294  2e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.947401  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3394  protein of unknown function DUF470  46.25 
 
 		 850 aa  288  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4568  protein of unknown function DUF470  43.54 
 
 		 839 aa  279  6e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2601  hypothetical protein  43.33 
 
 		 877 aa  266  5e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00218331  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2334  protein of unknown function DUF470  43.79 
 
 		 844 aa  253  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1037  hypothetical protein  38.3 
 
 		 852 aa  249  4e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1364  hypothetical protein  40.47 
 
 		 857 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3199  hypothetical protein  25.86 
 
 		 556 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00757676 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  28.08 
 
 		 1118 aa  122  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1005  protein of unknown function DUF470  23.68 
 
 		 556 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0976  protein of unknown function DUF470  23.68 
 
 		 556 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2319  lysyl-tRNA synthetase  26.1 
 
 		 1132 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1845  FmtC domain-containing protein  24.32 
 
 		 395 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000138078  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2930  protein of unknown function DUF470  29.33 
 
 		 854 aa  108  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.58792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3825  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  22.43 
 
 		 859 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000241179 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1520  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  22.43 
 
 		 859 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1564  hypothetical protein  24.32 
 
 		 569 aa  106  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.201819  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1213  hypothetical protein  28.21 
 
 		 863 aa  105  8e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1189  hypothetical protein  22.74 
 
 		 858 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1388  hypothetical protein  22.43 
 
 		 861 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1243  hypothetical protein  29.04 
 
 		 863 aa  103  4e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0824  hypothetical protein  22.26 
 
 		 568 aa  103  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.896168  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1590  virulence factor MprF  21.81 
 
 		 861 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0815094  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1375  virulence factor MprF  21.81 
 
 		 861 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1348  hypothetical protein  21.81 
 
 		 861 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1347  hypothetical protein  21.81 
 
 		 861 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1486  virulence factor MprF  21.81 
 
 		 861 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.272411  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1558  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  21.81 
 
 		 861 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000388659 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1626  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  21.5 
 
 		 861 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01770  oxacillin resistance-associated protein fmtc  26.91 
 
 		 854 aa  100  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61685  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2131  hypothetical protein  24.27 
 
 		 847 aa  99.8  6e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1456  hypothetical protein  22.98 
 
 		 851 aa  99.8  7e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.291506  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1258  hypothetical protein  22.65 
 
 		 851 aa  98.6  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0075337  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2438  protein of unknown function DUF470  21.95 
 
 		 862 aa  94.7  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1489  protein of unknown function DUF470  22.15 
 
 		 861 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0644  protein of unknown function DUF470  26.26 
 
 		 850 aa  94  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166613  hitchhiker  0.000476142 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0379  lysyl-tRNA synthetase (class II)  22.87 
 
 		 844 aa  93.2  6e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.646345  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  25.68 
 
 		 1113 aa  90.1  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4539  hypothetical protein  26.12 
 
 		 896 aa  89  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.530229 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1235  lysyl-tRNA synthetase (class II)  23.05 
 
 		 851 aa  88.6  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1522  hypothetical protein  21.59 
 
 		 861 aa  88.6  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1219  hypothetical protein  22.02 
 
 		 917 aa  85.9  8e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.316039  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4555  hypothetical protein  23.89 
 
 		 346 aa  83.2  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3646  hypothetical protein  24.23 
 
 		 872 aa  83.2  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0906  lysyl-tRNA synthetase  25.78 
 
 		 1094 aa  82.8  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0550  hypothetical protein  24.91 
 
 		 880 aa  82.8  0.000000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000522518  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0585  hypothetical protein  24.83 
 
 		 880 aa  82.4  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.351317  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1737  lysyl-tRNA synthetase  25.15 
 
 		 1120 aa  82.4  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1194  hypothetical protein  23.86 
 
 		 879 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.685135  normal  0.0802635 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5951  hypothetical protein  25.64 
 
 		 869 aa  81.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4106  protein of unknown function DUF470  24.09 
 
 		 877 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.628735 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3993  protein of unknown function DUF470  24.09 
 
 		 877 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6803  protein of unknown function DUF470  24.47 
 
 		 592 aa  80.9  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1066  protein of unknown function DUF470  21.16 
 
 		 590 aa  81.3  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0261019  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  28.76 
 
 		 872 aa  80.1  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4216  hypothetical protein  24.56 
 
 		 880 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1421  hypothetical protein  20.63 
 
 		 840 aa  79.7  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0726685  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1449  hypothetical protein  20.63 
 
 		 840 aa  79.7  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00038982  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52350  hypothetical protein  24.56 
 
 		 881 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.890769 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11780  lysyl-tRNA synthetase (class II)  25.91 
 
 		 1147 aa  78.6  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3544  lysyl-tRNA synthetase  23.05 
 
 		 1101 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2476  protein of unknown function DUF470  22.56 
 
 		 578 aa  78.6  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3330  lysyl-tRNA synthetase  23.68 
 
 		 1100 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27282  normal  0.711465 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11657  lysyl-tRNA synthetase  22.74 
 
 		 1172 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.73947 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1202  hypothetical protein  23.81 
 
 		 880 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4591  hypothetical protein  24.21 
 
 		 881 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3190  hypothetical protein  21.12 
 
 		 875 aa  77  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1231  hypothetical protein  23.81 
 
 		 880 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0755535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2725  hypothetical protein  26.04 
 
 		 855 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04799  hypothetical protein  24.64 
 
 		 883 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0255937 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2998  lysyl-tRNA synthetase  23.26 
 
 		 1111 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.604901  normal  0.107077 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3226  protein of unknown function DUF470  23.4 
 
 		 867 aa  76.3  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3961  Protein regulated by acid pH  25.64 
 
 		 870 aa  76.3  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1597  hypothetical protein  25.35 
 
 		 877 aa  76.3  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1475  hypothetical protein  22.4 
 
 		 850 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.567946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1534  hypothetical protein  22.4 
 
 		 850 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000274946 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2983  lysyl-tRNA synthetase  22.89 
 
 		 1112 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8424  protein of unknown function DUF470  23.65 
 
 		 701 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3027  lysyl-tRNA synthetase  22.89 
 
 		 1112 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1140  hypothetical protein  22.6 
 
 		 429 aa  75.1  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4013  hypothetical protein  22.71 
 
 		 880 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.144886 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18850  hypothetical protein  25 
 
 		 876 aa  75.1  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11879  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0930  fmtC protein  21.15 
 
 		 840 aa  74.3  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0064  lysyl-tRNA synthetase  24.38 
 
 		 1100 aa  74.3  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.9544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1562  putative transmembrane protein  25.62 
 
 		 866 aa  74.3  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2661  Lysyl-tRNA synthetase (class II)-like protein  23.17 
 
 		 1098 aa  73.2  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0688281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0378  protein of unknown function DUF470  24.68 
 
 		 938 aa  72.8  0.000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.173445  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3991  hypothetical protein  22.18 
 
 		 880 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3161  hypothetical protein  23.72 
 
 		 871 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1396  hypothetical protein  21.98 
 
 		 880 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3898  hypothetical protein  23.72 
 
 		 871 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129662  normal  0.427904 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3521  protein of unknown function DUF470  22.7 
 
 		 867 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0528845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5764  hypothetical protein  24.75 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1540  hypothetical protein  21.77 
 
 		 850 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396987 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0127  lysyl-tRNA synthetase  23.45 
 
 		 1138 aa  70.1  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7583  protein of unknown function DUF470  24.92 
 
 		 597 aa  70.5  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.389483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2257  hypothetical protein  23.21 
 
 		 864 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.546481  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0534  protein of unknown function DUF472  26.98 
 
 		 454 aa  69.7  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>