More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3549 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3549  beta-lactamase  100 
 
 		 400 aa  818    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2901  beta-lactamase  69.92 
 
 		 760 aa  568  1e-161  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.453349  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3905  beta-lactamase  64.5 
 
 		 397 aa  501  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0089  beta-lactamase  60.05 
 
 		 401 aa  468  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2284  hypothetical protein  61.36 
 
 		 395 aa  464  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2104  beta-lactamase  57.07 
 
 		 396 aa  450  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1441  putative 1,4-butanediol diacrylate esterase  52.31 
 
 		 395 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00263583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2728  beta-lactamase  50.65 
 
 		 387 aa  371  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.144324 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  50.13 
 
 		 395 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0463  beta-lactamase  50.13 
 
 		 395 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2556  beta-lactamase  53.07 
 
 		 395 aa  355  8.999999999999999e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2777  beta-lactamase  53.91 
 
 		 389 aa  353  2.9999999999999997e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0394  putative 1,4-butanediol diacrylate esterase  48.53 
 
 		 397 aa  348  1e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6049  Beta-lactamase  46.35 
 
 		 419 aa  345  7e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0253  beta-lactamase  45.85 
 
 		 395 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  43.93 
 
 		 395 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0035  putative beta-lactamase  47.61 
 
 		 397 aa  323  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6425  beta-lactamase  43.92 
 
 		 437 aa  309  5e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3473  beta-lactamase  45.45 
 
 		 392 aa  295  7e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.407682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1072  beta-lactamase  42.19 
 
 		 410 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.22387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88817  1,4-butanediol diacrylate esterase  39.85 
 
 		 418 aa  261  2e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.642668 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_44235  predicted protein  36.73 
 
 		 397 aa  253  5.000000000000001e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3462  beta-lactamase  40.2 
 
 		 406 aa  252  9.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00219099  normal  0.0121501 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05422  beta-lactamase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07500)  35.1 
 
 		 415 aa  206  8e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.300599  normal  0.931508 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  31.71 
 
 		 419 aa  169  6e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5281  beta-lactamase  30.42 
 
 		 408 aa  167  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1692  Beta-lactamase  34.88 
 
 		 414 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2708  Beta-lactamase  38.25 
 
 		 436 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259785  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2750  beta-lactamase  38.26 
 
 		 437 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3149  beta-lactamase  33.05 
 
 		 430 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  32.95 
 
 		 402 aa  157  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  30.21 
 
 		 430 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3485  beta-lactamase  36.16 
 
 		 440 aa  156  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.807296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1745  beta-lactamase  31.39 
 
 		 454 aa  156  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2371  beta-lactamase  31.62 
 
 		 370 aa  156  6e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  33.59 
 
 		 407 aa  156  7e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  33.72 
 
 		 414 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  31.48 
 
 		 431 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2480  beta-lactamase  29.52 
 
 		 411 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  30.51 
 
 		 426 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  28.77 
 
 		 447 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0866  beta-lactamase  28.79 
 
 		 382 aa  152  8.999999999999999e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2359  beta-lactamase  28.72 
 
 		 411 aa  151  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  30.25 
 
 		 409 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  29.65 
 
 		 406 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  32.25 
 
 		 424 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09049  transesterase (LovD), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G00920)  30.85 
 
 		 396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3066  beta-lactamase  30.56 
 
 		 438 aa  148  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  29.38 
 
 		 445 aa  147  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  29.01 
 
 		 433 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3704  beta-lactamase  29.13 
 
 		 407 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136974  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2525  beta-lactamase  28.09 
 
 		 377 aa  145  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  31.45 
 
 		 405 aa  145  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  31.87 
 
 		 426 aa  145  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  29.47 
 
 		 414 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  30.93 
 
 		 405 aa  145  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2265  beta-lactamase  29.22 
 
 		 407 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6918  putative penicillin binding protein  31.62 
 
 		 422 aa  145  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1601  beta-lactamase  32.21 
 
 		 444 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  34.28 
 
 		 613 aa  144  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3205  beta-lactamase  28.57 
 
 		 407 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1896  beta-lactamase  31.5 
 
 		 425 aa  143  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  30.68 
 
 		 408 aa  143  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1560  beta-lactamase  32.43 
 
 		 412 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  30.03 
 
 		 417 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  30.88 
 
 		 405 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  30.46 
 
 		 418 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  30.62 
 
 		 420 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  29.74 
 
 		 422 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5786  beta-lactamase family protein  30 
 
 		 420 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  30.81 
 
 		 420 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  29.23 
 
 		 417 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  29.59 
 
 		 407 aa  136  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0870  beta-lactamase  30.16 
 
 		 410 aa  135  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.487192  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  30 
 
 		 423 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4820  beta-lactamase  30.32 
 
 		 420 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3743  beta-lactamase  30.32 
 
 		 420 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5097  beta-lactamase family penicillin binding protein  27.15 
 
 		 411 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3749  beta-lactamase  33.92 
 
 		 401 aa  133  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0280744 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11398  hypothetical protein  33.67 
 
 		 401 aa  133  6e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2694  beta-lactamase  28.06 
 
 		 453 aa  133  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2288  beta-lactamase  28.39 
 
 		 424 aa  133  6.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1842  beta-lactamase  29.6 
 
 		 418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.794756  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0582  beta-lactamase  28.94 
 
 		 431 aa  131  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  35.29 
 
 		 427 aa  130  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  27.05 
 
 		 424 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2361  beta-lactamase  33.45 
 
 		 401 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2408  beta-lactamase  33.45 
 
 		 401 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234051  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2402  beta-lactamase  33.45 
 
 		 401 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  28.18 
 
 		 424 aa  126  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2265  twin-arginine translocation pathway signal  28.72 
 
 		 428 aa  125  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1214  beta-lactamase  30.31 
 
 		 435 aa  125  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2658  beta-lactamase  31.4 
 
 		 401 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0454  beta-lactamase  28.75 
 
 		 409 aa  123  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.174652 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3069  beta-lactamase  30.08 
 
 		 400 aa  120  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.489639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0961  twin-arginine translocation pathway signal  29.36 
 
 		 431 aa  120  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.205968  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  28.9 
 
 		 440 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  26.87 
 
 		 427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0590  beta-lactamase  29.19 
 
 		 452 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0570  beta-lactamase  27.81 
 
 		 438 aa  117  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>